| 中国明对虾和中华绒螯蟹EST的Blast2GO注释及其在免疫基因分布研究中的应用 |
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| 作者姓名： | 曾铮 张亦陈 刘逸尘 郝彤 孙金生 |
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| 作者单位： | [1]天津师范大学生命科学学院,天津300387 [2]天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室,天津300387 [3]天津市水生动物疫病预防控制中心,天津300221 |
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| 基金项目： | 国家973计划资助项目（2012CB114405）;国家863计划资助项目（2012AA092205,2012AA10A4）;国家科技支撑计划资助项目（2011BAD13804,2011BAD13807） |
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| 摘 要： | 以dbEST数据库中公布的中国明对虾和中华绒螯蟹的EST序列作为数据源,利用CAP3对其进行聚类拼接,采用Blast2GO软件进行功能注释,并通过查找免疫相关的GO注释和检索免疫关键词的方法寻找免疫相关基因,经与不同物种免疫基因的比较,推测可能的免疫基因序列,并进一步分析免疫基因在不同组织和细胞中的分布.结果表明,通过注释和关键词进行筛选这2种方法具有较好的互补性;预测了位于中国明对虾头胸部的60个可能的免疫基因以及位于中华绒螯蟹血细胞hemocyte、haemocyte、肝胰腺、性腺和精巢中的250个免疫基因,这些基因包括模式识别受体、抗氧化蛋白、抗菌肽、凝集素等,其中部分参与酚氧化酶原激活系统、Toll信号通路等重要免疫过程.中华绒螯蟹血细胞中具有种类丰富的免疫基因,与已有的甲壳动物免疫系统相符合.肝胰腺中发现了模式识别蛋白、蛋白酶以及数量众多的凝集素种类,提示肝胰腺在免疫过程中也发挥了一定作用.
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| 关 键 词： | 中国明对虾 中华绒螯蟹 免疫基因 基因功能注释 EST Blast2GO |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
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