环己烯类神经氨酸酶抑制剂的三维定量构效关系研究

环己烯类神经氨酸酶抑制剂是目前效果最好的流感病毒抑制剂.选取26个典型的环己烯类神经氨酸酶抑制剂,应用比较分子力场分析(CoMFA)方法,研究它们与神经氨酸酶(NA)的相互作用,建立了环己烯类NA抑制剂与NA的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.该模型的最佳非交叉验证系数R2为0.991,交叉验证系数R2cv为0.760,检测值F为521.53,标准偏差SEE为0.098,立体场、静电场的贡献分别为74.6%、25.4%,最佳主成分为4,这表明模型具有很强的稳定性和预测能力.用该模型对随机挑选的3个化合物进行预测,得到了满意的结果.     

α,β-不饱和酰胺TRPV1抑制剂的Topomer CoMFA模型

利用SYBYL软件中的Topomer CoMFA方法分析了α,β-不饱和酰胺类TRPV1抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.分子被分开为羰基和氨基两个基团,在Topomer CoMFA模型考察了立体场和静电场对抑制活性的影响.结果显示:去一交叉验证的相关系数q2为0.702,模型的预测相关系数r2为0.881.说明所建立的模型在统计上有较好的稳定性和预测能力,有助于TRPV1抑制剂的研发.     

芳基三唑啉酮类除草剂三维定量构效关系研究

使用比较分子场分析法（ＣｏＭＦＡ）,对１８种抑制原卟啉原氧化酶（ＰＰＯ）的芳基三唑啉酮类化合物进行了三维定量构效关系（ＱＳＡＲ）研究,得到了具有较强预测能力的ＱＳＡＲ模型．该模型显示空间场和静电场效应在抑制ＰＰＯ活性方面均起重要作用,模型对进一步设计、合成具有更高活性的新型除草剂具有指导意义     

3-D QSAR study on a set of nitroaromatic compounds

The 3-D relationships between the structures of 25 nitroaromatic compounds and their toxicities have been investigated using the comparative molecular field analysis (CoMFA) method, and a 3-D QSAR model with considerable prediction ability is obtained. In comparison with traditional 2-D techniques, CoMFA helps to give a better interpretation of toxic mechanism of tested compounds.     

含硫芳香族化合物发光菌毒性的3D—QSAR研究

利用比较分子力场分析法（CoMFA)与比较分子相似指数分析法（COMSIA）研究了29种含硫芳香族化合物对发光菌的急性毒性与其结构间的三维构效关系（3D－QSAR）,得到了具有较强预测能力的3D－QSAR模型,并在此基础上剖析了这批含硫芳香族化合物结构与活性之间的内在关系,深入探讨化合物的毒性作用机理。     

单环β—内酰胺对大肠杆菌受体作用三维构效关系的比较分子力场分析（CoMFA）

模拟受体活性部位与配体分子间作用的势场模型,从三维空间进一步探讨单环β-内酰胺抗生素构效关系,指导新化合物设计与合成。我们根据活性类似物原理,采用比较分子力场分析（CoMFA）方法,对已知的26个单环β-内酰胺化合物对大肠杆菌作用的构效关系进行了研究。模拟了大肠杆菌青霉素结合蛋白（PBPs)与配体分子间的作用力场和静电力场模型。该模型有利于指导新型β-内酰胺抗生素me-too类药物的设计。     

2-苯基4-吡喃酮类COX-2抑制剂的三维构效关系研究

 环氧化酶（cyclooxygenase，COX）家族是非甾体类抗炎药物的作用靶酶，其中COX-2是 NSAIDs药物发挥作用与治疗炎症有关的靶点。使用三维定量构效关系研究方法研究2-苯基4-吡喃酮类COX-2抑制剂的分子结构与生物活性之间的定量关系，并构建三维定量构效关系模型。CoMSIA模型证实该类化合物的结构参数和其抑制活性存在明显的相关性（R²为0.929），且有较好预测能力（q²为0.746）；同时使用“留五法”证实模型的稳定和可靠。三维构效关系模型系数等势图显示Subset A和B的R取代基4位上官能团变化对活性影响最大，在结构修饰时需要优先考虑；Subset A的R取代基2位上官能团的影响次之。     

黄酮类化合物与雌激素受体作用的三维定量构效关系

黄酮类化合物是一种普遍存在于食物和植物中的内分泌干扰物. 选取20个典型的黄酮类化合物, 采用基于分子对接(docking)的比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数(CoMSIA)方法, 研究它们与雌激素受体(ER?)的相互作用, 建立了这些黄酮类化合物和雌激素受体之间的三维定量构效关系(QSAR)模型, 得到CoMFA模型的最佳交互验证相关系数Q²_LOO为0.845, 非交互验证相关系数R²为0.988, 相应的CoMSIA模型的交互验证相关系数Q²_LOO为0.670, 非交互验证相关系数R²为0.990, 说明模型具有很强的稳定性和预测能力. 此外, 分子对接结果揭示了受体腔中的关键残基及其与黄酮类化合物作用的具体方式.     

新烟碱型乙酰胆碱受体吡啶基醚类配体的3维定量构效关系

采用比较分子力场分析方法，对一系列与烟碱型乙酰胆碱受体作用的吡啶基醚类配体进行构效关系分析，建立了这类化合物的3维构效模型．其交叉验证回归系数Rcv^2、非交叉验证回归系数Rncv^2和标准偏差s分别为0．744，0．973和0．256．结论说明该系列化合物的分子立体场和静电场的分布与生物活性之间有良好的相关性．该模型对训练集分子的活性预测结果较好，表明该力场模型有一定的预测能力，可用来指导设计新的烟碱型乙酰胆碱受体配体．     

α-氧代膦酸酯类衍生物的CoMFA研究

丙酮酸脱氢酶系是生物体有氧代谢关键酶之一，它催化植物体中由丙酮酸氧化脱羧转化为乙酰辅酶A的代谢过程．在这一代谢过程的第一步反应中，由于丙酮酸脱氢酶系的催化，丙酮酸的酮羰基与脱质子化硫胺素焦磷酸酯（TTP）加成结合，形成中间体，然后脱羧产生烃乙基TPP，之后进一步转化为乙酰辅酶A．