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为了筛选出最适合于超级保守元件(ultra-conserved elements, UCE)序列组装的软件，分别使用5款组装软件SPAdes、ABySS、Velvet、Trinity和Minia对17个UCE捕获测序文库进行组装.结果发现：5款组装软件对UCE数据的组装结果不同，Trinity组装所耗时间明显比其他软件长；SPAdes和Trinity的组装结果较好，得到的可观长度的重叠群(contigs)总数较多，产生的长片段(>250 bp)contigs较其他3款软件更多，但是SPAdes捕获到的UCE数量最多，因此，相比于其他4款组装软件，SPAdes更适合UCE数据的组装.本研究为基于UCE的系统发育基因组学分析提供了参考. 相似文献
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