青钱柳叶片转录组数据组装及基因功能注释 |
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引用本文: | 蒋向辉,苑 静,王 翔.青钱柳叶片转录组数据组装及基因功能注释[J].华中师范大学学报(自然科学版),2018,52(6):822-831. |
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作者姓名: | 蒋向辉 苑 静 王 翔 |
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作者单位: | 1.凯里学院黔东南民族药综合利用工程技术研究中心, 贵州 凯里 556011; 2.凯里学院化学与材料工程学院, 贵州 凯里 556011 |
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摘 要: | 青钱柳是一种民间常用中药,青钱柳叶中有多种生物活性的次生代谢物,如有机酸、黄酮类、皂苷类、铱类、精油、无机元素等,但对于青钱柳次生代谢产物合成的分子机制仍未见有报道.使用Illumina公司Hiseq 4000平台对青钱柳叶进行转录组测序,对 reads 进行拼接,得到50 126个unigenes平均长度为 1 247 bp,有19 875 (39.65%) unigenes由NCBI非冗余数据库进行注释的,23 716 (47.31%) unigenes被注释到GO数据库,14 950个(29.82%) unigenes匹配到COG 功能组.进一步的分析结果显示,6 012 (11.20%)个 unigenes被富集到 254个 KEGG 代谢通路,其中1 212个unigenes参与了次生代谢产物的生物合成,并且发现126个unigenes参与异戊二烯代谢,包括萜烯类、香茅醛、呋喃酮、苷的代谢途径.此外,总共检测到21 089个简单序列重复(SSRs).通过对老叶与嫩叶的转录组比较分析结果显示,在青钱柳不同生长发育时期的叶片中,基因表达上调占主异作用的过程主要涉及萜类和多肽的代谢、辅酶和维生素的代谢和氨基酸代谢,而基因表达下调占主异作用的过程主要涉及信号传输、类脂物代谢与能量代谢.该转录组数据可为青钱柳重要生物活性成分的生物合成和调控提供参考.
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关 键 词: | 青钱柳 转录组 功能注释 |
收稿时间: | 2018-12-11 |
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