基因选择的快速Fisher优化模型

基因选择是基因芯片数据分析中的一个重要问题。基因选择的主要困难在于基因数远远大于实验样本数。在Fisher优化模型的基础上,提出了快速Fisher优化模型,从而使得算法的计算规模主要依赖于样本数而不是特征数,大大提高了计算速度。在公共数据中的实验表明该方法速度快,选择的基因对分类结果是有效的。     

一种改进的基因表达数据分类方法

从分类算法和特征基因选择两个方面研究基因表达数据的分类,将传统的Support Vector Machines(SVM)算法和K-nearest neighbor(KNN)算法两者结合成为一种应用于基因表达数据分类的算法,并针对基因表达数据分类数据集“样本少,维数高”的特点,提出了一种改进的基于相关性的递归特征消除算法(简称为C-RFE),消除了数据冗余．实验结果表明,新方法可有效提高分类准确率和特征选取的效率．     

基于BTLBOGSA与CNN的基因微阵列数据分类模型

针对现有基因微阵列数据分类中存在的数据维度高、容易发生过拟合的问题,提出了基于BTLBOGSA(Binary TLBOGSA)与卷积神经网络(Convolutional Neural Network,CNN)的基因微阵列数据分类模型(BTLBOGSA-CNN)。该模型首先针对基因微阵列数据分类时存在的数据维度高的问题,利用新的编码策略,将连续搜索空间转换为二元搜索空间,结合教与学优化(Teaching-Learning-Based Optimization,TLBO)算法的二元变体与引力搜索算法(Gravitational Search Algorithm,GSA)的各自特点,基于BTLBOGSA方法从基因微阵列数据集中选择具有高鉴别性的基因;然后针对基因微阵列数据分类易发生过拟合问题的现象,利用卷积神经网络进行基因微阵列数据的分类。利用公开的基因微阵列数据集进行仿真实验,从TLBO算法与GSA结合的有效性、BTLBOGSA与CNN结合的有效性、BTLBOGSA-CNN与其他已有分类模型相比的有效性3个方面进行对比分析,结果表明,BTLBOGSA-CNN模型可以在较少的特征基因下取得较高的分类精度,具有较高的可行性和有效性。     

基于FCM-KFDA判别的不平衡数据集分类

不平衡数据的分类是机器学习的热点问题.传统的分类方法在分类时会倾向于多数类而使得分类精度不高.对不平衡数据集的分类,提出一种基于FCM结合KFDA方法,首先采用FCM算法对样本数据进行聚类,将数据聚类后的样本数据映射到特征空间里,再采用KFDA算法对数据进行分类,可以克服不平衡数据对分类性能的影响.对UCI数据集进行仿真实验,结果表明FCM-KFDA算法可以有效地提高数据识别率.     

研究中文文本分类技术的辅助平台

为方便中文文本分类过程算法研究,阐述中文文本分类的基础技术,提出基于构件的中文文本分类技术研究辅助平台.该平台对大多数分类中使用的算法在中文文本分类中的应用效果进行了研究.实验结果表明: 该平台可以通过计算分类器分类准确率的宏平均值比较分类算法与特征选择算法的性能,可以评估语料库的可用性,能够用于研究中文分词、特征选择、分类算法等中文文本分类技术问题.     

基于免疫克隆选择算法的特征选择

提出了一种基于免疫克隆选择算法的特征选择方法．特征选择可以被看成是一个组合优化问题,利用免疫克隆选择算法快速收敛于全局最优的特性,加快搜索到最优特征子集的速度,为后续模式分类提供良好的判别依据．实验结果表明算法在保持甚至提高分类精度的同时,有效地降低了特征维数．与基于遗传算法特征选择的结果相比较,在有限代数内,该算法能收敛到更优的特征子集,从而验证了算法的有效性及其应用潜力．     

多类别肿瘤分类的特征基因选择方法研究

以肿瘤基因表达谱指导肿瘤的分类是目前机器学习领域的一个研究热点.对多类别肿瘤分类中的关键问题——特征基因选择方法进行了研究,提出了混合式特征基因选择策略.该策略首先利用7种特征选择算法提取与分类高度相关的基因,随后采用SSiCP算法消除冗余基因.实验是在肺癌的多类别基因表达谱数据集上完成的.实验比较了7种特征选择算法的性能,发现CFS算法加SSiCP算法的混合式基因选择策略可以获得数量较少的特征基因集,在训练集和独立测试集均有较高的准确度.所获得的最精简基因集中的部分基因据文献报道与肺癌的发生发展密切相关.实验结果证实了混合式特征基因选择策略的有效性.     

高维基因表达数据集分类规则组的确定

目前基因表达数据分析的大多数算法都是探索性的选择基因来生成识别类（例如癌细胞组织与正常细胞组织）的规则组,对此本文提出了一种对基因表达数据集进行分类的稳健算法,确保可以找到最优的k个基因生成分类的规则组,并且通过试验表明由此算法得出的规则组比其他分类方法更准确．     

基于全局和声搜索算法的特征基因选择方法

鉴于DNA微阵列数据中无关基因和冗余基因对分类精度和效率的影响,提出一种基于全局和声搜索的特征基因选择方法,首先采用ReliefF算法对微阵列基因数据集排序,取排序靠前的N个基因构成初选基因子集,然后利用全局和声搜索算法选择特征基因.两个公共微阵列数据集上的仿真实验表明,该算法全局搜索能力强,分类精度高,能够有效地剔除噪声和冗余基因,是一种有效的特征基因选择算法.     

基于PCA和信息增益的肿瘤特征基因选择方法

针对肿瘤基因数据因维度高和冗余基因较多而导致分类精度低的问题,提出一种基于PCA和信息增益的肿瘤特征基因选择方法.该方法首先使用PCA算法剔除冗余基因,获得预选特征基因子集;然后利用信息增益算法对预选特征基因子集进行优化选取,得到特征基因子集;最后采用不同分类模型对特征基因子集进行仿真实验.实验结果表明,所提方法提高了基因表达谱的分类精度,从而表明致病基因被有效地选取出来.