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基于靶基因比较microRNAs与HBV蛋白的作用模式
引用本文:杨琳琳,叶浩,唐凯临,曹志伟.基于靶基因比较microRNAs与HBV蛋白的作用模式[J].科学通报,2012(19):1755-1767.
作者姓名:杨琳琳  叶浩  唐凯临  曹志伟
作者单位:华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室;上海生物信息技术研究中心;同济大学生命科学与技术学院
基金项目:国家自然科学基金(30900832);肝肾疾病病证教育部重点实验室(上海中医药大学)开放课题;上海市教委“曙光计划”(07SG22);教育部新世纪优秀人才计划(NCET-08-0399);国家科技重大专项(2012ZX10005001)资助
摘    要:乙型肝炎病毒(hepatitis Bvirus,HBV)感染是当前严重威胁人类健康的病毒性疾病之一.近年来许多研究证实microRNA(miRNA)可以介导宿主与病毒之间的相互作用,阐明miRNA在HBV感染中的作用有助于新型治疗策略的提出.然而,miRNA的多靶点特性限制了其功能研究.为了研究miRNA对HBV的调节机制,本文在靶基因水平上比较了HBV相关miRNA和HBV蛋白的功能谱、采用半定量手段进行分析并从网络层面挖掘其潜在作用模式.结果表明,在靶基因上,miRNA功能较为集中,HBV蛋白的作用效应可能更为广泛;在网络拓扑结构上,miRNA主要通过直接作用于HBV蛋白的靶基因及其邻居节点达到其调节作用;在生理效应上,miRNA在凋亡、细胞周期以及体液免疫的调节上呈现出拮抗HBV蛋白效应的趋势.本研究不仅为miRNA的功能研究提供了一种良好的方法,而且miRNA在HBV感染中的作用模式有助于今后基于miRNA的乙肝治疗方案的提出.

关 键 词:乙肝  microRNA  HBV蛋白  靶基因  GO  网络

Interaction pattern between microRNA and HBV proteins in target genes
YANG LinLin,YE Hao,TANG KaiLin,& CAO ZhiWei.Interaction pattern between microRNA and HBV proteins in target genes[J].Chinese Science Bulletin,2012(19):1755-1767.
Authors:YANG LinLin  YE Hao  TANG KaiLin  & CAO ZhiWei
Institution:1,2,3 1 State Key Laboratory of Bioreactor Engineering,East China University of Science & Technology,Shanghai 200237,China;2 Shanghai Center for Bioinformation Technology,Shanghai 200235,China;3 School of Life Science and Technology,Tongji University,Shanghai 200092,China
Abstract:
Keywords:
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