并行计算在生物信息学中的应用

本文给出了一种在生物信息学中计算分子静电势的加速并行算法,分别在mpich和openmp环境下对1A30蛋白质(HIV-1PROTEASE)进行了计算,最后给出了结论。     

矩阵乘法的并行计算及可扩展性分析

针对科学与工程计算中的大型矩阵乘积，与原有的串行算法相比照，利用向量外积法，构造了一种适用于多处理机系统的并行算法，给出了算法及实现过程，并进一步分析了算法的可扩展性．     

并行CORBA在网络并行计算中的应用研究

讨论了一个通用对象请求代理体系结构(CORBA)的扩展一并行CORBA，井详细分析了它的原理．以油气储层随机建模计算模型为例，研究了基于并行CORBA的油气储层随机建模计算模型，实现了基于并行CORBA技术油气储层随机建模的软件．结果表明，并行CORBA技术大大提高了油气储层随机建模的计算效率，有效地利用了网络资源．     

一个支持并行计算的前后台操作系统

针对并行计算机系统对操作系统的需求，分析了ＭＳＯＤＳ和ＵＮＩＸ中存在的问题，提出了一个能有效支持并行计算的前后台操作系统，着重讨论了系统的设计思想和实现技术。     

从公理语义看UNITY模型和GAMMA模型的关系

ＧＡＭＭＡ和ＵＮＩＴＹ都是面向问题描述的程序设计语言．ＵＮＩＴＹ开发了一种公理语义规范语言，即ＵＮＩＴＹ逻辑，描述和推导程序的特性．这一规范语言也可以很自然地移植到ＧＡＭＭＡ模型上去．基于上述语义规范，给出一个将ＵＮＩＴＹ程序变换成ＧＡＭＭＡ程序的保语义等价性的程序变换方法，从而证明了ＧＡＭＭＡ模型的描述能力强于ＵＮＩＴＹ模型     

一种多传感器图像并行融合新方法

小波包变换能够为图像融合提供非常精细的分析。但是,在图像较大时融合的计算量大,耗时长,难以进行快速、实时融合。通过对小波包融合方法在单处理机上的执行效率的分析,针对算法固有的时间复杂性和并行性,提出了一种分布存储环境下的小波包并行融合算法。该算法针对小波变换计算的数据局部性特点,设计并实现了基于Pentium PC和1000Mbps交换式以太网的机群系统的MPI(Message Passing Interface)并行环境的并行小波包图像融合方法。针对不同大小图像、以及不同的集群规模,分析了并行计算的性能。在机群系统上对算法进行实现,结果表明该算法具有良好的并行性能。     

基于区域分解的并行SIMPLER算法研究

在同位网格上建立了基于重叠型区域分解的并行SIMPLER算法，给出了区域划分和数据交换的实施细则．并在集群系统下通过对顶盖驱动方腔流进行模拟验证了算法的可靠性．数值结果表明，加速比成线性增加，随着计算规模的增大，并行效率可达到95％以上．     

一类刚性系统基于线性多步法的并行计算方法

针对一类分解的刚性系统,提出了一类并行组合方法.该方法将系统分割与方法分割的并行化方法相结合,采用显式线性多步方法求解非刚性子系统,采用隐式线性多步方法求解刚性子系统.讨论了方法的相容阶、收敛性和数值稳定性.数值试验结果表明,该方法对于求解分解的刚性系统是可行的.     

基于DPPEJ的并行计算研究

对DPPEJ(Distributed Parallel Programming Environment for Java)软件包的工作原理作了详细的介绍,并采用Java语言实现了运行于DPPEJ环境下的FFT迭代算法和递归算法的并行计算程序.通过对实验数据的性能分析表明,由于Java代码的简单性和可移植性,基于DPPEJ的Java并行计算程序通过使用RMI远程方法调用可以较好地利用网络环境下的计算资源进行分布式的并行计算,具有一定的应用前景.     

基于并行计算的消声器三维数值模拟

针对某款汽车复杂消声器建立了三维数值计算模型,采用并行计算技术对该模型进行计算．通过分析数值计算结果,找到该款消声器产生压力损失和再生噪声的主要部位分别是消声器进气内插管开孔处和出气内插管的进口处．据此提出了相应的改进方案．计算结果显示,改进后消声器的背压比原消声器背压大幅度下降,最大可下降20%左右．这种基于计算流体力学理论结合并行数值模拟技术的设计方法,计算一个算例仅需20 min左右,降低了设计周期和设计成本．