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相似文献
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1.
一条长3446bp 的人类新基因cDNA已从胎脑cDNA文库中被克隆,该cDNA克隆包长2583bp的开放读框,推测编码一条长860个氨基酸残基的蛋白质,预测分子质量为96.8ku,通过同源性比较及profile搜索,预测氨基酸序列显示出DExH-BOX RNA解旋酶基因家族特有的7保守基序及已知RNA解旋酶氨基酸序列的较高同源性,进一步通过蛋白质结构模型同已知RNA解旋酶结构的比较,可以认定其为一条人类RNA解旋酶基因家族新成员,通过基因编码的氨基酸序列中基序II D-E-V-H残基将其命名为DVH(DEVHbox Helicase),生物信息学手段结合DVH基因表达谱分析结果可推定DVH可能在胎儿发育过程中起作用,由于解旋基因家族同人类遗传疾病关系密切,以上结果可指导DVH基因的进一步功能研究并提示该,基因作为疾病侯选基因的可能性。  相似文献   

2.
为确定桃树细胞质抗寒相关基因,依据模式植物拟南芥中抗寒相关的RBD1基因,结合桃基因组数据设计并克隆到一个桃PpRBD1基因。该基因全长2 230 bp,编码513个氨基酸;结构域分析显示,该氨基酸序列含有RRM(RNA recognition motif)保守结构域,是与拟南芥RBD1同源的蛋白;亚细胞定位预测表明,该基因编码的蛋白可能在叶绿体中表达。该基因可能在桃抵抗寒冷胁迫中发挥重要作用。  相似文献   

3.
人类紫外损伤DNA结合蛋白复合体(UV-DDB)由127 kDa 的DDB1蛋白和48 kDa的DDB2蛋白组成.DDB复合体在核酸损伤修复(NER)过程中起到重要作用.本研究通过RACE技术,获得番茄DDB2的全长cDNA序列(1945 bp),具有一个完整的开放阅读框(160bp),编码的氨基酸序列与拟南芥和水稻的DDB2蛋白分别有65.5%和56.1%同源性.利用半定量RT-PCR技术分析表明,DDB2在番茄根、花、嫩叶和幼嫩的果实等分裂旺盛的组织中表达量较高.同时构建了DDB2基因RNA干扰(RNA interference)载体,并利用根瘤农杆菌介导的番茄转化技术获得转基因植株.  相似文献   

4.
采用RT-PCR和RACE方法获得了斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)三丁基锡结合蛋白(tributyltin-binding protein,TBT-bp)肝脏基因的cDNA全长序列.TBT-bp基因cDNA序列全长836 bp,含696 bp的开放阅读框,编码231个氨基酸.虽然编码蛋白序列与牙鲆(Paralichthys olivaceus)和底鳉(Fundulus heteroclitus)TBT-bp2序列同源性不高(分别为52%、20%),但是保守的信号肽序列结构与二级结构分析提示它们属于同一蛋白家族.系统树分析表明,此次克隆得到的斜带石斑鱼三丁基锡结合蛋白基因cDNA序列属于2型三丁基锡结合蛋白(tributyltin-binding protein type2,TBT-bp2).斜带石斑鱼TBT-bp基因cDNA全序列的获得为海水养殖鱼类中三丁基锡的去毒代谢相关分子机理研究奠定了基础,对今后进一步进行种苗育苗的研发,并以此为依据提高其人工育苗及仔鱼成活率有重要意义.  相似文献   

5.
从人的胎脑cDNA文库到中克隆到1条人原肌球蛋白结合蛋白3(TMOD3)基因,该基因cDNA序列长1402bp,可以编码352个氨基酸残基组成的蛋白,与大鼠,果蝇和线虫的原肌球结合蛋白同源性分别为82%,41%和35%,TMOD3基因定位在人15q21.1-q21.2,位于遗传位标D15S146和D15S117之间,采用基因芯片杂交的方法研究其表达谱概况,发现该基因在多种,组织和细胞中均表达。  相似文献   

6.
从人的胎脑cDNA文库中克隆到一条犬凝集素基因VIP36的人类同源基因,此cDNA序列全长2430bp,拟编码一个382个氨基酸残基的蛋白,它编码的蛋白与犬VIP36有52%的同源性,因此将其命名为人类VIP36L基因,应用辐射杂交方法,钭该基因定位在人2号染色体的分子标记D2S388和D2S113之间,采用基因芯片杂交的方法研究其表达谱情况,发现该基因在胎皮和肝癌组织中表达量较高。  相似文献   

7.
在对AD293和HEK293进行差减杂交以探索两者在吸附和凋亡特性上的差异时,从AD293的高表达文库中分离得到一段新的cDNA片段.从人类胎脑文库克隆得到该基因,全长2 745 bp,编码的蛋白含518个氨基酸,被预测为磷酸泛酰巯基乙胺结合蛋白.该基因在染色体上定位于2p22.3,包含8个外显子.该cDNA编码的蛋白序列含有一个凋亡抑制蛋白5结构域,外皮蛋白重复片段和铜结合辛肽重复片段.RT-PCR分析显示该基因在人类正常组织和癌组织中广泛表达,但在癌组织中表达量相对较低,提示其可能对细胞凋亡有抑制作用.该基因在进化过程中高度保守.  相似文献   

8.
为分析RNA识别区(RNA recognition motif,RRM)在RBM5蛋白调控肿瘤细胞周期中的作用,本研究利用低表达RBM5的A549细胞系构建了A549/Vector、A549/RBM5-WT、A549/RBM5-△RRM三种稳定细胞株,通过流式细胞术检测,发现仅有A549/RBM5-WT能显著阻滞细胞于G1期,说明RRM区是RBM5抑制细胞周期进程必不可少的区域.利用Western Blot检测细胞中cyclin A与Phospho-Rb(ser 795)的蛋白水平差异,证明了RBM5蛋白的RRM能够参与其介导的pRb去磷酸化以及抑制cyclin A表达,从而抑制细胞周期进程.  相似文献   

9.
鉴定和分析肝癌细胞中新的天然反义RNA MEF2D-AS根据已建立的双链RNA文库筛选与肝癌相关的反义RNA.通过RT-qPCR验证其反义RNA的存在,采用cDNA末端快速扩增技术获得其全长序列,并检测HepG2细胞经5-Aza-dC处理前后MEF2D基因正反义链表达量的变化.结果显示,成功鉴定出1条全长为1 265bp的新的天然反义RNA,并预测其属于长链非编码RNA(long non-coding RNA,简称为lncRNA),命名为MEF2D-AS.经5-Aza-dC处理后,MEF2D-AS的表达量升高,而MEF2DmRNA的表达量降低.证实了MEF2D-AS的存在并预测其属于长链非编码RNA,且与MEF2D正反义RNA是反相关关系.此研究结果可为进一步探讨肝癌发生机制提供参考.  相似文献   

10.
拟南芥基因At3g13600编码一种钙调素结合蛋白,序列分析表明,该基因cDNA序列全长1 818 bp,编码一个具有606个氨基酸残基的多肽,推测分子量为68.9 kD;在At3g13600蛋白的N端存在IQ钙调素结合构象.为了从实验上进一步研究该蛋白的钙调素结合特性,通过逆转录聚合酶链式反应( RT-PCR)扩增含...  相似文献   

11.
脑表达的X连锁基因的克隆、染色体定位和初步功能研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过筛选人18周胎脑cDNA文库,得到一条与Bexl和Bex2在高度同源性的基因,经HUGO/GDB人类基因命名委员会的同意命名为BEX1,Northern杂交发现该基因在脑和胰腺中高表达,在心脏,胎盘,肝脏和肾脏中有较低表达,而在脑和骨骼肌中没有表达,用斯坦福大学G3辐射杂交系将BEX1定位于Xq22上的Marker DXS990和DXS 1059之间,以BEX1作为杂交探针小对小鼠的原位杂交中发现BEX1的小鼠同源基因在小鼠的生精小管中有表达,而在间质组织中没有表达,在成年小鼠(出生10周)中BEX1同源基因在生精小管的外周细胞中表达,在中层细胞(包括次级精母细胞和精子细胞)和内层细胞(主要由精子组成)中没有表达,而在6周的处于青春期的小鼠中,BEX1的同源基因在整个生精小管中都有表达,但外层细胞的表达比中层和内层细胞的表达要高得多,而在3周的幼年小鼠中,BEX1的同源基因仅有微量表达,所以BEX1在小鼠中的同源基因在青春期表达上升,生精小管成熟后表达维持在一定的水平,这提示BEX1基因可能参与精子发生及生精小管发育的过程。  相似文献   

12.
《科学通报(英文版)》1999,44(12):1114-1114
Primers for screening cDNA library have been designed according to EST AA453734 which is corresponding to the mouse LIM domain binding protein Ldb1. Arrayed human fetal brain cDNA library has been screened by PCR and routine hybridization method. A 2398 bp-cD-NA clone has been obtained. The cDNA encodes a 347 amino acids protein highly homologous to the mouse Ldb1, Xenopus Xldb1 and Drosophila Chip. It also contains an LIM binding domain and a nuclear localization signal. It has been named LDB1 (LIM domain binding protein 1), GenBank accession number is AF052389. Northern blot showed a 2.4 kb band, and the expression amounts of LDB1 in heart, brain and lung were considerably higher than those in other tissues.  相似文献   

13.
Primers for screening cDNA library have been designed according to EST AA453734 which is corresponding to the mouse LIM domain binding protein Ldbl. Arrayed human fetal brain cDNA library has been screened by PCR and routine hybridization method. A 2398 bp-cD-NA clone has been obtained. The cDNA encodes a 347 amino acids protein highly homologous to the mouse Ldbl,Xenopus Xldbl andDrosophila Chip. It also contains an LIM binding domain and a nuclear localization signal. It has been namedLDB1 ( LIM domain binding protein 1), GenBank accession number is AF052389. Northern blot showed a 2.4 kb band, and the expression amounts ofLDBI in heart, brain and lung were considerably higher than those in other tissues.  相似文献   

14.
15.
Cloning and expression analysis of human reticulon 4c cDNA   总被引:2,自引:0,他引:2  
  相似文献   

16.
应用RT-PCR技术,从黄孢原毛平革菌5.766(Phanerochaete chrysosporium)总RNA中成功扩增出预期大小约为1.3 kb的特异性条带,将扩增产物提纯后克隆入PUC19载体,经转化、筛选及酶切鉴定后,获得锰过氧化物酶(MnP2)基因的克隆。序列分析表明,扩增的MnP2基因片段其cDNA长度为1 149 bp,编码358个氨基酸,与其它已发表文献报道的MnP2序列一致,与其同工酶MnP1和MnP3的核苷酸同一性分别为81%和66%。  相似文献   

17.
18.
通过筛选人18周胎脑cDNA文库,得到一条编码332AA的全长新基因,生物信息学研究表明,该蛋白质序列有2个C2H2型锌指结构,其中1个锌指结构有RNA-binding蛋白特异锌指的特征,虽然同源比较发现与多种蛋白质精氨酸N端转甲基酶(protein arginine N-methyltransferase) 有一定的同源性,但新锌指蛋白不含转甲基酶的活性功能区域,属功能未知的基因,利用芯片研究功能未知基因的表达是一种较好的手段,通过代谢增强剂PMA(phorbol myristae acetate)刺激培养的血管内皮细胞,观察细胞受激活后新锌指蛋白基因的表达变化,结果表明新基因表达量提高了11倍以上,证实新基因属内皮细胞的极早期应答基因(Immediate early response gene,ERG)。  相似文献   

19.
Duchenne's muscular dystrophy (DMD) is an X-linked progressive myopathy caused by a defect in the DMD gene locus. The gene corresponding to the DMD locus produces a 14-kilobase (kb) messenger RNA that codes for a large cytoskeletal membrane protein, dystrophin. DMD and Becker's muscular dystrophy are the consequences of dystrophin mutations. The exact biological function of dystrophin remains unknown but it has been demonstrated that it is localized to the cytoplasmic face of the cell membrane and has direct interaction with several other membrane proteins. We report here the synthesis of a 14-kb full-length complementary DNA for the mouse muscle dystrophin mRNA and the expression of this cDNA in COS cells. The recombinant dystrophin is indistinguishable from mouse muscle dystrophin by western blot analysis with anti-dystrophin antibodies and was shown by an immunofluorescent technique to be localized in the cell membrane. Our successful construction of a functional full-length cDNA opens opportunities for the study of structure and function of dystrophin and provides an opportunity to initiate gene therapy studies.  相似文献   

20.
由田间自然感病和甜菜黑色焦枯病株,坏死黄脉型病株及无明显症 甜菜上分离到一种球状病毒,病毒呈二十面体,直径约25nm,有空心和实心2种粒子,具有分子量为24.7kd的外壳蛋白和长度分别为3.8kb,1.4kb,1.1kb的3个双链RNA组分,该病毒具有较强的稳定性和侵染性,蚜虫不能传毒,土壤诱发可传播,易通过汁液摩擦接种侵染多种植物;但回接甜菜只偶尔出现个别褪绿斑或不规则褪绿斑,并不表现田间症状,表明该病毒与甜菜黑色焦枯病等病害无直接关系。  相似文献   

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