Taq酶体外合成DNA时模板错位机制的探讨

利用Taq DNA聚合酶体外合成DNA过程中,当反应体系中缺少与模板链互补配对的dNTP底物时,产物合成并不会在底物缺失位点处终止,聚合反应继续进行.为研究此复制缺陷现象,设计一系列模板用于DNA体外酶促合成.除了已知的碱基错配机制,笔者发现存在另一种"模板错位"机制,即模板中与底物非Watson-Crick互补配对的碱基位点首先进行收缩滑动,形成模板bulge结构后再继续进行酶促合成反应.这项研究有助于提高DNA样品合成保真度以及继续深入探索体外DNA合成的详细机制.     

异或门的DNA计算模型

利用DNA链置换反应分别求解二输入和三输入异或门逻辑电路.对于二输入异或门电路,将不同输入值编译成不同数量输入链,将特定数量的输入链加入反应器中,与反应器中的反应链发生链置换反应,充分反应后,通过判断检验器中绿色荧光分子明灭从而得到异或门电路的解;二输入异或门逻辑电路可以推广到三输入异或门逻辑电路.该方法具有操作简单,实验成本低,可行性高等优点.     

基于DNA-AuNCs的荧光传感新方法灵敏检测胰蛋白酶活性

以DNA模板金纳米簇(DNA-AuNCs)作为荧光探针,发展了一种灵敏检测胰蛋白酶活性的荧光分析新方法.在胰蛋白酶存在条件下,牛血清白蛋白水解成多肽片段,释放出游离的半胱氨酸残基.半胱氨酸残基与金纳米簇通过Au-S键形成非荧光的配合物,导致金纳米簇的荧光强度显著降低.该方法对胰蛋白酶的线性检测范围为0.1～2.0mg/L,检出限为20μg/L(R_(SN)=3).此外,该方法被成功应用于人血清样品中胰蛋白酶含量的测定.     

双核钌配合物与c-myc G-四链体DNA的键合性能

通过紫外可见吸收光谱和荧光光谱滴定、Job plot、圆二色光谱、聚合酶链式扩增反应(PCR)、显色反应以及FRET实验,研究了苯酚基双核钌配合物与c-myc G-四链体DNA(c-myc Pu27和c-myc Pu22)之间的相互作用. 结果表明,配合物对c-myc Pu27和c-myc Pu22 DNA都有较强结合,键合常数分别为6.21 × 10⁷ L/mol 和2.33×10⁶ L/mol,键和模式为沟槽结合,键合物质的量比为2∶1;配合物在浓度为4 μmol/L(c-myc Pu27)、6 μmol/L(c-myc Pu22)时,可完全抑制PCR扩增产物生成,表明其能够诱导c-myc DNA形成G-四链体结构. 此外,配合物可使F27T和F22T的熔解温度分别升高13 ℃和12 ℃,且在双链DNA存在时F27T和F22T的熔解温度几乎没有变化,表明其对c-myc G-四链体DNA具有显著的稳定性及选择性.     

双吡啶单吡咯钌配合物与DNA的相互作用

三联吡啶钌配合物和DNA相互作用已有大量报道,但基于类三联吡啶配体,如双吡啶吡咯,稳定的金属配合物和DNA作用却鲜见报道.利用荧光光谱、圆二色谱(CD)和紫外-可见光谱等表征手段,研究了4个已知的双吡啶吡咯钌配合物与DNA结合性质:[(PDP)Ru(COD)X],其中HPDP=2,5-bis(2’-pyridyl)pyrrolide,COD=1,5-环辛二烯,X=Cl~-(1), NO~-_3(2);[(PDP)Ru(COD)(H_2O)](BF_4)(3);[(PDP_(Cl))Ru(COD)Cl](HPDP_(Cl)=2,5-bis(2’-pyridyl)-3,4-dichloropyrrolide(4).发现化合物1以经典嵌插方式和DNA结合,2和3可能为部分或非经典嵌插结合DNA,4主要以静电相互作用结合DNA.此外,通过MTT法考察了配合物1～4对人宫颈癌Hela细胞的体外细胞毒性.     

相信我吧,我只是个医学研究者

<正>医学研究者们已经不再能保障病人的私隐。他们正在寻找新的途径来建立信任关系。公开DNA信息的试验牛津,英国,郊区。不远处是罗杰·班尼斯特(Roger Bannister)第一次创下4分钟内穿越一英里记录的那条赛道。而在此时此刻,一场静悄悄的革命正在进行中。一百二十六个人正在报数,这些人或是患有一种罕见的风湿疾病,或是患病儿童的家长。他们正在参与一项关于此类疾病病变状况的研究。不同于仅仅提供样本或是填写一份问卷,然后在忐忑不安中期待有朝一日研究人员能够给出一     

克隆猛犸?有戏!

<正>近日,科学家在西伯利亚的冰雪荒漠中,发现了一具猛犸尸体。这具尸体的特别之处在于,这是迄今人们发现的最完整的猛犸尸体。虽然这头猛犸至少已有4万年的历史,但生物学家却认为,它的组织保存得非常完善,人类绝对可以得到一部分完整的DNA信息,从而对其进行克隆。当然,用克隆或遗传工程学复活猛犸将是一个极其漫长的过程,但科学家已经确定了用于"复活工程"的猛犸对象——亚洲象。     

动态

<正>北极露脊鲸,帮助人类更长寿众所周知,大多数哺乳动物都会在100岁左右走向生命的尽头。然而,作为地球上体型最大的哺乳动物,鲸鱼家族中却有一个例外——北极露脊鲸,它们的寿命往往会超过200岁。为什么它们能比其他鲸鱼物种更长寿呢?美国和英国的科学家研究发现,在露脊鲸体内,存在着一种独特基因,这种基因能帮助它们抵御癌症,并修复DNA损伤,这就是露脊鲸不会患上心脏病和癌症的真正原因。     

磺基水杨酸和精氨酸构筑的Cu(Ⅱ)配合物与DNA的相互作用

首先， 合成并表征一种新型配合物Cu₂(L-Arg)₂(SSA)(H₂O)₂ (L-Arg=精氨酸, SSA=磺基水杨酸), 然后以鲱鱼精DNA为靶点, 用电化学法、 光谱法和黏度法研究配合物与DNA间的相互作用. 结果表明： 当扫描速率为0.1 V/s时, 配合物在0.124 8,-0.518 9 V处出现一对明显的氧化还原峰, 且配合物的氧化还原峰电流随扫描速率的增大而增大, 配合物在玻碳电极上的反应由扩散过程控制; 加入DNA后, 配合物的氧化和还原峰电流均减小, 式量电位增大, 配合物的峰位发生移动, 吸光强度降低, 且与DNA的浓度呈正相关； 配合物的相对黏度呈增大趋势. 因此配合物与DNA间存在嵌插作用.     

一种新型DNA纳米结构的构建与结晶

DNA三角形纳米结构的拐角是由DNA同源重组中的Holliday基序构成的.为进一步研究DNA三角形纳米结构，对其拐角截断并引入黏性末端到其基序上，使其能够自组装成为一种新型DNA纳米结构.对该DNA纳米结构进行凝胶电泳分析，发现其迁移速率要比DNA三角形迁移速率小.在这种没有扭曲张力的情况下，该基序只是自组装形成一个二聚体结构，而不是三聚体结构(DNA三角形).对该新型DNA纳米结构进行结晶，并合成得到了硒代核酸，同时也得到了较高质量的硒代单晶，以帮助相位测定.希望对其晶体结构进行测定研究，以便发现该新型DNA纳米二聚体结构和该Holliday基序组装的三维结构，从而更深入地认识DNA纳米材料的组装规律.