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果蝇胚胎不同表达水平基因内含子序列特征的比较分析
作者姓名:陈丹李慧敏  张静  梁振霞
作者单位:1.云南大学 数学与统计学院,云南 昆明 650091;2.云南民族大学 数学与计算机科学学院,云南 昆明 650031
基金项目:云南省教育厅科学研究基金(2012Y497);云南大学校级科学研究基金(2012CG016).
摘    要:对果蝇胚胎低表达和高表达水平基因内含子的序列结构进行分析,发现2种表达水平的基因内含子序列特征有明显差异.高表达基因的内含子一般比低表达基因的长,其中高表达基因第1内含子的平均长度是低表达基因的2.62倍,第2内含子的平均长度是低表达基因的1.79倍.两类基因第1内含子中的CpG岛含量最高,并且高表达基因内含子中CpG岛含量要高于低表达基因.此外,与低表达基因相比,TATA box、CAAT box和GC box在高表达基因内含子中出现的频数明显要高些,尤其是在第1内含子中.作者还提取出果蝇胚胎2种表达水平基因第1内含子中高频出现的6-mer简单重复序列,发现一些重复序列与实验得到的转录因子结合位点相符合.这些结果提示内含子特别是第1内含子有可能调控果蝇胚胎基因的转录从而影响基因的表达水平.

关 键 词:果蝇胚胎  基因表达水平  转录调控  内含子  序列特征
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