基于生物信息学分析皮肌炎的铁死亡相关基因

采用生物信息学方法挖掘皮肌炎相关的铁死亡基因,为皮肌炎的临床诊断及治疗提供新思路。从基因表达综合数据库中筛选出关于皮肌炎的数据集,应用R语言对数据集进行分析,得到皮肌炎的261个差异基因并与FerrDb数据库中的铁死亡基因取交集后得到15个皮肌炎相关的铁死亡基因,使用基因本体富集,京都基因和基因组百科全书途径显示它的作用可能和炎症、铁死亡、氧化应激和凋亡等相关,基于蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析及Cytoscape里的算法筛选出5个关键基因皮肌炎相关的铁死亡基因,通过基因表达和受体工作特征曲线进一步确定了4个诊断基因TIMP1、HMOX1、TFRC、CDK1A作为皮肌炎诊断及治疗的生物标志物的潜力,为皮肌炎的铁死亡机制提供新的见解。