随机与无关联序列信息剩余度的分布

本文证明了对于随机核酸序列,2ND_1服从自由度为3的χ~2分布,对于l无关联核酸序列,2(N—l)D_(l 1)服从自由度为9的χ~2分布。     

全局最优化的平滑积分变换方法：I基本思想和理论框架

提出了解决全局最优化中多极小问题的平滑积分变换方法。通过平滑积分变换将目标函数平滑变形，充分变形后的目标函数将仅有一个极小，沿该极小在变形过程中的轨变回溯即可找出其对应的原始目标函数的一个较深且较宽的极小。研究了平滑积分变换的数学性质并提出了不依赖局部极小化算法的极小追踪技术。     

全局最优化的平滑积分变换方法Ⅰ基本思想和理论框架

提出了解决全局最优化中多极小问题的平滑积分变换方法．通过平滑积分变换将目标函数平滑变形，充分变形后的目标函数将仅有一个极小，沿该极小在变形过程中的轨迹回溯即可找出其对应的原始目标函数的一个较深且较宽的极小．研究了平滑积分变换的数学性质并提出了不依赖局部极小化算法的极小追踪技术．     

离散非均匀非线性Schrodinger方程的数值研究

本文用数值方法研究了商教非线性非均匀Schrodinger方程,讨论了孤子被势垒,势阱散射的性质,计算结果表明,在非均匀的一维分子链上的长距离输运也是可能的。     

DNA编码序列的关联特性

用ＤＮＡ行走方法和信息剩余度方法研究了核酸编码序列中的碱基关联，指出了这种关联的短程性．讨论了碱基组成漂变导致的表现关联效应和各种关联模的涨落限．对最近的有关文献作了评述．     

高质量蛋白质空间结构数据库的构建方法

根据不同的研究需要,提出了不同的建库标准。在以分辨率为主要选择依据的基础上,采取综合的打分的方法,全面地衡量一个序列质量的高低。引入同一性因子Ｓ,找到了序列的同一性Ｓ和序列同源性Ｖ的关系,从而在判别序列之间同源程度时由序列的同一性因子Ｓ取代序列同源性参数Ｖ。     

直链淀粉结构的分子动力学模拟

为了研究直链淀粉的结构，构建并优化了200个单体组成的直链淀粉模型．在DreidingⅡ力场、热力学温度为300K条件下对直链淀粉进行lns分子动力学模拟计算．分析了直链淀粉分子力学优化的结构、1 ns时的结构以及势能最低时的结构，其结果将有助于对直链淀粉结构功能的进一步研究．     

论有限序列的组织复杂性

通过分析关联谱的分布特征,提出了一种组织复杂性的定义。关联谱是序列各阶信息剩余度的Fourier变换,对于长度为N,Shannon熵为H的序列。当N很大时,其最大组织复杂性趋于NH。周期序列的复杂性为O(logN)。所以本文提出的复杂性度量可能能够回答“Bach的音乐为什么比猴子的音乐复杂?”的问题。     

改进的随机聚点搜索算法及其在分子对接问题中的应用

提出改进的随机聚点搜索算法,设计了新的接受几率并采取了算法加速措施,对分子对接问题进行了计算检验。结果表明,改进后的算法计算速度和搜索效率都明显优于Ｓｔａｎｔｏｎ等人提出的方法。     

非同源球蛋白三级结构预测

研究了主链二面角的统计分布，在Ｒａｍａｃｈａｎｄｒａｎ图上将二面角（　，ψ）分成６个区域．对于每一残基，考虑其前后残基的影响后，给出在这些区域中出现的相对几率．根据Ｂｏｌｔｚｍａｎｎ原理，由几率导出能量．再考虑非局域的蛋白质整体性质（结构含量、疏水作用等）对系统能量的贡献，由能量极小化定出结构．对（　，ψ）的预测成功率为５３．４％．若由结构含量实测值出发，可使预测成功率达５７．３％．亲疏水氨基酸在球蛋白中分布的符合率为５１％．讨论了由（　，ψ）分区值导出整体结构的问题．