林木基因组中的微卫星(SSR)及其应用

微卫星ＤＮＡ 是一种简单重复序列（Ｓｉｍｐｌｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｒｅｐｅａｔ,简称ＳＳＲ） ,其核心单位由２～４ 个核苷酸组成,两侧一般是保守序列。由于ＳＳＲ 具有共显性,多态性高,可进行ＰＣＲ 扩增分析,因此是一种很有价值的分子标记。微卫星在林木基因组中广泛存在,其核心单位主要是（ＡＧ）ｎ ,（ＡＣ）ｎ 。现已在许多林木中发现有微卫星,如：松树、杨树、桉树、苹果树。林木的微卫星标记可扩充现有的ＲＦＬＰ、ＲＡＰＤ、ＡＦＬＰ 遗传图谱,以及ＱＴＬ 分析,并应用于基因型鉴别,分子标记辅助选择育种。     

鉴定与水稻光敏核不育基因pms3连锁的AFLP-RFLP标记

运用 ＡＦＬＰ技术对农垦 ５８Ｓ×１５１４的 Ｆ２代群体构建的极端集团进行了分析,在 ２５３对ＡＦＬＰ引物中,９１％具有多态性带,有２０对引物扩增到了阳性带．阳性带经克隆后用作ＲＦＬＰ探针进行极端集团分析,其中４个具有多态性带．２个（Ｆ３和Ｖ４）表现为阳性带．Ｆ２代不育群体ＲＦＬＰ分析结果显示,Ｆ３和Ｖ４两个标记与第１２染色体上的光敏核不育基因ｐｍｓ３连锁．通过极大似然法估算,Ｆ３和Ｖ４标记距光敏核不育基因ｐｍｓ３的遗传距离分别为５.８０ｃＭ和７．７５ ｃＭ．     

动物线粒体DNA的RFLP在家养动物遗传多样性研究中的应用(综述)

对线粒体ＤＮＡ限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）在家养动物遗传多样性研究中的应用现状进行了综述,并对其应用前景进行了展望。众多的研究表明,线粒体ＤＮＡ的ＲＦＬＰ可以作为一个可靠的母性遗传标记用于家养动物起源分化及其亲缘关系的研究方面。我国有丰富的能够适应各种不同生态条件的优良畜禽品种遗传资源,因此利用线粒体ＤＮＡ的ＲＦＬＰ研究其遗传多样性对于探讨其起源分化以及今后合理的利用和保存将有十分重要的理论和实践意义。     

杉木杂种群体分子框架遗传连锁图初报

利用随机扩增ＤＮＡ多态性分子遗传标记－ＲＡＰＤ,以杉木Ｊ０和Ｆ１１两个亲本杂交形成的Ｆ１群体为作图群体,从１０４０个随机引物中筛选出７８个引物,对７８个Ｆ１群体及双亲样本进行了ＲＡＰＤ扩增,共获得１２９个ＲＡＰＤ标记,首次构建了杉木分子遗传连锁框架图,其中Ｊ０亲本包含８个连锁群,标记覆盖的基因组总长度约为５９５．２ｃＭ,Ｆ１１亲本包含４个连锁群,标记覆盖的基因组总长度约为３１５．３ｃＭ。１２９个ＲＡＰＤ标记中偏分离标记占１４．７％。本图谱为构建饱和的杉木分子遗传图谱提供了框架结构,为进一步开展杉木分子遗传方面的研究奠定了基础。     

中国人重症肌无力的遗传易感性研究

重症肌无力与ＨＬＡⅡ类基因关联性在不同人种和民族中具有不同遗传易感性。为探讨中国人重症肌无力（ＭＧ）与ＨＬＡ－ＤＱ分子关联性，采用聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）方法，分析了５０例中国正常人及４９例重症肌无力患者的ＨＬＡ－ＤＱＡ１和－ＤＱＢ１座位的基因型。结果：共检出正常人ＤＱＡ１等位基因８种，ＤＱＢ１等位基因１０种，重症肌无力患者ＤＱＡ１等位基因８种，ＤＱＢ１等位基因９种。结果分析表明ＤＱＡ１＊０５０１与ＭＧ成负相关，ＤＱＢ１＊０３０２与ＭＧ成正相关。从基因水平首次用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法得出中国人重症肌无力ＤＱ分子的易感基因型。     

分子标记在杨树育种上的应用

本文概述了分子标记在杨树指纹图谱构建、遗传图谱构建、QTLs定位、分子标记辅助选择、遗传多样性分析、杂种鉴定等方面的研究进展,同时指明了分子标记在林木研究上的发展趋势.     

分子标记在杨树育种上的应用

本文概述了分子标记在杨树指纹图谱构建、遗传图谱构建、QTLs定位、分子标记辅助选择、遗传多样性分析、杂种鉴定等方面的研究进展,同时指明了分子标记在林木研究上的发展趋势。     

林木RAPD分析及实验条件的优化

随机扩增多态分子标记是目前林木遗传研究中使用最为广泛的一种分子标记,作者对影响ＲＡＰＤ实验的因素进行了分析和探讨,确定了一针对林木进行ＲＡＰＤ分析的实验程序。根据该程序,可以快速确定ＲＡＰＤ实验的理想条件,获得ＲＡＰＤ反应的良好重复性。     

玉米大斑病抗性基因ht2的原位杂交物理定位

通过对与玉米大斑病抗性基因ｈｔ２紧密连锁的２个玉米ＲＦＬＰ分子标记ｂｎｌ１２．３０和ｕｍｃ９３ 色体原位杂交定位,推断了大斑病抗性基因ｈｔ２的物理位置。     

RAPD技术及在遗传分析中的应用

近年来发展起来的随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）在遗传分析许多方面具有广泛的用途，它可在对物种没有任何分子生物学研究的情况下进行分子多态的检测。本文对ＲＡＰＤ技术在家系分析、居群研究、遗传图构建及基因定位方面的应用进行了综述，对在分析中可能出现的假带、ＲＡＰＤ标记显性等问题进行了讨论，并提出在进行ＲＡＰＤ分析中应该注意的问题。     

DNA分子标记与动物育种

论述了DNA分子标记的分类以及限制性酶切片段长度多态性、随机扩增多态性DNA、扩增片段长度多态性、简单重复序列、单核苷酸多态性等5种主要DNA分子标记的基本原理和优缺点。同时，还分析了它们在动物遗传育种中应用情况和发展前景。     

DNA遗传标记与绵山羊遗传育种

综述了分子遗传标记限制性片段长度多态、随机扩增多态DNA、DNA指纹、微卫星DNA、线粒体DNA限制性片段长度多态、扩增片段长度多态DNA等技术的原理、遗传特点，及其在绵羊和山羊遗传育种中的研究现状，并对其在绵羊和山羊育种中的应用前景作了展望。     

石刁柏雄性连锁的AFLP及SCAR标记的建立

目的:对石刁柏雌雄株基因组差异进行分析,筛选雄性或雌性连锁的分子标记.方法:利用限制性片段长度多态性技术,设计了多个引物组合,分别对石刁柏雌雄株基因组进行扩增.结果:在使用的72个引物组合中,引物组合E-AAG+M-CAT从雄性基因组中扩增出了一个雄性连锁的标记(MLDA555),该序列长度为555bp,AT含量为59%.Blast检索未发现相似序列.根据该片段序列设计的引物将该标记转化为雄性连锁的大小为523bp的稳定的SCAR标记,经过不同基因型雄性个体的验证证明该标记广泛存在于不同基因型石刁柏雄性个体中.结论:通过AFLP扩增筛选得到了石刁柏雄性连锁的AFLP和SCAR标记,为石刁柏性别决定机制的理解及石刁柏的分子标记辅助育种提供理论资料和技术支持.     

几种基于基因组DNA的真菌分类技术研究进展

基于基因组DNA的真菌分类技术发展迅速。综述了DNA分子杂交技术,真菌线粒体DNA限制性片段长度多态性(m t RFLP)分析,随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,rDNA序列分析,扩增片断长度多态性(amp lifiedfragm ent length polymorph ism,AFLP)在真菌分类和系统发育中的应用。     

Fine mapping of the rice bacterial blight resistance gene Xa-4 and its co-segregation marker

An F₂ population developed from theXa-4 near isogenic lines, IR24 and IRBB4, was used for fine mapping of the rice bacterial blight resistance gene,Xa-4. Some restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers on the high-density map constructed by Harushima et al. and the amplified DNA fragments homologous to the conserved domains of plant disease resistance (R) genes were used to construct the genetic linkage map around the geneXa-4 by scoring susceptible individuals in the population.Xa-4 was mapped between the RFLP marker G181 and the polymerase chain reaction (PCR) marker M55. The R gene homologous fragment marker RS13 was found co-segregating withXa-4 by analyzing all the plants in the population. This result opened an approach to map-based cloning of this gene, and marker RS13 can be applied to molecular marker-assisted selection ofXa-4 in rice breeding programs.     

分子标记技术及其应用

介绍了DNA分子标记的分类以及限制性片段长度多态性、小卫星(minisatellite)DNA标记、微卫星(mlcrosatellite)DNA标记技术、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)和单核苷酸多态性等主要DNA分子标记的基本原理、优缺点以及它们在人类、动物等研究中的应用概况和展望。     

DNA typing from single hairs

The characterization of genetic variation at the DNA level has generated significant advances in gene and disease mapping, and in the forensic identification of individuals. The most common method of DNA analysis, that of restriction fragment length polymorphism (RFLP), requires microgram amounts of relatively undegraded DNA for multi-locus typing, and hundreds of nanograms for single-locus comparisons. Such DNA frequently cannot be obtained from forensic samples such as single hairs and blood stains, or from anthropological, genetic or zoological samples collected in the field. To detect polymorphic DNA sequences from single human hairs, we have used the polymerase chain reaction (PCR), in which specific short regions of a gene can be greatly amplified in vitro from as little as a single molecule of DNA. We have detected genetically variable mitochondrial and nuclear DNA sequences from the root region of shed, as well as freshly-plucked, single hairs; mitochondrial DNA (mtDNA) sequences have been detected in a sample from a single hair shaft. We have used three different means of DNA typing on these samples: the determination of amplified DNA fragment length differences, hybridization with allele-specific oligonucleotide probes, and direct DNA sequencing.     

鳡鱼群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记技术对长江下游苏州段野生和野生F1代人工养殖的2个鳡鱼(Elopichthys bambusa)群体遗传多样性进行分析研究.6对选择性引物在2个群体47个个体中,共扩增出313个位点,多态位点47个.鳡鱼野生和野生F1代人工养殖2个群体的多态位点比率和Shannon's指数分别为13.42%、8.31%,0.0544、0.032 O;前者遗传多样性较后者略高.基因分化系数Gst 和Shannon's指数分析均显示2个鳡鱼群体之间出现一定遗传分化.鳡鱼UPGMA系统树有分支出现且依据群体分别聚类,表现出一定的遗传趋异.结果分析表明,鲢鱼群体的遗传多样性相对贫乏;野生F1代人工养殖群体尚未形成自己独立的遗传结构,但2个群体间已经产生了一定的遗传分化,经过较多世代的人工繁育有可能形成自己独立而稳定的遗传结构.     

AFLP分子标记在鹀属遗传多样性分析中的初探

利用扩增片断长度多态性（AFLP）技术分析了鹀属(Emberiza)4种鹀(三道眉草鹀Emberi za cioides, 白头鹀Emberiza leucocephala, 白眉鹀Emberiza tristrami, 灰头鹀Emberiza spodocephala)基因组DNA的多态性. 在选取的39对引物中, 有11对能得到重复性好的多态性扩增条带， 每对引物扩增带数为27~76. 共得到535个标记位点, 其中429个为多态位点, 多态位点 比率达801%; 在UPGMA聚类关系图中， 4种鹀聚成一大类， 三道眉草鹀与白头鹀、 白眉鹀与灰头鹀分别两两相聚. 结果表明， AFLP可用于分析鹀属遗传多样性.     

上海地区汉族人单胺氧化酶基因微卫星DNA多态性研究

应用扩增片段长度多态性技术,分析单胺氧化酶基因的ＭＡＯＡ（ＣＡ）。力ＭＡＯＢＩ（ＧＴ）ｎ２个基因座的微卫星ＤＮＡ多态性。在２４６名（男性１２２人,女性１２４人）无血缘关系上海地区汉族人中检出ＭＡＯＡ（ＣＡ）ｎ基因座８－种等位基因（１１０－１２４ｂｐ）和１９种基因型。