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藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析
引用本文:田晓芹,褚晶,丁洪霞,杨博,陈方军,郭善利,陈世华.藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析[J].烟台大学学报(自然科学与工程版),2023(2):149-156.
作者姓名:田晓芹  褚晶  丁洪霞  杨博  陈方军  郭善利  陈世华
作者单位:烟台大学生命科学学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31370296);
摘    要:基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异,CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达,CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达;非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。

关 键 词:藜麦  异戊烯转移酶  CqIPT基因家族  生物信息学
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