| 基因表达水平与密码子使用的关系及其预测 |
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| 引用本文： | 李宏,罗辽复.基因表达水平与密码子使用的关系及其预测[J].内蒙古大学学报(自然科学版),1995,26(5):544-561. |
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| 作者姓名： | 李宏 罗辽复 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理论物理和理论生物物理研究室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金和国家教委博士点基金 |
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| 摘 要： | 研究了两个方面的问题．首先，对Ｅ．ｃｏｌｉ（１２１个基因），Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ（１１１个基因）、Ｙｅａｓｔ（１０７个基因）三种生物的核酸序列，将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子：最适密码子、非最适密码子和稀有密码子．对每一序列的编码区，算出它们各自出现的概率后，用信息聚类法聚类．发现每种生物的高低表达基因明显分开，将三种生物基因聚类结果综合来看，基因表达水平被分为四级：甚高表达基因（ＶＨ）、高表达基因（Ｈ）、较低表达基因（ＬＭ）和低表达基因（ＬＬ）．每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性．在此基础上提出一个预测稀有密码子及基因表达水平的自洽信息聚类方法，Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅａｓｔ预测的结果与Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅａｓｔ的现有资料相比，符合很好．文中还预测了Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ和Ｂａｃｔｅｒｉｏ－ｐｈａｇｅ三种基因的表达水平及稀有密码子．
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| 关 键 词： | 密码子 基因表达水平 自洽信息聚类 预测 |
The Relations of Gene Expression Level with Codon Usage and Its Prediction |
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| Li Hong LuoLiao fu.The Relations of Gene Expression Level with Codon Usage and Its Prediction[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,1995,26(5):544-561. |
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| Authors: | Li Hong LuoLiao fu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | codon usage gene expression level self- consistent information clustering pridiction |
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