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基于遍历基因组合的特征基因选取方法
引用本文:李杰.基于遍历基因组合的特征基因选取方法[J].大理学院学报,2015(6).
作者姓名:李杰
作者单位:大理学院数学与计算机学院,云南大理,671003
基金项目:云南省科技厅青年基金资助项目(2013FD037);大理学院青年教师科研基金资助项目
摘    要:特征基因的选取是非常热门的问题,在癌症是由某个或者某几个基因共同相互作用引起变异的假设下,从最简单的2个基因组合进行研究,遍历所有可能的基因组合,运用Logistic回归分类器,以预测精度和AIC准则为评价标准,对所有的模拟结果进行评价,得到最优基因组合(X55187,D14812)。同时运用交叉留一检验,验证了此基因组合建立模型的稳定性。最后又对预测精度大于90%的640对基因组合进行频数分析,并与已有文献进行比较,得到出现频率高的基因组合,预测精度并不一定高的结论。

关 键 词:结肠癌  特征基因  Logistic回归  遍历

A Feature Gene Selection Method Based on Traversal Gene Combination
Li Jie.A Feature Gene Selection Method Based on Traversal Gene Combination[J].Journal of Dali University,2015(6).
Authors:Li Jie
Abstract:
Keywords:colon cancer  feature genes  Logistic regression  traversal
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