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| 从SNP到标签SNP的算法实现与讨论 | |
| 引用本文： | 裴志利,梁艳春,卢奕南,曹忠波,孔英. 从SNP到标签SNP的算法实现与讨论[J]. 内蒙古民族大学学报(自然科学版), 2006, 21(6): 623-626 |
| 作者姓名： | 裴志利 梁艳春 卢奕南 曹忠波 孔英 |
| 作者单位： | 1. 吉林大学,计算机科学与技术学院,教育部符号计算与知识工程重点实验室,吉林,长春,130012;内蒙古民族大学,数学与计算机科学学院,内蒙古,通辽,028043 2. 吉林大学,计算机科学与技术学院,教育部符号计算与知识工程重点实验室,吉林,长春,130012 3. 大连医科大学,生物化学与分子生物学系,辽宁,大连,116027 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金;吉林省科技发展计划;高等学校博士学科点专项科研项目;面向21世纪教育振兴行动计划(985计划);吉林省科技发展应用基础项目;内蒙古民族大学校科研和教改项目 |
| 摘 要： | 由于对全部的SNP位点都进行基因分型的成本过于昂贵，而少量的标签SNP就能够提供与全部1500万个SNP位点大致相同的图谱信息．因此，如何选择标签SNP就显得十分重要，本文中所实现的选择标签SNP的算法是以连锁不平衡（Linkage Disequilibrium，LD）为基础的． |
| 关 键 词： | 单体型 标签SNP |
| 文章编号： | 1671-0185(2006)06-0623-04 |
| 修稿时间： | 2006-05-19 |
The Implementation and Discussion of Algorithm from SNP to Tag SNP |
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| PEI Zhi-li,LIANG Yan-chun,LU Yi-nan,CAO Zhong-bo,KONG Ying. The Implementation and Discussion of Algorithm from SNP to Tag SNP[J]. Journal of Inner Mongolia University for the Nationalities(Natural Sciences), 2006, 21(6): 623-626 | |
| Authors: | PEI Zhi-li LIANG Yan-chun LU Yi-nan CAO Zhong-bo KONG Ying |
| Abstract: | Because genetyping all the SNP sites cost too much,a spot of tag SNP can provide map information which is approximately the same as more than 15 million SNP sites.Therefore,how to select tag SNP seems to bevery important.This article mainly carries out the algorithm finding tag SNP from SNP based on Linkage Disequilibrium(LD). |
| Keywords: | SNP LD r2 |
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