浅谈大学本科生物信息学课程建设与教学

针对生物信息学的学科特点和教学现状,初步探讨了该课程本科课程建设与教学过程中的一些工作和体会,重点讨论了如何培养本科生学习兴趣和综合素质,以及如何做到理论与实践相结合,提高学生的实践能力。     

绵羊RARG基因组织表达规律的研究

根据GenBank中报道的绵羊视黄酸受体γ（retinoic acid receptor—gamma，RARC）基因mRNA序列，设计特异性引物，利用Real—time PCR技术对绵羊RARG基因的组织表达规律进行了研究，并对其进行了生物信息学分析，为进一步研究该基因的功能提供线索。结果表明，绵羊RARG基因共编码458个氨基酸，其中亮氨酸所占比例最高，为11．10％；该基因编码产物在系统进化树中与牛的亲缘关系最近；RARG基因编码产物二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主，主要位于细胞核中，是一种水溶性蛋白；Real—time PCR结果显示，绵羊RARG mRNA在心、肝、脾、肺、肾、瘤胃、十二指肠、淋巴、下丘脑、垂体、肌肉、睾丸等12个组织中均有表达，其中在睾丸中表达量最高，推测绵羊RARG基因可能参与机体繁殖机能的调控。     

JAVA在生物信息学和生物医学研究中的应用

本书针对过去几年内生物信息学研究飞速发展所带来的对于开源、可重复利用和面向对象的程序包和软件的需求，集中介绍了JAVA语言所具有的用于解决某些生物信息学和生物医学研究相关问题的功能。与一般编程语言书籍按部就班地介绍一种语言的语法不同，本书主要以生物信息学和生物医学研究中经常遇到的几个普遍问题为例，     

生物信息学基础

本书内容简练而全面，是一本很好的生物信息学教材。本书主要特点有：（1）尽可能避开繁琐的数学公式，详细介绍了算法的技术细节，免去了读者必须具备复杂的计算背景才能理解算法的前提；（2）恰当地使用图例，使读者更容易理解书中的内容；（3）广泛参阅并综合了生物信息学各关键领域的文献，帮助读者尽快掌握生物信息学的全貌。本书不仅介绍了结构生物信息学，还涵盖了比较基因组学和功能基因组学等较新领域的内容。     

RNA生物信息相关软件概述

随着功能性RNA在分子生物学研究的不断深入,出现了很多实用的RNA分析软件,他们功能各异,各具特色,为功能性RNA分子的结构研究提供了许多帮助。本文依据他们的功能介绍了几款较常用的RNA分析软件。     

第13届组合模式匹配国际会议

2004年7月5—7日在土耳其伊斯坦布尔召开的第13届组合模式匹配国际会议（简称CPM’04）是关于生物信息字符串算法方面的会议。会议云集了百余名不同领域的科学家，包括数学家、计算机科学家和生物信息学家。中国有两名代表出席了会议。     

我国现有《生物信息学》教材和网络资源的分析

分析了目前我国出版的14种《生物信息学》教材和有关生物信息学网络资源的特点,探讨了目前我国出版发行的《生物信息学》教材存在的问题,提出应该尽快编写出版系统完整的生物信息学实验操作教材和具有我国原创性的生物信息学教材.     

面肩肱肌营养不良区基因FRG1的生物信息学研究

利用生物信息学数据库和分析工具,对人面肩肱肌营养不良相关基因FRG1和蛋白质(FRG1P)进行了较全面的分析,探讨生物信息学在人类疾病和健康相关基因研究中的作用.以人类基因数据库为基础,利用BioEdit,DNAMAN,Vector NTI等工具软件以及SMART,InterProScan,CPHmodels等在线工具,对FRG1P进行了基本性质分析、分子进化分析、三维结构建模、相互作用蛋白预测.生物信息学分析结合文献查询,对FRG1P的分子生物学给予较全面的评述,FRG1P是研究分子进化的很好的材料.