子图的度与 Dominating 圈

笔者利用子图的度给出了如下结果：对2-连通无爪图 G，若任意同构于 K2的不相邻子图 H1，H2，H3满足：d（H1）＋d（H2）＋d（H3）≥｜G｜-1，则 G 的任意最长圈是 Dominating 圈。     

基于对gSpan改进的有向频繁子图挖掘算法

提出的新算法对gSpan算法做了适用性改进,算法所采用的图编码技术与传统的频繁子图挖掘（FSG）,快速频繁子图挖掘（FFSM）,基于先验的图挖掘（AGM）等算法对图结构的编码均不同,由于对有向图进行了新的二维特征定义,因此可使算法适用范围有效地扩展至对有向图的学习,称之为基于对gSpan改进的有向频繁子图挖掘算法（DF...     

关于消去图的一个充分条件

设G是一个图,用V（G）和E（G）表示顶点集和边集,并设g和f是定义在V（G）上的两个非负整数值函数,且g     

第二大特征根不超过1的Cactus

图的第二大特征根与图的直径有着密切的联系,而图的直径对于网络研究有着非常重要的作用,因而研究图的第二大特征根有着很重要的实用价值。确定第二大特征根不超过1的图是图谱中著名的未解决问题,近年来人们得出了一系列关于第二大特征根不超过1的特殊简单图的结论。任意两个圈至多有一个公共顶点的简单连通图称为Cactus。运用找出禁用子图的方法给出了第二大特征根不超过1的所有Cactus。     

THE ASCENDING SUBGRAPH DECOMPOSITION OF K_n-H_(2n-1)

1.IntroductiollAlavi,Y.etal.presentedaconceptofsubgraphdecompositionin[1],whichiscalledascendingsubgraphdecomposition(abbreviatedASD).GivenagraphGwithqedges,C: ,5q5C: ,GissaidtohaveanASD,ifthereisnsuchthatGcanbedecomposedintonsubgraphsGIjGi,''3G.withouti…     

极大平面图中二色树子图的一个必要条件

极大平面图G=(V,E)中的一个二色树子图T=(Vt,Et),其Vt在G中导出子图为树,并且图G存在至少一个四着色C,使T是该四着色一个二色子图的一个连通支.本文证明了Vt的点次和为偶数是它成为二色树子图的必要条件.     

关于不含3正则子图图的最大边数

对无自环、无重边的简单图，Ｅｒｄｏｓ和Ｓａｕｃｅｒ在１９７４年提出如下问题：设 ｆ（ｐ） 是ｐ个顶点的不含３正则子图图的最大可能边数，确定ｆ（ｐ）．本文对ｐ ≥４、４≤ｐ≤４０给出了ｆ（ｐ）的下界，对４ｐ刁≤１６给出了ｆ（ｐ）的值，并对４≤ｐ ≤１５得出了所有的极图．     

Discovering protein complexes from protein-protein interaction data by dense subgraph

High-throughput techniques,such as the yeast-two-hybrid system,produce mass protein-protein interaction data. The new technique makes it possible to predict protein complexes by com-putation. A novel method,named DSDA,has been put forward to predict protein complexes via dense subgraph because the proteins among a protein complex have a much tighter relation among them than with others. This method chooses a node with its neighbors to form the initial subgraph,and chooses a node which has the tightest relation with the subgraph according to greedy strategy,then the chosen node is added into the initial subgraph until the subgraph density is below the threshold value. The ob-tained subgraph is then removed from the network and the process continues until no subgraph can be detected. Compared with other algorithms,DSDA can predict not only non-overlap protein com-plexes but also overlap protein complexes. The experiment results show that DSDA predict as many protein complexes as possible. And in Y78K network the accuracy of DSDA is as twice times as that of RNSC and MCL.     

最短路径子图

在大型网络中两节点之间的最短路径常常不止一条,而且在带限制条件的路径选择等应用上,常常需要找出多条最优或近优的路径.一些经典的单源最短路径算法,如Dijkstra算法,能找出一条从起始点到目的点的最短路径,但并不能求解两点之间的所有最短路径.本文给出了最短路径子图的概念,用于存储图中两节点之间所有最短路径信息,能够节约存储空间.并给出了最短路径子图构造算法SPSG,其时间复杂度为O(n e),比同类算法时间复杂度更低.随机网络模型的仿真结果表明:SPSG算法效率更高.     

一种高效的生物网络概率模体发现算法

针对概率模体发现算法中非树形子图的挖掘和在得分函数最大化的过程中得分函数值计算的2个难点.首先提出基于划分的非树形子图的搜索算法,其次将子图同构应用于最小错配的求解以缩小智能优化算法对得分函数求解的解空间,最后将基于模拟退火算法和遗传算法的混合算法应用于得分函数的求解过程.在大肠杆菌基因调控网络中的实验结果表明,与其他算法相比,混合智能算法可以大大减少非树形子图的搜索时间,并以相对较快的收敛速度收敛到一个较优的解,因此所提出的方法有效地提高了概率模体发现的效率.