黄瓜SRAP遗传连锁图的构建及始花节位的基因定位

在由黄瓜自交系S06与S52杂交产生的F2群体中,应用SRAP(sequence-related amplified polymorphism)标记构建黄瓜的分子遗传连锁图谱.使用了64个多态性引物组合,共得到108个多态性条带,单对引物组合最多的产生5个多态性条带,平均1.7个.在F2群体中对这些多态性位点进行连锁分析,并用Mapmaker 3.0构建连锁群,77个标记位点进入9个连锁群(LOD≥3.0),总长1114.2 cM,标记平均间距14.5 cM,标记均匀分布于整个连锁群.同时将始花节位性状控制基因ffn(first flower node)定位在第Ⅸ连锁群上,与两侧标记DC1EM5和ME7EM2A的距离分别为10.3和12.1 cM.     

大豆基因组F连锁群较高密度图谱的构建和基因定位

应用栽培大豆"长农4号"和半野生大豆"新民6号"杂交得到的F8代重组自交系(88株)构建了较高密度的大豆F连锁群图谱.该连锁群包括5个限制性片段长度多态性(RFLP)标记,7个扩增片段长度多态性(AFLP)标记,14个微卫星(SSR)标记和1个形态学标记,标记之间的平均距离为11.8 cM,连锁群总长度为331.7 cM.大豆的紫花/白花基因(w)定位在该连锁群上,与花色基因连锁的两个标记为Satt03911.0 cMw 16.7 cM Satt516.作图分析中发现其中一个RFLP标记(K14)有4个独立分离的等位基因,其中两个(K14-2和K14-4)定位在该连锁群上,并且紧密连锁,反映了大豆基因组的复杂性.     

Localization of genes for lateral branch and female sex expression and construction of a molecular linkage map in cucumber (Cucumis sativus L. ) with RAPD markers

A cucumber ( Cucumis sativus L. ) molecular linkage map, including 79 random-amplified polymorphic DNAs (RAPD)and two genes , lb for lateral branch and f for female sex expression, is constructed from a cross between a line, S52, with weak lateral growing ability and staminate from Dabieshan Mountains area in China and another line, S06, with strong lateral growing ability and gynoecious from Europe. The map contains nine linkage groups and spans 1110.0 cM with an average distance of 13.7 cM between loci. The lb locus is located in a longer linkage group LG-2 and flanked by two markers, OP-Q5-1 and OP-M-2-2, at 9.3 cM and 15.9 cM, respectively. In the meantime, the RAPD loci, OP-Q5-2 and BC151, in a short linkage group were found to flank f at 13.7 cM and 13.4 cM,respectively. The construction of RAPD map has paved a way for further study of the genes for lateral branch, female sex expression and other agronomic traits in cucumber.     

基于中国丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡资源家系的遗传连锁图谱的构建与分析

采用中国泰和丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡的正反交组合构建了中国农业大学(CAU)资源家系,利用129个微卫星对资源群中的4个半同胞家系进行了大规模基因组扫描,构建了微卫星标记的连锁图谱(CAU遗传图谱),该图谱覆盖了23条常染色体(1—15,17—24,26和27)、1条性染色体(Z染色体)和2个连锁群(E26C13和E50C23),图谱总长为3307．5 cM;雄性与雌性的遗传图谱差异为3．51％．CAU遗传图谱的标记顺序与2000年发表的鸡的整合图谱的标记顺序一致,但是遗传长度有所不同．该图谱的构建为进一步的数量性状位点定位研究打下坚实基础．     

基于优质早籼稻品种佳辐占的遗传图谱的构建

以优质常规稻佳辐占为父本,分别以广陆矮4号和明恢86为母本,构建两个重组自交系(以下简称为“广佳”群体和“明佳86”群体).利用559对简单重复序列(SSR)引物对亲本进行多态性分析,获得佳辐占和广陆矮4号、佳辐占和明恢86亲本间有差异的引物分别201对和186对,多态率分别达35.95%和33.33%.利用这些引物构建了两张水稻遗传图谱,其中广佳图谱包含127对SSR标记,全长约1 015.7 cM,平均标记间距为8 cM;明佳86图谱包含131对SSR标记,全长约1 263.6 cM,标记平均间距为9.6 cM.遗传图谱的构建便于研究佳辐占优质性状的遗传规律、外观品质性状间的内在关系,以期为分子标记辅助选育细长、大粒、优质的水稻新品种打下基础.同时,这是两个基于重组自交系的图谱,可长期用于群体内各种性状的遗传规律分析及QTL定位.     

随机扩增多态DNA在果树上的应用(综述)

综述了RAPD及其在构建果树遗传连锁图谱、目的性状基因标记、遗传关系鉴定及种属鉴定等方面的作用。     

水稻白叶枯抗性基因Xa-min(t)的抗谱鉴定及其分子标记的筛选

利用来自11个国家的34个水稻白叶枯病菌菌株,以高感品种IR24、含有已克隆的抗白叶枯病基因Xa21的品系C64(IRBB21)、中花11和日本晴4个水稻品种作为参照,对一个含有来自小粒野生稻(Oryza minuta)的抗白叶枯病基因Xa-min(t)的渐渗品系(introgression line)78-15进行了抗谱鉴定.结果表明,Xa-min(t)是一个广谱、高抗的白叶枯病抗性基因.同时,以IR24和78-15为亲本进行杂交,并采用分离群体分组分析法(BSA)、随机引物扩增多态性DNA(RAPD)和序列特异性扩增区(SCAR)筛选与Xa-min(t)连锁的分子标记.共筛选了800个购自Operon公司的随机引物,其中有2个引物,BE05和BE06,可扩增出与Xa-min(t)连锁的RAPD标记BE05300和BE061400.对这两个DNA片段克隆并测序,根据两端序列设计了两对长度为21～24 bp的特异引物扩增供试材料,其中一个RAPD标记可转化成稳定、重复性好的SCAR标记ScBE05300.用ScBE05300和BE061400标记分别对IR24和78-15的杂交F2代948和719个单株进行的连锁分析表明,这两个标记与Xa-min(t)的连锁距离分别为2.2和3.7 cM,并位于Xa-min(t)的同一侧.这些结果为Xa-min(t)的精细物理图谱的构建奠定了基础.     

水稻温敏核不育系HD9802S不育基因的SSR标记定位

使用分子标记辅助选择可以获得目标性状的个体从而提高育种效率.以HD9802S/(HD9802S/R287) BC1群体为材料,利用BC1群体中随机选择的32个高度不育单株和32个高度可育单株,以及涵盖水稻12条染色体的22个SSR标记,通过连锁分析进行染色体定位,将温敏核不育基因(HDtms)定位于第2号染色体上;利用软件QTL Ici Mapping 3. 0进行染色体分群,HDtms被划分到第2号染色体上.在第2号染色体上覆盖筛选得到10个SSR标记,以回交群体中428个单株为材料绘制连锁图谱,图谱全长112. 21 cM,平均图距为11. 21 cM,HDtms在标记RM5897与RM12783之间.在此区间内筛选到与HDtms连锁紧密的SSR标记.其中RM12747是得到筛选率最高的分子标记,为90. 135%,且在HD9802S与R287间具有多态性.说明对温敏不育性的分子标记辅助选择可初步使用该分子标记.     

苦荞重组自交系群体F_5代SSR遗传图谱的构建

以"小米荞×晋荞2号"杂交组合,通过单粒传获得的245个F_5代重组自交系(命名为SJ-RILs)群体为作图材料,构建SSR遗传连锁图谱。结果显示:350对SSR引物在亲本间有多态性的为59对,多态率为16.9%;多态性引物在SJ-RILs群体共扩增出80个等位变异位点;来自小米荞和晋荞2号等位基因分别占群体总基因型的51.5%和48.5%;采用作图Jionmap4.0软件构建的遗传连锁图总长度为1 106.74cm,含11个连锁群,80个分子标记,其中偏分离标记27个,相邻标记的平均间距为13.83cm。结论:该图谱可为苦荞遗传图谱构建、重要性状QTL的定位和基因组学研究隆奠定基础。     

粗山羊草Y189抗小麦白粉病基因SSR标记

从粗山羊草[Aegilops tauschii(Coss.)Schmal]Y189中鉴定出1个显性抗小麦白粉病基因,暂定名为PmAe Y2.应用分离群体分组法(BSA)筛选到Xgwm583-5D、Xgwm174-5D、Xgwm182-5D和Xgwm271-5D标记与该基因之间的遗传距离分别为25.7、16.7、9.1和7.0 cM.根据连锁标记所在小麦微卫星图谱的位置,PmAe Y2被定位在5DL染色体上.分析基因所在染色体的位置、抗病性特征认为PmAe Y2是一个新的抗白粉病基因,并可用于分子标记辅助选择.