基于SLAF-seq技术的抗杨树叶锈病SNP位点开发

【目的】探索美洲黑杨抗叶锈病的分子机制,为杨树抗病分子育种提供理论参考。【方法】选取抗锈病差异显著的美洲黑杨‘2-2'与‘2-38'为亲本,通过控制授粉杂交获得80 个F1代个体。用特异性位点扩增(specific-locus amplified fragmenl sequencinq, SLAF-seq)简化基因组技术对所获F1代进行深度测序,以美洲黑杨第3代组装基因组为参照。通过序列比对筛选特异长度的DNA片段,构建SLAF-seq文库,获得特异性SNP位点。经美洲黑杨叶锈病的病原菌经形态学与分子工具鉴定,确定为落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina Kleb.)。通过叶盘法控制条件接种并对被锈菌侵染后的杨树抗性进行评估; 应用Kruskal-Wallis方法对接种结果进行检验。【结果】通过接种,获得了孢子堆数量和大小等表型数据; 基于SNP标记的连锁分析,一共有8 723 个SNP连锁至遗传图谱上; 共识别出19 个连锁群,总遗传距离为3 610.67 cM; 通过Kruskal-Wallis检验可得到37 个紧密连锁位点(P<0.005),标记分别位于I、IV、VI、XI、XV和XIX号连锁群上。【结论】利用SLAF-seq技术开发出了37 个与杨树叶锈病抗病性状紧密关联的SNP分子标记,其中Marker42056位点连锁程度最高。     

一种基于社会化媒体和社会网络结构的混合推荐模型

近年来,社交网络的迅速发展为在线用户之间的沟通和交流带来极大便利,为良好的信息推荐服务提供了丰富的资源,与此同时也为个性化推荐带来了更为复杂的技术挑战.本文通过自然语言处理技术获取用户在社会化媒体(新浪微博)中的个性化兴趣标签信息,应用到自行设计开发的社会化阅读应用牛赞网中.进一步地,利用用户在牛赞网中的阅读行为和社交信息,结合用户的社会化媒体兴趣,提出了一种混合推荐模型.实验基于牛赞网中的实际数据集,并与基于用户的经典协同推荐模型进行了对比,结果表明,提出的模型在推荐性能的几个指标(AUC、准确率、召回率、多样性和新颖性)上都有很大的提高.最后,通过对牛赞网中几个典型用户进行进一步的案例分析后得出,混合推荐模型的最优参数需要根据不同社会化行为的用户进行调节.     

印刷纸电池及其应用

 由于极高的柔性度和适应卷对卷印刷工艺带来的低成本等优势,纸电池在众多领域有着独特的应用价值。阐述印刷纸电池的研发历史、原理及工艺特点,介绍其在有源/半有源RFID智能标签、可穿戴设备、离子电渗透面膜等方面的应用,并简述印刷纸电池面临的机遇和挑战。     

基于声表面波传感的无线标签识别系统

构架了一种基于声表面波延迟线式的无线标签识别系统,该系统以不同的无源编码标签代表不同的对象,通过对标签的传感以达到目标识别的目的,介绍了标签传感器和系统的信号处理方法,基于实际应用,对同一型号的标签传感器进行不同的体外编码,并在实验中对标签编码进行了验证。     

藏文字库设计中OpenType特征标记的应用研究

基于国际标准实现藏字处理一直是藏文信息处理的难点,OpenType字库的实现解决了该难点,微软Vista操作系统的推出,把藏文等几种少数民族文字的处理推到了一个新的阶段,但Vista自身只带了一个藏文白体字库,不能满足用户对字体的需求。文章分析了OpenType特征标记在藏文字库设计中的应用,有助于设计OpenType藏文字库。     

XML及其应用

可扩展标记语言XML体积小 ,易于编辑 ,可以进行网络信息交换和网上数据库查询 ,优于另一个十分流行的置标语言HMTL .数学置标语言是XML的应用之一 ,它以文本的形式描述了数学的信息 ,它的设计遵守XML家族的协议 ,因而能够和XML的相关工具紧密协作 .本文还给出了一个创建数学方程的实例 ,并提到了XML的其他一些应用     

STUDYING COMPLEX ADAPTIVE SYSTEMS

Complex adaptive systems(cas)-systems that involve many components that adapt orlearn as they interact - are at the heart of important contemporary problems.The study of cas posesunique challenges:Some of our most powerful mathematical tools,particularly methods involving fixedpoints,attractors,and the like.are of limited help in understanding the development of cas.This papersuggests ways to modify research methods and tools,with an emphasis on the role of computer-basedmodels.to increase our understanding of cas.     

Bioinformatic analysis of expressed sequence tags from sporophyte of Porphyra yezoensis （Bagiaceae, Rhodophyta）

A total of 719 expressed sequence tags (EST) clustered into 329 non?redundant EST groups are obtained from the sporophyte cDNA library of red algae, Porphyra yezoensis. Gene Ontology (GO) analysis is employed in characterizing 60 strictest annotated unique genes out of the 329 EST groups and some domains such as COX1, Sod-Fe-C, GST-N, SHMT, and RNase-PH related to the enzymes and proteins functioning in cells have been identified by HMMPFAM search. As its leafy gametophyte, the similar codon usage with strong bias is found in P. yezoensis filamentous sporophyte, regardless of some differences found in given amino acids. The average GC content of the 329 unique genes is 53.0%. In contrast, the third nucleotide of codon exhibits a higher GC content (72%) than that of the first (58%) and the second (42%) nucleotides. Similarity search of the present study shows a novel EST ratio of 60.2%, which is against the Porphyra ESTs database, suggesting further investigations towards elucidating the characteristics of Porphyra functional genome.     

Sequence analysis of mRNA polyadenylation signals of rice genes

Most eukaryotic mRNAs receive a poly (A) tail at their 3′-ends through a process involving the cleavage of pre-mRNA and the concomitant polymerization of adenosine residues to the cleaved RNA end[1,2]. As un- translated regions (UTRs) may contain importa…     

基于返回式二进制树形搜索的反碰撞算法

多个电子标签在识别时发生碰撞是射频识别(RFID)技术中关键的问题.解决此问题常用二进制树形搜索算法,但这种算法对N个标签识别进行一一识别时,所需的操作次数太多,效率较低.本文提出了一种新的算法,该算法是在二进制树形搜索算法的基础上进行改进.当阅读器检测不到有碰撞时,可用返回式从上一层REQUEST命令获得下一次的REQUEST命令.最后,通过比较对N个标签进行一一识别所需要总的操作次数,来进一步说明返回式二进制搜索算法的优越性.