鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化：以BangPi鱼类为例

以Bang Pi鱼类为例，研究了鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化规律。识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域。指出扩展终止相关序列（ETAS）的主体是TACAT和它的反向互补序列ATGTA形成的发夹结构。给出了鱼类中若干重要保守序列的普遍形式。研究结果表明，一般情况下，只有一个行使功能的ETAS，但可能会有多个复制的、不行使功能的ETAS存在。鱼类的保守序列CSB2最为保守。线粒体DNA控制区被认为是由各功能单位形成主体框架，主体框架复制产生重复序列，重复序列产生快速变异，这样造成不同类群间线粒体DNA控制区巨大差异。易突变点和二级结构的存在均可能与变异的发生相关。     

生物碱基的反相高效液相色谱分离及血浆分析中的应用

以含１０ｍｍｏｌ．Ｌ＾０１ＫＨ＠ＰＯ４（ｐＨ４．０）缓冲溶液作流动相，在ＹＷＱＧＣ１８柱上，反相高效液相色谱法同时分离胞嘧啶、尿嘧啶、尿酸、鸟嘌呤、黄嘌呤、胸腺嘧啶和腺嘌呤等七种生物碱基，并用于人血浆中胞嘧啶、尿嘧啶、尿酸的测定，结果回收率在９５．２％－１０４．７５之间。     

司他夫定的合成

报道了以四乙酰核糖和胸腺嘧啶为起始原料，经中间体5－甲基尿苷的抗艾滋病药物司他夫定的合成工艺。四乙酰核糖与三甲硅保护的胸腺嘧啶缩合、醇解得到中间体5－甲基尿苷（4），5－甲基尿苷甲磺酰化、环化、溴代后得到2'－溴－3'－甲磺酸酯（7），再经还原消除，去保护得到最终产物司他夫定（9）。总收率46．4％。     

耐热碱性磷酸酯酶基因的DNA序列分析

从栖热菌中克隆到产耐热碱性磷酸酯酶（FD－TAP）基因并进行了DNA序列分析,结果表明此2．0kb的片段含有一个1056bp的开放阅读框,编码501个氨基酸的蛋白质,其N端有一26个氨基酸的信号肽．在起始密码子的上游5bp处有一个5＇－GGAGGT－3＇的SD序列．基因编码区的（G＋C）％为68．7％,第3位密码子（G＋C）％为92．7％．FD－TAP的氨基酸序列与大肠杆菌等生物的碱性磷酸酯酶氨基酸序列比较,相同性为27％,相似性为38％．中央β－折叠区及与活性中心相关的氨基酸残基高度保守．表明FD－TAP具有与大肠杆菌碱性磷酸酯酶相似的结构和作用机制．在相当于大肠杆菌碱性磷酸酯酶的His370至His412两个金属离子结合部位之间,FD－TAP有一72个氨基酸的插入片段,提示该插入片段与FD－TAP的高耐热性相关．     

鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化:以鳑鱼类为例

以鳑鱼类为例,研究了鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化规律.识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域.指出扩展终止相关序列(ETAS)的主体是TACAT和它的反向互补序列ATGTA形成的发夹结构.给出了鱼类中若干重要保守序列的普遍形式.研究结果表明,一般情况下,只有一个行使功能的ETAS,但可能会有多个复制的、不行使功能的ETAS存在.鱼类的保守序列CSB2最为保守.线粒体DNA控制区被认为是由各功能单位形成主体框架,主体框架复制产生重复序列,重复序列产生快速变异,这样造成不同类群间线粒体DNA控制区巨大差异.易突变点和二级结构的存在均可能与变异的发生相关.     

新的田野甾醇阿拉伯糖苷

从海南省三亚附近海域采集的一种豆荚软珊瑚Lobophytum sp。样品中单离出一个新的甾体苷1和7个已知的化合物2－8。通过波谱方法鉴定出它们分别是3－O－β－D－阿拉伯吡喃糖苷－24（S）－24－甲基胆甾醇（1），24（S）－24－甲基胆甾－4－稀－3β，6β二醇（2），△^4(s)（E）－鞘氨醇－正十六碳酰胺（3），柳珊瑚甾醇（4），24－亚甲基胆甾醇（5），鲨肝醇（6），胸腺嘧啶（7）和尿嘧啶（8），其中化合物1是一个新的甾体阿拉伯糖苷。     

BIV92044功能片段的克隆和序列分析

本文克隆了BIV92044毒株的RT段（位于pol基因2254nt～2497nt，编码病毒反转录酶）和env段（位于env基因6060nt～6683nt，编码外膜精蛋白gp100）序列，并对这两段克隆进行了序列分析，结果表明，BIV92044的上述两段与BIVR29的差异很小，序列同源性分别为99％和96％．     

抗口蹄疫病毒siRNA在HEK-293细胞诱导β-干扰素的研究

利用shRNA（shon-hairpinRNA）表达质粒在HEK-293细胞上评估了多个dsRNA诱发产生干扰素（IFN）的能力．结果显示,p3D3（19nt）,pPol（56nt）,p21NT（21nt）和p63NT（63nt）能够诱发IFN-β的产生,其中p3D3和p63NT能强烈诱导IFN-β;而p3D1（19nt）,p3D2（19nt）和pLacZ（83nt）没有明显的IFN-β诱发能力．结果显示,诱发干扰素产生的能力与dsRNA的片段长度没有关系,可能与其序列有一定相关性．     

红藻多糖抗AIDS病毒作用的体外实验研究

本文对红藻多糖提取物的抗ＡＩＤＳ病毒作用进行了体外实验研究．结果表明,红藻多糖（ＲＰ１、ＲＰ２）对ＢＩＶ病毒的生长具有明显的抑制作用,其抑制率分别为８５．９６％和８８．６５％,与临床批准使用的抗ＡＩＤＳ药物叠氮脱氧胸腺嘧啶（ＡＺＴ）［１］（８９．５２％）近似,证实了红藻多糖作为抗ＡＩＤＳ药物的可行性．     

新苄基嘧啶类抗菌药溴莫普林的合成

４－溴－３,５－二甲氧基苯甲醛（２）与β－甲氧丙腈缩合得６１．３％的（Ｚ）－肉桂腈（４ａ）,４ａ经碱性催化１,３－质子转移异构化后与胍环合得６５．６％的溴莫普林（１）．（１）是一种具有广谱抗菌活性的新苄基嘧啶类抗菌药。     

黑线姬鼠线粒体DNA控制区的序列测定及分析

以黑线姬鼠肝脏组织为材料提取线粒体DNA，并以此为模版定向扩增D-loop区．克隆后测序得到的全序列大小为852bp．选取其相对保守序列与欧洲大陆同种黑线姬鼠进行序列比较，发现2个同种不同域的黑线姬鼠亲缘关系很近．通过比较突变位点出现的位置可以推断黑线姬鼠线粒体DNA控制区可分ETAS，central，CSB3个区域．由中心区最为保守这一原则，推测出central区大体位置，central区两侧则为ETAS和CSB区．     

丝石竹花外植体诱导丛生芽的研究

研究了在不同外源激素条件下诱导丝石竹花朵恢复营养生长的过程,结果表明单一生长素仅能诱导花产生愈伤组织,6－BA或6－BA与生长素组合能在完全盛开的诱导花在部产生腑芽并发育成营养枝,在未开放花中能诱导花瓣回复到叶的状态,花瓣已开始萎蔫的花不能诱导逆转。     

Structural basis for self-association and receptor recognition of human TRAF2

Tumour necrosis factor (TNF)-receptor-associated factors (TRAFs) form a family of cytoplasmic adapter proteins that mediate signal transduction from many members of the TNF-receptor superfamily and the interleukin-1 receptor. They are important in the regulation of cell survival and cell death. The carboxy-terminal region of TRAFs (the TRAF domain) is required for self-association and interaction with receptors. The domain contains a predicted coiled-coil region that is followed by a highly conserved TRAF-C domain. Here we report the crystal structure of the TRAF domain of human TRAF2, both alone and in complex with a peptide from TNF receptor-2 (TNF-R2). The structures reveal a trimeric self-association of the TRAF domain, which we confirm by studies in solution. The TRAF-C domain forms a new, eight-stranded antiparallel beta-sandwich structure. The TNF-R2 peptide binds to a conserved shallow surface depression on one TRAF-C domain and does not contact the other protomers of the trimer. The nature of the interaction indicates that an SXXE motif may be a TRAF2-binding consensus sequence. The trimeric structure of the TRAF domain provides an avidity-based explanation for the dependence of TRAF recruitment on the oligomerization of the receptors by their trimeric extracellular ligands.     

Hilbert空间中Bessel列的广义扰动

运用算子理论方法,研究了Hilbert空间中Bessel列的广义扰动,对Hilbert空间H中的任一Bessel列f={fi}i∞=1,给出了序列g={gi}∞i=1={α1(1)f1,α1(2)f1,α2(2)f2,α1(3)f1,α2(3)f2,α3(3)f3,…},g={gi}∞i=1={α1(1)f1,α1(2)f2,α2(2)f2,α1(3)f3,α2(3)f3,α3(3)f3,…},g={gi}∞i=1={∑∞j=1αj(i)fj}∞i=1,成为Bessel列的充分条件。     

内蒙古额吉淖尔盐碱湖一株产视紫红质的极端嗜盐古菌的分离及其bop基因核心序列及最适生长条件的分析

从内蒙古额吉淖尔湖分离得到一株产视紫红质的极端嗜盐古菌,初步鉴定为属于Natrinema属;并扩增出了其bop基因,该bop基因序列已在Genbank中注册,编号为KF863690,分析了其核心序列。结果表明bop基因开放阅读框为303 bp,编码101个氨基酸。blastp结果表明该蛋白属于Bac-rhodopsin蛋白家族,具有典型的细菌视紫红质蛋白结构域。利用BLAST进行相似性分析发现bop编码蛋白氨基酸序列与Genbank中编号AAS87571.1、WP-007110705和AFB77278.1的视紫红质蛋白相似性达到98%以上。此结果表明视紫红质蛋白在细菌及古菌中结构上具有很高的保守性,与其质子泵功能紧密相关。最后分析了该菌株的最适生长条件。该菌株在分离培养基中适宜生长的NaCl浓度范围为1.0~3.0 mol/L,适宜生长pH为6.5~8.5,适宜生长镁离子浓度为0.4~0.8 mol/L。通过分析比较得出该嗜盐古生菌株生长最适NaCl盐浓度为1.5 mol/L,最适pH值为7.5,最适镁离子浓度为0.4 mol/L。该实验结果为今后进一步研究产视紫红质的极端嗜盐古生菌株的生理生化特征及遗传学特征奠定了基础。     

Drosophila genes Posterior Sex Combs and Suppressor two of zeste encode proteins with homology to the murine bmi-1 oncogene.

The Polycomb group (Pc-G) genes are needed to maintain expression patterns of the homeotic selector genes of the Antennapedia (Antp-C) and bithorax (bx-C) complexes, and hence for the maintenance of segmental determination. We report the predicted protein sequence of the Pc-G gene Posterior Sex Combs (Psc), and of the neighbouring and related gene Suppressor two of zeste (Su(z)2). Both genes encode large proteins that contain a 200 amino-acid domain identical over 37.4% that is also conserved in the murine oncogene bmi-1. At the amino terminus of this domain is a cysteine-rich sequence that has been proposed as a novel type of zinc finger.     

草鱼肌肉生长抑制素cDNA克隆及序列分析

利用RT-PCR技术,从草鱼肌肉组织中克隆出MSTN cDNA序列,长度为1764 bp,编码区为1128 bp,共编码375个氨基酸.前体蛋白包括信号肽序列、N端前肽区、蛋白酶水解位点RIRR及C端活性区(含9个保守的Cys残基).多重序列比较表明,草鱼与斑马鱼、黑头软口鲦之间的MSTN序列同源性在94%以上,与其它鱼类之间的序列同源性也较高(78.1%~82.3%),但与鸟类、哺乳类之间的序列同源性则相对较低.系统进化分析显示,不同物种间的MSTN序列同源性基本反映了它们的亲缘关系.     

基于改进的GM（1,1）模型的上海市垃圾产量的预测

GM(1,1)模型是上海市垃圾产量预测的一种有效的方法,但序列的随机波动性难以在GM(1,1)模型得到反映。利用灰色震荡序列GM{1,1}模型,对上海市2000年~2008年垃圾产量进行预测,预测结果表明,此方法能够反映出上海市垃圾产量所具有的波动性特性,得到更高的预测精度。     

计算机辅助的豆壳过氧化物酶分子序列分析

从生物信息学角度 ,利用生物大分子数据库 (GENEBANK、SWISS PROT和PDB)及软件技术 (DNASIS和PROSIS)对豆壳过氧化物酶分子进行了序列分析及结构预测 ;通过与其它植物及真菌来源的过氧化物酶的比较研究 ,分析了结构保守性与功能域的关系 ,从分子水平探讨了植物过氧化物酶超家族的活性位点局部保守序列、折叠模式及序列结构域特征 .     

Isolation of cDNAs Enconding Two Distinct Transcription Factors Binding to DRE cis-acting Element Involved in Cold- and drought-induced Expression of Arabidopsis rd29A Gene

ＩｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎＳｅｖｅｒｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｃｈａｎｇｅｓ ,ｓｕｃｈａｓｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ,ｄｒｏｕｇｈｔａｎｄｈｉｇｈ ｓａｌｔ ,ａｆｆｅｃｔｔｈｅｇｒｏｗｔｈａｎｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆ ｐｌａｎｔｓａｎｄｔｈｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｉｔｙｏｆｃｒｏｐｓ .Ｐｌａｎｔｃｅｌｌｃａｎｎｏｔｏｂｔａｉｎｗａｔｅｒｗｈｅｎｓｕｂｊｅｃｔｅｄｔｏｄｒｏｕｇｈｔｏｒｈｉｇｈ ｓａｌｔｃｏｎｄｉｔｉｏｎ .Ｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅａｌｓｏｒｅｄｕｃｅｓｗａｔｅｒｓｔａｔｅｏｆ …