坡面方胸材小蠹鉴定与风险分析

【目的】 杨树是我国主要的人工林造林树种,同时也是重要的绿化和用材树种。准确鉴定枯死杨树内小蠹虫的种类,并确定其在中国境内的风险大小,为该小蠹虫的防控提供理论参考。【方法】 采用传统的形态学鉴定方法,观察和测定小蠹虫(采自江苏东台林场枯死杨树内的样本虫株JSYC-beetle)头部、前胸背板、触角以及鞘翅等形态指标,初步判定小蠹虫的分类地位;使用CTAB法提取小蠹虫的基因组DNA,使用小蠹虫28S rDNA、COI和CAD基因引物分别对基因组DNA进行扩增,扩增产物经过生物公司测序、拼接,在NCBI网站进行同源性分析比对,选择同源性排名前10~15的相似序列,以NJ法分别构建3个基因系统进化树,根据系统进化树的聚类结果对小蠹虫JSYC-beetle进行分子鉴定。为预测小蠹虫的危害性,根据有害生物危险性评价定量分析方法对小蠹虫JSYC-beetle在中国的分布和潜在危害进行风险分析。【结果】 小蠹虫JSYC-beetle雌虫体色红褐色至黑色,体长3.3~3.7 mm,宽1.49~1.64 mm;雄虫体色黄褐色,体长2.264 mm,宽1.195 mm。虫体具有金属光泽,触角鞭节5节,第1节长度小于其余各节,触角末节球状,有2条明显的横缝。复眼肾形,头部藏在前胸背板下,前胸背板近方形,凸出明显,前缘阔圆形,宽略大于长,前半部分分布鳞状齿,后半部分光滑。小盾片舌状,鞘翅宽略大于前胸背板的宽度,鞘翅斜面从基部至端部逐渐倾斜,鞘翅轮廓如舌,鞘翅列间部上的刻点与沟内刻点大小相近,分布均匀,鞘翅茸毛长。前足胫节具有8~14个齿瘤不等,第1跗节小于其余跗节长度之和。以上形态比对结果表明小蠹虫JSYC-beetle的形态特征与坡面方胸材小蠹形态特征最为相似;28S rDNA、COI和CAD基因扩增产物经琼脂糖凝胶电泳结果表明,3对引物均能扩增出单一、明亮条带,其中COI 基因扩增出的条带大小在700~1 000 bp,28S rDNA基因扩增的条带大小约为500 bp, CAD 基因扩增出的条带大小在400~500 bp。NCBI序列比对结果显示COI、28S rDNA以及CAD序列均与坡面方胸材小蠹同源性最高,其相似性依次为99.14%、99.38%和99.36%;以NJ法构建的系统进化树结果显示小蠹虫JSYC-beetle均与坡面方胸材小蠹虫聚在一个分支上,进一步表明小蠹虫JSYC-beetle虫株与坡面方胸材小蠹关系最近,基于小蠹虫JSYC-beetle虫株形态学和分子生物学鉴定结果,最终将枯死杨树内小蠹虫JSYC-beetle虫株鉴定为坡面方胸材小蠹。风险分析结果显示坡面方胸材小蠹风险R值为2.01,在我国属于高危险度生物。【结论】 实验使用小蠹虫是从杨树林采集,经鉴定枯死杨树内小蠹虫为坡面方胸材小蠹,该生物在中国境内属于高危生物,已报可能危害健康杨树。采集地有大量杨树死亡,因此需要加强管理,以防止该生物对杨树及其他寄主植物造成重大危害。     

多胺修饰?-环糊精:钕配合物对萘二胺的分子识别研究

将?-环糊精的6-OH用二乙烯三胺基取代，得到了6-脱氧-二乙烯三胺基?-环糊精(DTCD),在镧系金属NdCl3的存在下，分别与1,5-萘二胺和1,8-萘二胺反应，得到了2种三元超分子配合物，并用核磁共振氢谱对配合物进行了表征。其中主客体分子的化学计量比为2:1，客体分子等价氢原子的信号简并现象在包合前后没有发生变化，表明客体分子在主体空腔保持着对称的构象。2种三元超分子配合物均呈“三明治”式夹心结构。     

Bio-sketches and partitioning of sympatric reed frogs,genus Hyperolius (Amphibia; Hyperoliidae), in two humid tropical African forest regions

Sympatric reed frog species were studied in Gabon (Monts Cristal: Hyperolius mosaicus, H. pardalis, H. tuberculatus) and Kenya (Kakamega Forest: Hyperolius acuticeps, H. cf. cinnamomeoventris, H. kivuensis, H. lateralis, H. viridiflavus). For each taxon, a standardized diagnosis covering 11 aspects of adult and in part tadpole morphology as well as the sequence of a 560 bp fragment of mitochondrial DNA of the 16S ribosomal gene are provided. In addition, behavioural data are given for each species including measurable parameters of advertisement calls. The Monts Cristal Hyperolius species clearly differ in their spatial arrangement through the choice of breeding site. Hyperolius species at the Kakamega Forest share the same breeding sites but in part differ in their activity pattern throughout the year. Advertisement calls of sympatric species in both regions mainly differ in temporal parameters.     

First observations on the phylogeny of the families Gammaridae,Crangonyctidae, Melitidae,Niphargidae, Megaluropidae and Oedicerotidae (Amphipoda,Crustacea), using small subunit rDNA gene sequences

This study examines amphipod phylogeny based on small subunit (18S) rDNA sequence data. Complete sequences of 25 species representing six families were used to test the phylogenetic information content of this gene for reconstruction of amphipod phylogeny. The alignment proved to be informative for most of the studied taxa. The monophyly of the families Gammaridae, Crangonyctidae, Niphargidae and Oedicerotidae is supported. The Melitidae are not monophyletic in the reconstructed topologies, but weak molecular evidence for the monophyly of this group could be observed in spectra of supporting positions. A close relationship of Gammaridae + Melitidae or Gammaridae + Crangonyctidae is not supported, rather there are supporting positions for the incompatible sister-group relationship (Gammaridae + Niphargidae) and (Crangonyctidae + Niphargidae). The molecular evidence is in favour of the latter relationship. The evolution of cephalothoracic apodemes is discussed in the light of other phylogenetic hypotheses resulting from molecular data.     

Champsodontidae (Pisces: Trachinoidei) in the Eastern Mediterranean: how many species are there?

ABSTRACT

Three marine fish species of the Indo-Pacific genus Champsodon were reported as invasive species in the Eastern Mediterranean between 2009 and 2012; Champsodon nudivittis, C. vorax, and C. capensis. These are presumed to invade through the Suez Canal, but only C. nudivittis is known from the Red Sea, so the presence of C. vorax and C. capensis is surprising. To test the validity of the taxonomic identification of these two species, this study combined traditional morphology, genetic barcoding, and photography investigation. Our results demonstrate that only one species, C. nudivittis, has migrated into the Eastern Mediterranean.     

基于ITS2条形码对铁皮石斛及其混伪品分子鉴定的初步研究

通过分析铁皮石斛及其常见混伪品的ITS2序列差异，建立铁皮石斛药材真伪的快速鉴别方法．运用CodonCode Aligner V3．0软件对测序峰图进行校对拼接，基于隐马尔可夫模型的注释方法获得ITS2序列，采用MEGA5．0软件进行序列比对，种内种间距离计算及UPGMA聚类树构建，应用Koetschan等建立的ITS2数据库及网站预测ITS2二级结构．结果表明，铁皮石斛及其混淆品ITS2之间存在明显差异，所有铁皮石斛样品在UPGMA树上单独聚为一类．ITS2序列可以作为DNA条形码用于铁皮石斛与其混伪品的快速分子鉴别．     

分子动力学模拟乙醇／水二元混合物的扩散性质

采用分子动力学方法模拟乙醇／水混合物的扩散性质．模拟中乙醇分子采用点点刚性模型,水分子采用TIP4P模型,在全浓度范围内计算乙醇和水的自扩散系数,分别与实验值和文献的MD模拟值比较．水溶液中,水的自扩散系数描述为结合水分子和自由水分子的综合贡献．计算结果表明,我们采用的乙醇和水的模型对正确描述乙醇／水混合物扩散性质是可行的．     

虚拟实验室在分子诊断学中的应用

虚拟实验室是教学中具有发展潜力的一项技术,它的发展会推动教学模式的改变.文章总结了虚拟实验室技术、教学开设思路及教学实践应用,旨在利用虚拟实验室对分子诊断学教学进行改革创新.     

S2分子电离能的多参考方法计算

应用多组态准简并微扰理论, 计算了S₂分子基态和S⁺₂分子离子基态与激发态的绝热势能曲线, 并拟合光谱参数,  得到了S₂分子9~16 eV的3p电子电离的绝热电离能和垂直电离能. 计算结果表明, S₂分子的第一绝热电离能为9.34 eV, 与实验值(9.356±0.002)eV相符. 比较了其他电离谱带绝热和垂直电离能的理论计算值与实验值, 并分析了误差产生因素,  结合计算结果对S⁺₂(A²Π_u)和S⁺₂(B²Σ^-_g)电离谱带进行了确认.     

分子生物学与基因工程实验模块化教学新模式

针对分子生物学和基因工程实验课程的特点,以及实验教学中存在的问题,通过优化整合实验内容,并对实验内容进行模块化,强化设计性实验,改革实验教学运行模式和教学方法、完善成绩考核评价体系等方面,对分子生物学和基因工程实验教学进行改革。实践证明:通过改革,有效地提高了学生的实验操作能力、实践能力、综合素质和创新能力。