| 基于SLAF-seq技术的抗杨树叶锈病SNP位点开发 |
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| 引用本文： | 戴美丽,方乐成,尹佟明,李小平.基于SLAF-seq技术的抗杨树叶锈病SNP位点开发[J].南京林业大学学报(自然科学版),2019,62(2):73-78. |
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| 作者姓名： | 戴美丽 方乐成 尹佟明 李小平 |
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| 作者单位： | (南京林业大学,江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室,南方现代林业协同创新中心,江苏 南京 210037) |
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| 基金项目： | 教育部"创新团队发展计划"(16400894) |
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| 摘 要： | 【目的】探索美洲黑杨抗叶锈病的分子机制,为杨树抗病分子育种提供理论参考。【方法】选取抗锈病差异显著的美洲黑杨‘2-2'与‘2-38'为亲本,通过控制授粉杂交获得80 个F1代个体。用特异性位点扩增(specific-locus amplified fragmenl sequencinq, SLAF-seq)简化基因组技术对所获F1代进行深度测序,以美洲黑杨第3代组装基因组为参照。通过序列比对筛选特异长度的DNA片段,构建SLAF-seq文库,获得特异性SNP位点。经美洲黑杨叶锈病的病原菌经形态学与分子工具鉴定,确定为落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina Kleb.)。通过叶盘法控制条件接种并对被锈菌侵染后的杨树抗性进行评估; 应用Kruskal-Wallis方法对接种结果进行检验。【结果】通过接种,获得了孢子堆数量和大小等表型数据; 基于SNP标记的连锁分析,一共有8 723 个SNP连锁至遗传图谱上; 共识别出19 个连锁群,总遗传距离为3 610.67 cM; 通过Kruskal-Wallis检验可得到37 个紧密连锁位点(P<0.005),标记分别位于I、IV、VI、XI、XV和XIX号连锁群上。【结论】利用SLAF-seq技术开发出了37 个与杨树叶锈病抗病性状紧密关联的SNP分子标记,其中Marker42056位点连锁程度最高。
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| 关 键 词： | 美洲黑杨 落叶松-杨栅锈菌 连锁遗传图谱 SLAF标签 Kruskal-Wallis检验 |
Devleopment of SNP molecular markers against the foliar rust of poplar using SLAF-seq technique |
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| DAI Meili,FANG Lecheng,YIN Tongming,LI Xiaoping.Devleopment of SNP molecular markers against the foliar rust of poplar using SLAF-seq technique[J].Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences ),2019,62(2):73-78. |
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| Authors: | DAI Meili FANG Lecheng YIN Tongming LI Xiaoping |
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| Institution: | (Jiangsu Key Laboratory for Poplar Germplasm Enhancement and Variety Improvement,Co-Innovation Centerfor the Sustainable Forestry in Southern China,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,China) |
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| Abstract: | DAI Meili;FANG Lecheng;YIN Tongming;LI Xiaoping(Jiangsu Key Laboratory for Poplar Germplasm Enhancement and Variety Improvement,Co-Innovation Centerfor the Sustainable Forestry in Southern China,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,China) |
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| Keywords: | Populus deltoides Melampsora larici-populina genetic map SLAF tags Kruskal-Wallis test |
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