藜麦黄素单加氧酶基因(CqYUCCA)家族的全基因组鉴定与分析 |
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引用本文: | 褚晶,田晓芹,陈世华,郭善利.藜麦黄素单加氧酶基因(CqYUCCA)家族的全基因组鉴定与分析[J].烟台大学学报(自然科学与工程版),2023(1):20-27. |
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作者姓名: | 褚晶 田晓芹 陈世华 郭善利 |
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作者单位: | 烟台大学生命科学学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31370296); |
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摘 要: | 利用生物信息学的方法从藜麦基因组中鉴定得到25个CqYUCCA基因,并对其蛋白信息、进化关系及表达模式进行了系统的分析。结果表明:25个CqYUCCA基因不均匀地分布在藜麦12条染色体上,基因家族亲缘关系显示其编码的蛋白被分成四个亚组,每组的基因结构及蛋白基序的位置、数量均具有较高的相似性。根据已发表转录组数据分析,部分CqYUCCA基因受到干旱、高温以及盐胁迫的诱导。这些结果为进一步研究CqYUCCAs蛋白的生物学功能奠定了基础。
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关 键 词: | 藜麦 生长素 YUCCA 生物信息学 基因家族 |
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