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101.
利用生物信息学筛选差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),构建前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)单细胞层面lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,在分子水平上研究前列腺癌的发生发展过程及预后指标。首先从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库分别下载单细胞RNA测序数据GSE157703和转录组测序数据TCGA-PRAD,通过R语言筛选差异表达信使RNA (DEmRNA)和差异表达长非编码RNA (DElncRNA),利用相关软件预测并构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络;然后使用R语言进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,运用STRING数据库、Cytoscape软件建立蛋白相互作用网络,同时对单细胞RNA测序数据进行质控、降维、聚类和分群,构建单细胞层面的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络;最后进行生存分析,通过人类蛋白质图谱进行验证。结果显示,共得到3 013个DEmRNA和1 101个DElncRNA,筛选出51个lncRNA、27个miRNA和97个mRNA构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。GO分析揭示靶基因在腺状细胞迁移、化学突触传递的调节等生物学过程富集,KEGG分析揭示miRNA在癌症、轴突导向和胞间的黏附等信号通路富集。通过PPI得到Top 10基因,据此整合单细胞水平上PCa单细胞转录组测序数据,得到包括肿瘤细胞在内的9个细胞群的多条精确的lncRNA-miRNA-mRNA调控轴。生存分析结果显示,ITGA2、PDLIM5H和PRRG4低表达组的无病生存期显著高于高表达组(P<0.05),免疫组织化学验证了上述基因在肿瘤组织中均有不同程度的表达。本研究成功构建了PCa单细胞水平的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,并发现其不仅参与PCa的发生和发展,同时在临床预后预测方面也有重要意义。 相似文献
102.
飞机离场优化排序对于缓解跑道拥挤现象、提升作战体系出动效率具有重要意义。针对军航双跑道离场优化排序问题,首先建立了基于飞机在预定空域形成“任务包”时间最小为目标函数的优化排序模型,然后设计了一种基于精英反向学习策略和黏菌觅食行为的改进海洋捕食者算法进行求解,最后通过一个仿真实验,与其他算法的优化结果进行对比,改进的海洋捕食者算法使得“任务包”形成时间明显缩短,有效提升了作战飞机的出动效率,可以应用于解决飞机离场优化排序问题。 相似文献
103.
海神单胞菌属(Neptunomonas)于1999年被首次鉴定,目前包含8个菌种,其中6个已经完成全基因组测序。本文总结了海神单胞菌属的菌种特征和基因组信息,并利用基因组测序数据对该菌属的碳源利用途径、聚羟基脂肪酸酯代谢途径和芳香族化合物降解途径进行了分析。研究发现,海神单胞菌属具有完整的糖酵解和乙酸利用途径,普遍含有Ⅰ型和Ⅲ型的聚羟基脂肪酸酯合成酶,存在芳香族化合物的降解途径。基因组测序数据分析结果可以为海神单胞菌属在聚羟基脂肪酸酯合成与环境治理保护等领域的应用提供理论依据。 相似文献
104.
105.
以非钟控判优逻辑电路为例,探讨了判优逻辑电路的分类标准、类型定义及相互关系,给出了各种判优逻辑的实现电路,并就各种判优逻辑电路的性能和可行性进行了论述.研究结果不仅说明了判优逻辑电路具有不同的工作方式和应用环境,还有助于指导设计人员选择判优逻辑电路,设计高智能芯片. 相似文献
106.
介绍了一种新型的生物膜反应器 :以陶粒为载体的序批式生物膜反应器 .并求出了在设定的工艺条件下的氧传递系数 .结果表明 :本反应器有较强的氧传递输送能力 ,能满足微生物的有机物代谢和降解有机污染物的需要 相似文献
107.
研究了服务台可修的具有强占-继续型优先服务规则的多类顾客成批到达排队系统,用补充变量法得到了该系统主要的排队论指标和服务台的可靠性指标。 相似文献
108.
采用两相厌氧 - SBR法处理桂林市瓦窑米粉厂的生产废水 ,即在 SBR池前利用两相厌氧池进行预处理 ,减少 SBR池的有机负荷 ,节约投资 ,同时 SBR池不设污泥处理设施 ,占地面积仅 85 m2。一年多的实际运行情况表明 ,米粉厂生产废水经两相厌氧预处理后 ,BOD和 CODcr的去除率分别为 31.0 %和 5 3.0 % ,BOD和 CODcr分别降解到 5 87mg· L- 1 和 75 3mg· L- 1 ,BOD/ CODcr≈ 0 .78。经过 SBR池后 ,BOD和 CODcr分别降解到 2 4 .3mg· L- 1 和 77.1mg· L- 1 ,达到国家规定的《污水综合排放标准》(GB8978- 96 )的新改扩一级标准。 相似文献
109.
考虑n个独立工件单机作业排序,每个工件设置CON交货期(constantdue-dae)目标是确定CON交货期的最优值和工件的最优排序,使工件的滞后总值最小。提出了这个问题的线性规则模型,然后利用线性规划对偶问题推导出CON交货期的最优值和最优排序。 相似文献
110.
论述了当各工序最早开工时间相同时由平行工序转为顺序工序的最优排序问题。通过对特殊的n元序链的优化理论的研究,给出了解决问题的一种方法。 相似文献