蛋白质变性的渐变模型

通过对典型蛋白质变性实验的分析 ,证明了在目前蛋白质变性研究领域中普遍使用的二态模型与实际变性过程不符 .在分析已有实验结果的基础上 ,给出了反映蛋白质变性过程特征的新模型———渐变模型 ,该模型显示出蛋白质分子变性是一个构象渐变的连续稳态过程 .     

伸展态β-乳球蛋白重折叠过程的动力学特性

从蛋白质变性的渐变模型及构象态渐变的观点出发 ,对伸展态 β -乳球蛋白的重折叠过程进行了分析 ,发现蛋白质分子从伸展态到最终折叠态历经一系列中间稳定态 .尿素浓度梯度电泳实验结果显示 ,存在两条不同的折叠途径 .在不同的尿素浓度范围内 ,蛋白质分子的折叠过程具有不同的动力学特性     

变性剂诱导的多结构域蛋白质变性现象的研究

从蛋白质变性的构象渐变模型出发，分析了多结构域蛋白质变性过程的特点，用吸附动力学方法得到了可描述多个结构域变性的关系表示式，特别对典型双结构域蛋白质变性过程予以较详细的讨论。通过对比理论计算结果与实验观测结果，发现在一定参数条件下两者符合较好，从构象渐变的观点，对双结构域蛋白质变性过程中出现双S形变性曲线的原因做出了解释，同时对变性过程中可能出现的一些情况进行了预测和分析。     

蛋白质热变性现象的研究

从构象渐变的观点,对蛋白质热变性现象进行了系统的分析,发现以前用二态模型无法解释的实验数据,可以用渐变的观点做出合理的解释.给出在实验中可以进一步验证热变性过程具有构象渐变特征的预测结果.     

盐酸胍诱导的蛋白质变性现象研究

考虑常用变性剂盐酸胍（GuHCl)分子与蛋白质主链上的相邻二肽形成双氢键，利用吸附反应动力学方法，得到了描述蛋白质变性物理参量与盐酸胍浓度之间关系的式。结果表明计算得到的理论值与实验值符合良好，说明所给出的蛋白质分子与盐酸分子相互作用模型，能够较好地描述盐酸胍诱导的蛋白质变性现象。     

别构酶ATCase与底物分子协同结合过程的构象变化特性

利用可描述协同结合特性的动力学方法,得到了反映单个别构酶ATCase分子的结合分数与底物浓度之间的关系式.表明在确定的底物浓度条件下,单个别构酶ATCase分子处于确定的构象态,随着底物浓度的增加,别构酶ATCase分子将经历一系列中间态达到饱和构象态,S型结合分数曲线实际上显示了单个别构酶ATCase分子与底物分子的协同结合特性.利用所得模型分析了调节物分子对底物协同结合过程的影响,合理解释了结合分数曲线随调节物浓度变化而发生改变的实验结果,与别构酶ATCase分子具有的结构及所产生的生物学功能是自给的.     

血红蛋白分子氧合过程的构象变化特性

在分析血红蛋白分子与氧分子结合的相互作用特点的基础上，将氧分子与血红蛋白分子结合的过程看作为协同可逆吸附过程．根据协同吸附过程的特点，利用吸附动力学方法，得到了反映血红蛋白分子氧合过程的氧饱合分数与氧分压之间的关系式．从上述关系式得到了与之自洽的推论，在一定的氧分压条件下，血红蛋白分子处于确定的部分氧合构象态．当氧分压的值从小到大变化时，血红蛋白分子将从脱氧构象态经历一系列中间构象态到达完全氧合构象态．这表明s型的氧合曲线实际显示了单个血红蛋白分子的别构效应．     

大分子构象态的隧道赝自旋模型

本文根据大分了构象理论和实验结果,提出了大分子构象转变的隧道模型,从微观机制出发, 用量子力学和统计力学描述了构象电子体系;讨论了大分子的构象态、能态以及构象转变时所发 生的相变问题,得出了与现有理论和实验一致的结论．     

脲对含内蛋白子前体蛋白剪切的影响

研究了含内蛋白子的前体蛋白［麦芽糖结合蛋白－内蛋白子－几丁质酶结合区（ＭＹＢ）］在脲溶液中的分子构象及变性和复性过程中剪切活性与光谱变化的关系。结果表明，剪切活性随脲浓度的增加而逐渐丧失；当脲浓度大于６ｍｏｌ／Ｌ时，活性完全丧失。变性过程中Ａ２８０ｎｍ随变性程度增加而增强，复性后Ａ２８０ｎｍ与天然态Ａ２８０ｎｍ值相近，剪切活性随之恢复。说明构象松散先于剪切活性，可能在重折叠时，构象核化对剪切活性致关重要。     

高电荷态氩离子与Ne原子碰撞过程中的转移电离截面的研究术

采用符合关联实验技术进行的Ar^q Ne(q=8，9，11，12)碰撞体系中多电子转移过程的研究。在实验上鉴别了反应中各种电子转移过程，并测量了转移电离截面．研究了转移电离截面与反冲离子电荷态的关系，并利用修正后的分子过垒模型计算结果与实验结果进行了对比分析，计算结果较合理地描述了实验现象．     

Effect of Urea on Activity and Conformation of a Glycoprotein

Introduction In some enzymes, inactivation occurs before noticeable conformational change can be detected during denaturation by guanidinium chloride or urea[1-6]. Tsou[7] suggested that enzyme active sites are formed by relatively weak molecular interact…     

变性剂作用下文昌鱼碱性磷酸酶构象与催化活力变化

研究了文昌鱼碱性磷酸酶(AKP)的变性作用,结果表明:低浓度盐酸胍(0.5 mol/l,1.0 mol/l)对该酶具有明显激活作用;酶的荧光构象变化指标随脲浓度增大呈现两个陡变区(1.0～2.0 mol/l,4.0～8.0 mol/l),蜂位因变性剂存在而明显红移,表明肽链己发生较明显的伸展,该酶的失活与变性过程均为一级反应,低浓度脲(2.0 mol/l)作用表现为构象变化略快于失活,而高浓度盐酸胍(2.0 mol/l,4.0 mol/l)及高浓度脲(4.0 mol/l,6.0 mol/l,8.0 mol/l)作用均表现为失活略快于构象变化。     

Solution Properties of Soy Protein in DMSO/Urea Solvent System

Solution properties of 7S globulins （7S）, 11S globulins （11S） and soy protein isolates （SPI） in dimethylsulfoxide （DMSO）/urea solvent system were studied by intrinsic viscosity and particle size distributions. The results showed that the existence of urea was the main reason for the denaturation and solubility of soy protein in the system, and the effects were more obvious with increasing of urea concentration in solutions. Suitably dissolution temperature and time contributed to the solubility of soy proteins.     

Cu（Ⅱ） effect on the conformation of regenerated silk fibroin in dilute aqueous solution

Much attention has been paid to the natural mechanism of silkworm spinning due to the impressive mechanical properties of the natural fibers. In this work, we studied the effect of Cu（Ⅱ） ions on the secondary structure of Bombyx mori regenerated silk fibroin （SF） in dilute solution by circular dichroism （CD）. The results indicate that a given amount of Cu（Ⅱ） induces the SF conformational transition from random coil to β-sheet, however, further addition of Cu（Ⅱ） is unfavorable for this conversion. Meanwhile, the conformational changes induced by Cu（Ⅱ） follow a nucleation-dependent aggregation mechanism, which is similar to that found in Prion protein （PrP） denaturation and Aβ-peptide aggregations, leading to the neurodegenerative disease. This work would help one understand further the natural spinning process of silkworm. Additionally, it would be significant for the study of the nervous system diseases, because silk fibroin, extracted in large amounts from Bombyx mori silkworm gland, could be a proper model to study PrP denaturation and Aβ-peptide aggregations.     

大熊猫肌酸激酶热变性中活性与构象变化的比较

比较了大熊猫肌酸激酶在各种不同温度下热变性时，活性变化与构象变化的速度常数。结果表明在较低温度下，酶的失活速度与构象变化速度相当．而在较高温度下变性时酶的失活速度快于构象变化速度。这表明酶分子的活性部位的微区构象比整个分子的构象具有更大的易变性或柔性。     

尿素合成塔模拟计算

从热力学原理出发,建立了尿素合成条件下NH3-CO2-H2O-urea体系的热力学气液平衡机理模型,针对合成塔的操作条件,对部分热力学参数进行了优化。在此基础上,根据尿素合成塔结构及合成反应机理,采用本热力学机理模型,基于塔板上全混流模型对尿素合成塔进行了模拟计算,采用迭代法求解模型组成的非线性方程组,对初值的要求不高,易于收敛,计算结果同设计数据相符较好。     

城市生活垃圾堆肥过程动力学模型研究

基于堆肥反应动力学理论，以反应过程中涉及的关键控制因子温度、含水率、氧气含量作为研究对象，建立了城市生活垃圾堆肥过程动力学模型．同时结合实验研究，发现堆料含水率、耗氧量、底物降解速率的实验结果能较好的与模型模拟预测结果相吻合；温度变化的实验值在反应过程的中间部分出入较大，而前面部分跟后面部分与模拟量也能基本相同．     

DNA分子融化(melting)过程的monte carlo模拟

DNA双螺旋链在复制和转录的过程中要在酶的催化下解旋,这是一个高度复杂的过程,目前还无法用物理学的方法来描述.然而DNA的热变性(thermal denaturation)或称为融化(melting)的过程实现DNA在复制和转录中过程中的解旋,可以方便的用物理学的方法进行研究,这种研究可以看成是了解DNA复制和转录过程的第一步.采用PB模型,利用Monte Carlo方法模拟DNA的融化曲线,可得到的融化曲线的一些重要特征与实验结果符合得很好.