| 榛子SBP基因家族鉴定及其系统进化和表达分析 |
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| 引用本文： | 张兴政,朱凯丽,程云清.榛子SBP基因家族鉴定及其系统进化和表达分析[J].吉林师范大学学报（自然科学版）,2020,41(1). |
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| 作者姓名： | 张兴政 朱凯丽 程云清 |
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| 作者单位： | 吉林师范大学 生命科学学院,吉林 四平136000;吉林师范大学 生命科学学院,吉林 四平136000;吉林师范大学 生命科学学院,吉林 四平136000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | SBP蛋白是植物所特有的一类转录因子,并广泛存在于植物中.研究发现,该基因家族成员参与响应包括植物生长、发育和抗逆等生物学过程,其功能研究具有重要意义.榛子是一种主要以果实为产品的重要经济林木,且该物种SBP基因家族的研究也未见报道.本研究以生物信息学手段为基础,结合转录组数据,从中筛选得到10个榛子SBP-like基因(SPL基因),并对其编码蛋白理化性质、保守区域和模体进行预测和分析,进而对基因家族进化关系和花发育不同时期表达水平进行了分析.结果表明:榛子的10个SPL基因可以分为5个大组群;均含有该基因家族所特有的C3H和C2CH结构域以及一个核定位信号;同时,基于花发育不同时期的转录组数据分析,部分成员在不同时期表达水平存在显著差异,预示该基因可能与花果发育有关.该研究将有助于榛子SPL基因参与其花果发育分子调控机制的深入研究.
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| 关 键 词： | 榛子 SBP基因家族 基因鉴定 系统进化 表达分析 |
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