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基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型
作者姓名:孙希野  蒋灿  罗旭  舒佩  王森  周科讯  黄媚娟
作者单位:1.四川大学华西医院肿瘤中心胸部肿瘤科;2.四川大学华西医院心内科;3.成都上锦南府医院心内科;4.中国科学院成都计算机应用研究所;5.中国科学院大学;6.四川大学华西医院临床试验中心;7.四川大学华西医院肿瘤中心腹部肿瘤科
基金项目:四川大学华西医院临床研究孵化项目重点项目(2021HXFH055);
摘    要:为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因组图谱(TCGA)-ESCA队列中进行验证,同时分析不同风险组肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况.结果显示训练队列中低风险组的生存明显优于高风险组(P<0.05).训练队列中低风险组与高风险组患者相比有更多CD4+T细胞,低风险组中CD8A、GZMB、PRF1的表达水平高于高风险组(P<0.05).以上结果表明基于焦亡和铁死亡基因组学所构建的ESCA预后模型可为食管癌患者的临床治疗提供参考.

关 键 词:食管癌  焦亡  铁死亡  预后风险模型  公共数据库  
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