Accurate localization and excision of genomic islands in four strains of <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas aeruginosa</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas fluorescens</Emphasis>

Mobile genomic islands (GIs) can be excised from the chromosome, then form a circular intermediate and be reintegrated into the chromosome by the GI internal integrase. Some mobile GIs can also be transferred into a new receptor cell by transformation, conjugation, or transduction. The action sites of the integrase are usually flanked direct repeats (DRs) of the GIs. Accurate localization of the flanking sequences is a precondition for determining the mobility of the GI. Mobile GIs are generally associated with transfer RNAs (tRNAs). Based on the correlation between flanking sequences and tRNA sequences, the flanking sequences of 11 putative mobile GIs in Pseudomonas aeruginosa PAO1, P. aeruginosa PA14, P. fluorescens Pf-5 and P. fluorescens Pf0-1 were identified. Among the 11 GIs, Pf0-1GI-1 is responsible for benzoate degradation. PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3, and Pf5GI-4 were confirmed experimentally to be excised from a chromosome to form a circular intermediate. The action sites of the integrases are these GIs direct repeats. Due to distinct DRs, cutting sites for the internal integrase of PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3 and Pf5GI-4 were determined outside the T-loop of the tRNA^Gly gene, outside the anticodon loop of the tRNA^Ser gene and tRNA^Lys gene, and at the asymmetric 3′-end of the tRNA^Leu gene, respectively. PAO1GI-1 and other mobile GIs may be transferred into many different strains that belong to different phyla because of the clear flanking sequences. This study describes basic information about the action sites of the integrases, assesses the mobility of GIs, and can help design and transfer mobile GIs to candidate strains.     

浅谈竹荪褐发网菌病害的防治

近年来,武夷山竹荪大面积暴发粘菌-褐发网菌Stemonitis fusca Roth(李玉教授鉴定,以下称褐发网菌),造成严重损失。褐发网菌已成为竹荪栽培的一种严重新病害,但由于褐发网菌是近三四年刚发生的一种新病害,许多菇农对它认识尚不全面,叫法不一,用药也不一。菇农有叫黑孢菌、灰毛菌、黄毛菌,也有叫黑炭菌等。     

外媒称腐败可能断送中国经济奇迹

去年11月上海的大火和今年的动车事故之间有什么联系？美国西北大学教授史宗瀚认为，这都是“权力寻租”惹的祸。他指出，类似上海火灾揭露出来的那种腐败模式，正威胁着数百万中国人的生命。     

中国海洋鱼类单殖吸虫研究XX. 格氏虫属一新记录

记述采自广东汕头鲐Scomber japonicus Houttuyn鳃上的1种单殖吸虫――澳洲格氏虫Grubea australis Rohde, 1986。所获标本与Rohde的原始描述基本一致，但在小生殖钩数目、卵壳结构、后吸器粘附性肌肉的发达程度及后吸器占体长比例等方面略有差异。澳洲格氏虫为我国新记录。     

3种中草药对克氏原螯虾抗菌活性的影响

将陈皮、甘草、淫羊藿3种中草药粉碎过筛后,再用醇提法分别提取其有效成分,将其制备出的浓缩液按质量分数5%的比例添加于基础饲料中制成颗粒药饵投喂克氏原螯虾,以基础饲料为对照组,研究3种中草药对克氏原螯虾抗菌活性的影响。结果表明,3种中草药能有效地抑制大肠杆菌、嗜水气单胞菌、金黄色葡萄球菌、溶壁微球菌。其中,甘草、成皮和淫羊藿对4种细菌的平均抑菌率达到59.14%、47.53%和48.65%。实验证明,甘草、陈皮和淫羊藿这3种中草药均能不同程度地激活克氏原螯虾的免疫力,可以作为免疫增强剂应用于克氏原螯虾的生产。     

本氏烟ORSV和CymMV病毒的侵染性检测及鉴定

以本氏烟为研究材料,分别接种感染齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)和建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)的蝴蝶兰病汁液,通过免疫捕获RT-PCR( IC-RT-PCR)和Western-Blot等分子免疫分析手段,发现这两种在兰花上常见的病毒均能侵染烟草.研究结果为建立有效的多年生兰科植物常见病毒的实验室模式寄主,更深入高效地研究这两种病毒的发病机制提供了有效材料.     

天然产物中乙酰胆碱酯酶抑制剂的研究现状

抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)是目前治疗阿尔茨海默氏病(AD)最有效的方法,而丰富的自然资源是开发乙酰胆碱酯酶抑制剂的宝库.介绍了作为开发乙酰胆碱酯酶抑制剂的天然产物的研究现状,归纳了一些重要的具有乙酰胆碱酯酶抑制剂的植物种类、植物中抑制AChE的活性成分以及一些微生物来源的乙酰胆碱酯酶抑制剂.     

大黄欧文菌中蔗糖异构酶基因的克隆表达及应用

以大黄欧文菌(Erwinia rhapontici)NX-5基因组DNA为模板,PCR扩增得到编码蔗糖异构酶(SIase)的基因palⅠ,构建克隆载体pUC18-palⅠ。经测序正确后,将palⅠ亚克隆至表达载体pET-22b(+)上,并在E.coliBL21(DE3)中成功表达相对分子质量约为66 000的可溶性蛋白。通过Ni-NTA柱对表达产物进行纯化,纯酶的比活为40 U/mg。转化条件研究表明:重组菌能够高效转化质量分数为50%的蔗糖溶液,转化液中异麦芽酮糖得率为85%。     

一起食物中毒事件的流行病学分析

目的通过对一起疑似食物中毒的调查分析,探讨其发病原因及预防措施。方法根据流行病学调查资料、临床表现和现场卫生学资料及实验室检验结果进行分析。结果在43位患者的肛拭子及1份食品（盐蛋黄）样品中均检出弗氏柠檬酸杆菌,其他病原菌均未检出。提示这是一起由于食用了被弗氏柠檬酸杆菌污染的盐蛋黄而引起的细菌性食物中毒。采取控制措施后,事件得到迅速控制,没有发生重症病例和死亡病例。结论应进一步加强对宾馆等饮食行业的卫生管理。     

铜绿假单胞菌医院感染流行病学分子研究及基因分型

目的建立随机扩增多态性DNA（RAPD）基因分型方法检测铜绿假单胞菌（PA）,调查铜绿假单胞菌医院感染流行病学的情况,为控制院内感染提供直接可靠的参考依据。方法对2008—2009年分离的180株铜绿假单胞菌进行统计分析其临床分布;通过抗生素敏感性试验进行抗菌谱分型;再采用PAPD基因分型方法进行分析。结果标本主要来自ICU、烧伤科、呼吸内科等。从痰液标本中分离的铜绿假单胞菌占58．9％,其次伤口分泌物标本占18．9％、中段尿16．7％,其它类型标本占5．5％。抗菌谱分型分为5型。180株铜绿假单胞菌用RAPD分型共得178株,分型率98．9％（178／180）,分为9种类型：Ⅰ～Ⅸ。结论RAPD分型技术对铜绿假单胞菌临床分离株分型率较高;同一抗菌谱型的基因型可能不同,同一基因型的抗菌谱也可能不同。