绝经前的健康女性中瘦体重、体脂含量和骨密度的关系

从长沙地区的汉族人群中征集了878名年龄在20~45岁绝经前的健康女性样本,采用Hologic QDR4 500 W双能量X射线骨密度仪(DXA)来测量腰椎(L1-4)、髋部和全身其他部位的骨密度、瘦体重、体脂含量.应用SAS软件进行瘦体重和体脂含量与骨密度的Pearson相关分析和多元回归分析.发现瘦体重和体脂含量都与骨密度正相关,而且瘦体重对骨密度变异的贡献是8.0%~11.4%,体脂含量对骨密度变异的贡献是0.2%~2.5%.表明在绝经前的健康女性中,瘦体重是比体脂含量更加重要的决定骨密度变异的因素.     

利用病例-父母设计的候选疾病易感基因的LOD值排除分析

已有的一种LOD值排除方法,可在随机群体样本中反过来检测引起复杂疾病和数量特征的候选基因的重要性.LOD值排除方法是常规关联分析的有效补充.虽然与传统的关联分析相比,方法更加保守,但是仍然受到群体分层的影响.为了控制群体异质性所带来的混杂影响,文中通过病例-父母设计,发展了一种LOD值排除分析方法.这种方法与连锁分析中的排除分析是相似的.观测到的核心家系数据的似然函数可以构建多项分布式:L=n!/Ⅱi,j nij! Ⅱi,j(pij)nij.其中nij是父母配对类型为i而受累子代的基因型为j的家庭个数,pij为有一个受累子代的核心家庭中父母配对类型是i而受累子代的基因型为j的核心家庭的条件概率.这个似然值是基因频率和被检测遗传标记的相对风险的函数.在这种方法中,能够分析候选基因的特定遗传效应和遗传模型.如果LOD值≤-2.0,检测位点没有含有比特定位点更大的效应而被排除.我们进行了模拟研究来检测排除分析中遗传效应和遗传模型的功效.模拟表明,这种方法有一定的合理功效来排除一个具很小遗传效应的候选基因.与核心家系中传递不平衡检验(TDT)关联分析相似的是,该排除分析一般不受群体混层的影响.排除分析可以作为排除不含有或者含很小遗传效应的候选基因的TDT分析方法的补充.这种方法已经被用来检测维生素D受体对骨质疏松症的重要性.     

全基因组关联分析显示基因ANXA8和C10orf11为影响肌少症的候选基因

为了寻找与瘦体重(lean body mass,LBM)相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及易感基因,在1 000个不相关的白人中采用Affymetix 500K芯片扫描了500 000个SNPs,并进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),显著结果在1 625个中国人样本和2 283个欧洲白人样本中进行验证,并将验证结果与研究结果进行荟萃分析。研究发现SNPsrs7905603,rs9416083,rs4409772,rs2894310与LBM关联,其中rs7905603位于基因ANXA8,其他3个SNPs位于基因C10orf11。荟萃分析得到的合并p值分别为2.08×10-5,7.44×10~(-6),6.73×10~(-6),6.76×10~(-6)。ANXA8和C10orf11基因是影响LBM变异的候选基因,这对肌少症的认识提供了新的理论依据。     

利用病例-父母设计的候选疾病易感基因的LOD值排除分析

已有的一种LOD值排除方法，可在随机群体样本中反过来检测引起复杂疾病和数量特征的候选基因的重要性. LOD值排除方法是常规关联分析的有效补充.虽然与传统的关联分析相比，方法更加保守，但是仍然受到群体分层的影响.为了控制群体异质性所带来的混杂影响，文中通过病例父母设计，发展了一种LOD值排除分析方法.这种方法与连锁分析中的排除分析是相似的.观测到的核心家系数据的似然函数可以构建多项分布式： L= （p_ij）n_ij.其中n<>subij是父母配对类型为i而受累子代的基因型为j的家庭个数，p_ij为有一个受累子代的核心家庭中父母配对类型是i而受累子代的基因型为j的核心家庭的条件概率.这个似然值是基因频率和被检测遗传标记的相对风险的函数.在这种方法中，能够分析候选基因的特定遗传效应和遗传模型.如果LOD值≤-2.0，检测位点没有含有比特定位点更大的效应而被排除.我们进行了模拟研究来检测排除分析中遗传效应和遗传模型的功效.模拟表明，这种方法有一定的合理功效来排除一个具很小遗传效应的候选基因.与核心家系中传递不平衡检验（TDT）关联分析相似的是，该排除分析一般不受群体混层的影响.排除分析可以作为排除不含有或者含很小遗传效应的候选基因的TDT分析方法的补充.这种方法已经被用来检测维生素D受体对骨质疏松症的重要性.