豇豆SSR标记在豌豆中的可转移性与应用初探

利用豇豆SSR引物筛选在豌豆具通用性的SSR引物。13对豇豆SSR引物中检测出8对引物在豌豆中可扩增,其中5对SSR引物表现出多态性,进而分析11个豌豆品种和5个豇豆品种的遗传多样性与遗传关系。结果表明:平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均Shannon指数,在豌豆品种群中分别为2.00、1.64、0.55,豇豆品种群中分别为2.00、1.80、0.53,上述遗传参数反映出供试豌豆品种和豇豆品种具有中等水平的遗传多样性;利用UPGMA聚类分析,能将豌豆品种群和豇豆品种群分为两类,且每个品种群内的各个体之间能进行区分,尤其是两个豌豆品种亚群的聚类结果与其地理来源基本一致。     

微卫星标记在人参和西洋参鉴别中的应用

从GenBank中寻找含有简单重复序列(SSR)位点的人参DNA片段序列,设计SSR引物,挑选PCR扩增条带清晰的引物,对人参和西洋参进行PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,选择能够区别2个种的引物.共有来自8个SSR位点的9对引物能扩增出可区分人参和西洋参的特异性片段,其中7对SSR引物在西洋参中能稳定地扩增出特异性...     

图书馆图书订购的两种预测模型性能比较

基于重庆医科大学图书馆的中文图书流通数据与订购数据,用相对残差平方和预测效益对图书馆图书流通与订购数据进行比较分析,并分析了两种预测模型的性能,指出正比模型比线性模型有更为优越的性能。     

适用于野生软枣猕猴桃遗传多样性分析的SSR引物筛选

为进一步研究野生软枣猕猴桃种质资源的遗传多样性,以软枣猕猴桃基因组DNA为模板,优化了SSR反应体系并确定了反应条件,筛选出了多态性较高的标记.从来自中华猕猴桃基因组的65对SSR引物初步筛选出15对有较好扩增带型、增稳定性好的引物,其中较好多态性的引物有12对.用筛选的引物进一步对四川天全二郎山的野生软枣猕猴桃群体进行了SSR分析,在15个个体中共检测出了141个等位基因,平均每个位点检测到9.4个等位基因,平均PIC值为0.745.     

贵州西山系列玉米杂交种SSR标记纯度鉴定的研究

以11个贵州西山系列玉米杂交种及相应的15个亲本自交系为材料,采用SSR（Simple Sequence Repeat）分子标记方法,从60对多态性高的引物中分别筛选了双亲互补型特异引物,并利用特异引物进行玉米杂交种纯度鉴定的检验．     

Genetic diversity and construction of core collection in Chinese wheat genetic resources

Genetic diversity among 5029 accessions representing a proposed Chinese wheat core collection was analyzed using 78 pairs of fluorescent microsatellite （SSR） primers mapped to 21 chromosomes. A stepwise hierarchical sampling strategy with priority based on 4×10^5 SSR data-points was used to construct a core collection from the 23090 initial collections. The core collection consisted of 1160 accessions, including 762 landraces, 348 modern varieties and 50 introduced varieties. The core accounts for 23.1% of the 5029 candidate core accessions and 5% of the 23090 initial collections, but retains 94.9% of alleles from the candidate collections and captures 91.5% of the genetic variation in the initial collections. These data indicate that it is possible to maintain genetic diversity in a core collection while retaining fewer accessions than the accepted standard, i.e., 10% of the initial collections captured more than 70% of their genetic diversity. Estimated genetic representation of the core constructed by preferred sampling （91.5%） is much higher than that by random sampling （79.8%）. Both mean genetic richness and genetic diversity indices of the landraces were higher than those of the modern varieties in the core. Structure and principal coordinate analysis revealed that the landraces and the modern varieties were two relatively independent subpopulaUons. Strong genetic differentiation associated with ecological environments has occurred in the landraces, but was relatively weak in the modern culUvars. In addition, a mini-core collection was constructed, which consisted of 231 accessions with an estimated 70% representation of the genetic variation from the initial collections. The mini-core has been distributed to various research and breeding institutes for detailed phenotyping and breeding of genetic introgression lines.     

小麦染色体2DS雌性育性位点遗传多态性分析

小麦雌性不育系XND126属于生态遗传型不育系.通过SSR分子标记分析,在2DS染色体上定位了一个雌性育性主效QTL位点.为了构建高密度遗传图谱并精细定位该主效位点,用2DS参考遗传图谱上的14对SSR标记,研究了59个育性正常的普通小麦品种与XND126的DNA多态性,筛选到不同生态型多态性较高的品种共12个,每个品种多态性标记达12~13个,这些品种可以用作杂交亲本,构建新的QTL精细定位群体.在品种组成的群体中,与主效基因位点最近的标记,表现出有较多的品种与雌性不育系具有差异.     

DNA分子标记的发展及主要技术

DNA分子标记技术是一种新的比较理想的遗传标记,本文综述了DNA分子标记技术的发展概况、种类及特点,以及广泛应用于农作物分子标记基因定位的分子标记技术：限制性片段长度多态性（RFLP）,随机扩增多态性DNA（RAPD）,简单序列长度多态性标记（SSR）和扩增的限制性内切酶片段长度多态性（AFLP）的原理、特点及他们的优缺点。     

吉林省主推中晚熟期玉米品种DNA指纹库的构建

以吉林省中晚熟期的43个玉米品种为材料, 从玉米胚中提取基因组DNA并利用10对简单重复序列(SSR)引物进行扩增, 扩增产物经质量分数为8%的聚丙烯凝胶电泳检测, 获得了清晰稳定的图谱, 初步建立了吉林省中晚熟期玉米43个品种的DNA指纹库.     

球状轮藻叶绿体全基因组的组装与特征分析

为揭示球状轮藻叶绿体全基因组的特征以及探究其在轮藻科内的系统发育关系,本研究基于高通量测序技术对其叶绿体全基因组进行组装和序列分析.结果表明:球状轮藻叶绿体基因组全长180 652 bp, GC含量26.6%,具有典型的四分体环状结构,与普生轮藻十分类似;球状轮藻叶绿体基因组共注释出137个基因,其中包括94个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因,比无色丽藻多2个蛋白质编码基因和3个tRNA基因,与高等植物相比具有rpl12、trnL(gag)、rpl19、ycf20四个特殊基因;球状轮藻叶绿体全基因组共检测出87个SSR位点且绝大部分由A和T构成;此外,球状轮藻共包含24 989个密码子且密码子使用更偏好A和T,亮氨酸(Leu)是编码氨基酸最多的密码子;通过邻近法(NJ)对包括球状轮藻在内的5个种的叶绿体全基因组构建系统发育树显示,球状轮藻的亲缘关系与普生轮藻更为接近.本研究对球状轮藻叶绿体全基因组进行了解析,利用现有数据确立其系统发育学地位.