一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法 |
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引用本文: | 沈金城,张松,孙之荣.一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法[J].科学通报,2007,52(13):1536-1541. |
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作者姓名: | 沈金城 张松 孙之荣 |
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作者单位: | 清华大学生物科学与技术系,教育部生物信息学重点实验室,北京100084 |
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摘 要: | 亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关. 本研究提出了一种新的编码方式, 试图根据那些与亚细胞定位相关的蛋白质分子功能信息, 结合氨基酸二肽组成以提高亚细胞定位预测的性能. 结果显示, 在使用支持向量机和RH数据集的测试中, 该方法的预测精度有了显著的提高, 同时对于蛋白质序列N端的不准确性也具有一定的鲁棒性.
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关 键 词: | 亚细胞定位 GO分子功能 氨基酸对组成 支持向量机
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收稿时间: | 2007-03-01 |
修稿时间: | 2007-03-012007-05-24 |
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