| 拟南芥基因倍增及基因流失分析 |
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| 引用本文： | 李鸿健 谭军. 拟南芥基因倍增及基因流失分析[J]. 重庆邮电学院学报(自然科学版), 2006, 18(4): 548-552 |
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| 作者姓名： | 李鸿健 谭军 |
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| 作者单位： | 重庆邮电大学生物信息实验室,重庆400065 |
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| 基金项目： | 重庆市科委自然科学基金项目（2005BB5053） |
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| 摘 要： | 基因倍增指基因组中含有基因的DNA片段复制出一个或更多拷贝的过程,是进化出新物种的主要原因。采用新的数据和方法研究拟南芥基因组的基因倍增过程,通过分析串联基因倍增和大规模基因倍增的存在比例和同义置换率分布,并估计大规模倍增后基因流失的比例,揭示了拟南芥基因组一次非常明显的全基因组倍增,采用科学的方法估计这次倍增发生在约8000万年前。比较该结果与之前的研究,提出了一种解释拟南芥基因倍增过程更合理的模型。
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| 关 键 词： | 拟南芥 基因倍增 同义置换率 基因流失 |
| 文章编号： | 1004-5694（2006）04-0548-05 |
| 收稿时间： | 2005-10-17 |
| 修稿时间： | 2006-06-12 |
Analysis of gene duplication and gene loss in Arabidopsis genome |
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| LI Hong-jian, TAN Jun. Analysis of gene duplication and gene loss in Arabidopsis genome[J]. Journal of Chongqing University of Posts and Telecommunications(Natural Sciences Edition), 2006, 18(4): 548-552 |
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| Authors: | LI Hong-jian TAN Jun |
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| Affiliation: | Laboratory of Bioin formatics, Chongqing University of Posts and Telecommunications, Chongqing 400065, P. R. China |
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| Abstract: | Gene duplication is defined as segment of DNA duplicate one or more copies, it is believed to be a major mechanism for the generation of evolutionary novelty. Based on new materials and methods,this paper analyses the tandem and segmental duplication,then estimates the num of the lost gene after gene duplication in the Arabidopsis gene family,and we find an evidence for the whole genome duplication in Arabidopsis which happened about 80 million years ago. This paper suggests a new model to explain the process of gene duplication in Arabidopsis. |
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| Keywords: | arabidopsis gene duplication synonymous substitutions rate(Ks) gene loss |
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