基于蚁群算法的肿瘤驱动通路搜索方法研究

肿瘤的发生和发展主要是由基因突变的累积导致细胞信号通路调控紊乱而引起的.将通路中基因集的两个特性——高覆盖性和高排他性,与基因协变量相结合,提出了一种基于蚁群优化算法的驱动通路搜索方法.旨在基因突变数据及基因协变量数据的基础上,搜索满足高覆盖性和高排他性的通路基因集,从而识别致癌的驱动通路.首先,通过对基因表达水平、复制时间和染色体状态3个基因协变量相互的关联性,以及它们与基因突变频率的相关性进行分析,选择复制时间作为影响基因突变频率的权重协变量.然后,将权重协变量与现有方法结合,构造了一个新的最大权重子矩阵函数作为组合优化问题的目标函数.为克服该优化问题的NP难题,采用蚁群优化算法求解.应用该方法在肺腺癌的突变数据上进行了分析与验证.结果证明,该方法不仅比现有方法找到了更多在已证实通路中的癌基因,而且其中包含多个互斥性显著的基因对,证明了方法的有效性.     

重复修剪对月季照射后代诱变效果的影响

^Co-r射线照射现代杂交月季休眠枝条，第二年重复修剪后，突变频率提高突变说大，突变性状的稳定性增强。品种不同， 重复修剪后突变性状的表现也不同。试验表明，重复修剪可作为分离突变体和选月季新品种的重要手段之一。     

突变频率随机波动对基因频率稳态分布的影响

本文采用扩散近似法,从理论上探讨了突变频率的随机波动对生物群体内基因频率分布的影响,进而给出了多种情形下的平衡基因频率更准确的估计式。     

KB表的应用

本文说明了KB表的设计原理、扩展了KB表的应用:如突变率差异的检验行为遗传学分析、种子质量检验分析、测交分析、工业产品质量分析等。     

~(60)Co-γ射线与NaN_3复合处理小麦的诱变效应——Ⅱ.诱变二代的突变频率

用不同照射量60Co-γ射线与10~(-3)M的NaN_3复合处理不同世代小麦风干种子,M_2代诱变效果表明:复合处理较单一辐照处理的矮杆、早熟及穗形突变频率提高,诱发多位点突变的能力较强,复合处理显示相互协和效应.诱发有益性状突变的最佳剂量组合为250 G_y+NaN_3.     

FMO3基因突变频率在4个傣族群体中的分布

采用PCR-RFLP方法对云南同一个少数民族4个不同地区的傣族群体进行FMO3基因突变频率分析,发现FMO3基因突变频率在这4个群体间有差异.