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蛋白质二级结构中同义密码子与氨基酸上下文关联的偏好型
引用本文:
胡秀珍,肖奕.蛋白质二级结构中同义密码子与氨基酸上下文关联的偏好型[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2003,34(6):636-640.
作者姓名:
胡秀珍
肖奕
作者单位:
1. 内蒙古大学物理学系,呼和浩特,010021;华中科技大学物理系,武汉,430074
2. 华中科技大学物理系,武汉,430074
基金项目:
内蒙古自然科学基金(20001301)和校基金资助项目
摘 要:
通过对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(E.coli)的87个蛋白质的统计分析,发现mRNA序列中的同义密码子与氨基酸的上下文关联是和蛋白质二级结构有关的,并给出了各二级结构中有意义的上下文关联型.讨论了该结果对蛋白质结构预测的改进意义及其在基因工程领域可能的应用。
关 键 词:
蛋白质二级结构
同义密码子
统计关联
氨基酸序列
mRNA序列
文章编号:
1000-1638(2003)06-0636-05
修稿时间:
2002年7月9日
Preference Context of Synonymous Codon and Amino Acid in the Protein Secondary Structure
Abstract:
Keywords:
secondary structure of protein
synonymous codon
statistical correlation
amino acid sequence
mRNA sequence
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