玉米淀粉合成相关基因ZmSSIIa 的序列变异分析

 玉米淀粉合成酶ZmSSIIa 在淀粉生物合成途径中主要作用是将支链淀粉的分支链由6~10 个延长至12~25 个, 对于玉米籽粒产量和品质具有重要的影响。本研究在86 个优异玉米自交系中对该基因进行基因序列定点捕获, 并获得该基因全长为4836 bp 的核苷酸序列。基因多态性分析发现, 该基因座位上有78 个SNP 和19 个Indel。玉米ZmSSIIa 基因的编码区具有24个SNP, 将该基因划分成9 种编码区单倍型, 并编码7 种ZmSSIIa 蛋白质。供试材料的群体中, ZmSSIIa 基因至少经历8 次重组, 可能对单倍型的分化和连锁不平衡具有重要作用。中性进化测试表明该基因在供试群体中没有明显的人工选择。