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相似文献
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1.
甘蓝型油菜突变体Cr3529抑制性消减文库的构建   总被引:1,自引:4,他引:1  
应用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了甘蓝型幼叶黄化油菜突变体Cr3529和其野生型3529品系幼叶期的正、反向消减文库.经茵落PCR检测,正向消减文库的有效重组率为55.5%;反向消减文库的有效重组率为76.5%.为进一步克隆消减文库中的差异表达基因和研究这些基因的功能奠定了基础.  相似文献   

2.
抑制性消减杂交(SSH)是以抑制性PCR为基础结合标准化与消减杂交技术、建立的一项筛选与分离未知差异表达基因的新技术,该技术具有快速、简便、灵敏、特异、高效、所需起始样本量较少等特点,已广泛应用于疾病的病因病理、损伤机制及损伤反应与修复等领域的分子生物学研究,本文总结SSH的研究进展并探讨其在法医学中的应用前景。  相似文献   

3.
以0?C 低温处理12 h 的高山离子芥幼苗cDNA 为检测子,以正常生长温度下的高山离子芥幼苗cDNA为驱动子,应用抑制性消减杂交技术,构建冰缘植物高山离子芥的消减文库,筛选在低温下高表达的基因片段.随机挑取96个阳性克隆进行测序分析,得到39个独立的基因片段,26个和已知基因有较高的同源性,13个为未知基因.基因分析表明:高山离子芥在低温胁迫下,微丝交联蛋白Actin cross linking protein很可能在感受低温的过程中行使作用,而DREB2A和ABF1协同作用一起调节下游冷响应基因的表达,为进一步研究高山离子芥的抗冻机制奠定了基础.  相似文献   

4.
为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对cDNA克隆进行测序,证明这些克隆的功能是和肝癌的发生高度相关的.抑制消减杂交是克隆特异表达基因的有效方法.  相似文献   

5.
介绍了从好好芭成熟叶片中提取总RNA的方法;用含有SDS的裂解液裂解细胞,用DNase除去可能出现的DNA干扰,再经植物提取试剂盒纯化后,获得了高质量的完整RNA,可用于基因编码序列的克隆和基因表达的mRNA分析等精细研究,并进一步构建了好好芭干旱消减文库.  相似文献   

6.
食管癌表达上调基因EC45 cDNA的克隆   总被引:1,自引:0,他引:1  
鉴别食管癌中差异表达的基因.利用抑制削减杂交和反式Northern高密度点杂交相结合的方法,获得一个在70%(18/26)食管癌中表达显著上调的基因,命名为EC45.通过放射杂交技术将其定位于3p12-3p11.2.通过筛选食管癌cDNA文库获得全长EC45cDNA(1987bp).EC45编码204个氨基酸,与核糖体蛋白l15的开放阅读框100%同源,但与5'非翻译区和3'非翻译区均无同源性.16种正常成人组织Northern杂交显示EC45均有表达,其转录本大小为2.0kb.以上结果提示:编码核糖体蛋白L15的EC45基因在食管癌组织中表达上调,在食管癌发生发展过程中可能发挥作用.  相似文献   

7.
斑蝥素是芫菁科昆虫合成的一种倍半萜类物质,对于治疗肿瘤和其他疾病有特别的疗效.通过构建抑制性消减杂交文库(SSH),筛选眼斑芫菁在斑蝥素合成期的差异表达基因.用斑点杂交对消减文库中的1 500个克隆进行筛查,130条特异表达序列标签(ESTs)进行分析.34条(26%) ESTs与NCBI中标注的假设基因有很高的同源性; 45条(35%) ESTs与NR数据库中的序列没有同源性,可能代表新的基因; 51条(39%) ESTs与已知基因的序列同源性很高,这些基因参与了生物调控、应激反应和解毒、信号转导、代谢与合成.最后通过实时定量逆转录PCR对文库中的9个上调表达基因进行验证.对眼斑芫菁在斑蝥素合成期的表达进行研究,为最终阐明斑蝥素的生物合成提供帮助.  相似文献   

8.
抑制性扣除杂交法运用了杂交二极动力学和链内退火优先于链间的原理,使原丰度有差别的单链cDNA相对含量基本一致,使非目的片段两端反向重复序列退火时产生“发卡”结构,不能与引物配对,从而选择性地抑制了非目的片段扩增。该方法假阳性率低,灵敏度高,在水稻基因表达差异分析中有着广泛的应用。  相似文献   

9.
鸭跖草Commelina communis中差异表达cDNA 片段的克隆与分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
一种新的基因克隆技术称为抑制消减杂交技术(SSH)用于研究生长于2种生态环境(古铜矿山和正常土壤)中鸭跖草Commelina communis的基因表达差异.分别以Cu矿山鸭跖草作为检测子,非Cu矿山鸭跖草作为驱赶子,建立了生长于Cu矿山生态环境中鸭跖草的差异表达cDNA文库,此cDNA文库代表在Cu矿山鸭跖草中特异表达的cDNA.通过反式Northern杂交筛选出3个阳性克隆进行测序.序列分析表明其中一个cDNA为CaM-1ike基因.进一步对此基因进行Virtual Northern分析,结果初步表明此基因在生长于古铜矿山上的鸭跖草中上调表达.  相似文献   

10.
以典型炼油废水为研究对象,通过采样监测,结合炼油工艺特点分析了多环芳烃的产排和消减特征. 研究表明:炼油各生产装置废水中多环芳烃的质量浓度、组分和排放量差异较大. 二次加工工段的催化裂化装置和延迟焦化装置是废水中多环芳烃产生和排放的主要污染源,质量浓度分别为1076~1179、87~681g/L,排放量占全厂排放总量的54%和27%. 生产装置与污水处理单元废水中多环芳烃的组分分布呈现一致性,主要以芴、二氢苊和菲等低环数芳烃为主, 二~三环芳烃质量浓度占总组分质量浓度的83%. 炼油废水中多环芳烃去除率沿处理流程逐级递减,由40%降至7.5%. 高环数芳烃的去除率达95%,明显高于低环数芳烃的90%的去除率.  相似文献   

11.
由于杂种优势的利用是农业增产的重要途径,杂种优势的遗传基础研究一直受到高度重视。近十年来发展的分子标记技术及构建的高密度遗传图谱,为阐明杂种优势的遗传基础提供了有力的工具,杂种优势研究有了新进展,通过对已有资料的分析研究,从遗传差异,基因表达调控、基因效应、基因网络系统等方面探讨了杂种优势的遗传基础及其研究进展。  相似文献   

12.
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression, SAGE)是一种快速分析基因表达信息的技术.它不但能快速、详细地分析成千上万个基因,还能发现新基因,因此是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段.近年来此技术广泛应用于肿瘤的研究,了解肿瘤发病机制,识别诊断和治疗肿瘤的新基因.可以预测SAGE在肿瘤研究和诊断过程中的应用将会对肿瘤的认识和治疗产生深远的影响.  相似文献   

13.
芥子酶的研究概况   总被引:3,自引:0,他引:3  
芥子酶是白花菜目十字花科的植物中普遍存在的一种水解酶,它与硫代葡糖苷共同组成了植物的防御系统,对其研究具有重要的意义.对芥子酶的发现、起源、分布、生化特性、编码基因和表达等方面的研究进行了简单的综述.  相似文献   

14.
基于模型的基因表达聚类分析技术研究进展   总被引:4,自引:0,他引:4  
基因表达数据聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类,有助于对未知功能基因进行研究.基于判别的基因表达数据聚类方法具有无法准确确定类别的局限性,研究工作已转向具有更好聚类效果的基于模型的聚类方法.文中介绍了常见的基于模型的聚类方法及其特点,并就如何开发新的适合基因表达数据分析的基于模型的聚类算法进行了讨论.  相似文献   

15.
Progress in artificial control system for gene expression   总被引:2,自引:0,他引:2  
Along with the increasingly wide application of transgenic techniques, new stricter criteria have been raised for controlling the expression of exogenous genes. For these demands, a series of artificial control systems for gene expression have been developed and testified in recent years, which can control exogenous genes expression in exact time and certain level by administration of a specific drug or hormone. The successful construction of these systems offers a practicable method to control precise expression of exogenous gene in organisms, and raises the feasibility of wide application of gene therapy.  相似文献   

16.
17.
植物差异表达基因克隆技术及研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术来研究植物在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,掌握了生命活动过程中的重要信息.文章对建立在RNA水平上克隆植物未知差异表达基因的几种关键技术及其研究进展进行了综述,阐述了各技术的原理、技术路线、优缺点及相应的改进方法,并对它们在植物抗逆研究中的应用现状及前景作了展望.  相似文献   

18.
本文着重介绍了纤维素酶的组成、分子结构、基因表达及研究趋向和应用前景,提出了在纤维素酶研究中必须解决的一些问题。纤维素酶的研究为纤维素的充分利用开辟了一条新的途径。  相似文献   

19.
提出了用自组织映射(SOM)网络对生物信息学中基因表达数据进行聚类分析的方法。用SOM网络对酵母基因表达数据进行聚类。通过对映射结果的分析,表明SOM网络有较高的分类正确率,用于基因表达数据的聚类分析是行之有效的。  相似文献   

20.
将已克隆到的环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)C-2的几丁酶基因chi1片段克隆到质粒载体pUXBF5中,得到重组质粒pUXCH1,该重组质粒在大肠杆菌中可以表达产生具有生物活性的几丁酶并分泌到胞外。将pUXCH1分别利用感受态法和三亲本杂交法转化荧光假单胞菌(Psendomonas fluorescens),在含有卡拉霉素的金氏B平板上筛得转化子。但将转化子点种于几丁质平板上却不能产生水解圈,提取细胞内容物后用比色法也没有检测到有效的酶活性。该研究表明环状芽孢杆菌 的几个酶基因chi1已经被成功的整合到荧光假单胞菌的染色体上,但却没有表达或表达效率极低,这可能是由于荧光假单胞菌的表达系统不能正确有效的识别存在于该chi1几丁酶基因片段中的环状芽孢杆菌基因启动子而造成的。  相似文献   

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