| 竹叶花椒TPS基因家族全基因组分析 |
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| 引用本文： | 任妙珍,董凯麟,张剑,陈之端,苏俊霞.竹叶花椒TPS基因家族全基因组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2022,59(4):046001-169. |
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| 作者姓名： | 任妙珍 董凯麟 张剑 陈之端 苏俊霞 |
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| 作者单位： | 山西师范大学 生命科学学院；中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,山西师范大学 生命科学学院；中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31300180, 42071067) |
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| 摘 要： | 为了探究香料植物TPS基因家族的潜在功能，本研究以香料植物竹叶花椒(Zanthoxylum armatum DC.)为材料，利用生物信息学方法对其萜类合成酶基因家族的理化性质、基因重复类型、亚细胞定位、进化关系、染色体定位与共线性、基因结构和基因表达进行了系统地分析.我们在竹叶花椒全基因组中共鉴定到53个TPS基因家族成员，它们编码蛋白氨基酸长度为173～859 aa,分子量为20.21～98.44 kDa,等电点范围在4.87～9.10,主要定位于细胞质和叶绿体当中.进化分析显示，ZaTPSs可以划分为6个亚家族，TPS-a和TPS-b亚家族的成员最多.其中48个成员都包含TPS家族的保守基序motif1.染色体定位与共线性分析显示，53个成员在11条染色体上不均匀分布，存在4处串联重复，共线性分析证明竹叶花椒与其同科物种甜橙Citrus sinensis(L.) Osbeck]的TPS基因有更近的基因进化关系.基因表达差异分析显示，ZaTPSs有一定的组织表达特异性，在幼花中表达量最高，其次是果皮.这些研究结果表明TPS基因家族在竹叶花椒果皮挥发油的合成和防御等方面发挥了重要作用...
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| 关 键 词： | 竹叶花椒 萜类合成酶 基因家族 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021/11/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/3/2 0:00:00 |
Genome-wide analysis of TPS gene family of Zanthoxylum armatum |
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| REN Miao-Zhen,DONG Kai-Lin,ZHANG Jian,CHEN Zhi-Duan,SU Jun-Xia.Genome-wide analysis of TPS gene family of Zanthoxylum armatum[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2022,59(4):046001-169. |
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| Authors: | REN Miao-Zhen DONG Kai-Lin ZHANG Jian CHEN Zhi-Duan SU Jun-Xia |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Zanthoxylum armatum Terpene synthase Gene family Bioinformatics |
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