| 白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析 |
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| 引用本文： | 董京祥,任丽,张园,杨洋,黄海娇,李慧玉.白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析[J].南京林业大学学报(自然科学版),2018,61(4):113. |
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| 作者姓名： | 董京祥 任丽 张园 杨洋 黄海娇 李慧玉 |
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| 作者单位： | 东北林业大学林学院,黑龙江 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | 基金项目:国家重点研发计划(2017YFD0600603)
第一作者:董京祥(dongjingxiang0519@163.com)。*通信作者:李慧玉(lihuiyu2017@1263com),教授。 |
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| 摘 要： | 【目的】通过研究白桦TCP转录因子的序列特征及其在不同时期组织中的表达规律,为揭示BpTCPs 在白桦生长发育中的作用提供证据。【方法】依据白桦45个转录组测序结果,共获得 15 条TCPs 基因。利用生物信息学方法对TCPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织中的表达模式。【结果】生物信息学分析发现,15 条 BpTCPs均含有 1 个高度保守的bHLH结构域,系统进化分析发现 15条白桦TCP分属于TCP 蛋白的两大类; qRT-PCR分析结果显示,自5月到 9月的生长阶段中,顶芽中 BpTCPs 的表达水平呈现不同程度升高的变化趋势; 茎中BpTCP3在整个生长季上调表达; BpTCP4、BpTCP10及BpTCP7、BpTCP8分别在越冬后的雌花及雄花中上调表达。【结论】明确了BpTCPs基因的功能及揭示其参与调控植物生长的分子机制奠定基础。
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Bioinformatics and expression analysis of BpTCPs in Betula platyphylla Suk. |
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