藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析 |
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引用本文: | 田晓芹,褚晶,丁洪霞,杨博,陈方军,郭善利,陈世华.藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析[J].烟台大学学报(自然科学与工程版),2023(2):149-156. |
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作者姓名: | 田晓芹 褚晶 丁洪霞 杨博 陈方军 郭善利 陈世华 |
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作者单位: | 烟台大学生命科学学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31370296); |
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摘 要: | 基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异,CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达,CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达;非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。
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关 键 词: | 藜麦 异戊烯转移酶 CqIPT基因家族 生物信息学 |
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