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针对最小二乘支持向量机最佳算法参数难以确定的缺陷,提出了基于文化差分进化算法的最小二乘支持向量机(Cultural Differential evolution Algorithm Least Square Support Vector Machine,CDE-LSSVM)。该算法通过新型的文化差分进化算法优化确定最小二乘支持向量机核宽度参数和惩罚系数,建立具有良好预测性能的模型。同时,针对药物定量构效关系(Quantitative Structure-Activity Relationships,QSAR)模型具有高度非线性、变量之间存在相关性的特征,采用CDE-LSSVM建立HIV-1蛋白酶抑制剂的药物定量构效关系模型。模型具有很好的拟合精度与预测精度,且优于最小二乘支持向量机、BP神经网络和径向基神经网络。 相似文献
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支持向量回归用于氨基酸描述符在肽QSAR建模中的性能评价 总被引:3,自引:0,他引:3
采用支持向量回归方法用3个数据集来评价z-scales、c-scales、ISA-ECI、MS-WHIM、PRIN等5个氨基酸描述符在肽QSAR支持向量回归模型构建中的性能并对核函数进行选择,采用留一法交叉检验的结果显示径向基核函数要好于多项式核函数和线性核函数;在以径向基核函数的支持向量回归模型中表明z-scales的预测准确度要略优于其它描述符,且在同一描述符的情况下SVR的预测效果要好于其它线性方法,说明SVR在肽QSAR模型构建中是一个可行的方法. 相似文献
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HIV-1蛋白酶(PR)是治疗艾滋病的重要靶标酶之一.笔者采用分子动力学模拟,运用MM-PBSA方法计算了PR与抑制剂BEB复合物的绝对结合自由能;运用能量分解的方法考察了PR的主要残基与BEB间的相互作用与识别,结果表明:残基GLY27、 ALA28/ALA28'、 GLY49、 ILE50/ ILE50'和ILE84/ ILE84'为PR与BEB的结合自由能提供了主要贡献.抑制剂BEB骨架上的OH基和NH基与残基ASP25/ASP25'、ASP29和GLY27之间的氢键相互作用有利于复合物的稳定.计算结果与实验值吻合较好. 相似文献
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对20个核苷酸类化合物(d4T的衍生物)进行了定量构效关系研究,建立QSAR方程。模型指出该类化合物的抗HIV-1活性与nM、lgP、(lgP)2及分子连接性指数6χvP具有良好的相关性,其复相关系数R为0.94。由方程可知:6χvP在抗HIV-1过程中比电子参数σ发挥更大的作用。 相似文献
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电力系统负荷预测精度直接决定了预测模型的质量.为了降低预测模型输出结果的预测误差,提出了粒子群算法优化支持向量机回归这一智能预测方法.通过对环境温度、节假日、工作日、日期的采集与分析作为模型的输入,以日平均负荷作为模型的输出.最后,通过仿真,对引入粒子群算法的支持向量机回归模型的预测结果进行对比分析.结果表明:优化后的智能模型取得了更为理想的预测结果. 相似文献
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以自组建的食源性血管紧张素转化酶(angiotensin I‐converting enzyme ,ACE)抑制二肽为研究样本,采用氨基酸描述子VHSE(principal component score vector of hydrophilicity ,steric ,and electronic properties)对ACE抑制二肽进行表征后,比较偏最小二乘(partial least square regression ,PLS)、支持向量机(support vector machine ,SVM)及主成分分析(principal component analysis ,PCA)‐SVM相结合的3种建模方法对ACE抑制二肽的QSAR(quantitative structure‐activity relationship)建模。结果显示,对于食源性ACE抑制二肽,3个模型的拟合能力无明显差异,SVM模型的预测能力略强;对其进行权重投影分析发现,C末端氨基酸较N末端氨基酸对其活性的影响更为明显。 相似文献
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基于支持向量回归(Support Vector Regression,简称SVR)的非线性时间序列预测是智能预测的重要前沿课题,在许多领域有着非常广泛的应用前景。文章介绍了SVR基本理论和方法,从金融、电力、交通、旅游等领域的典型应用对基于SVR的非线性时间序列预测进行了综述,分析了目前SVR在核函数、自由参数选择和输入数据处理方面存在的问题及其在应用领域进一步研究的方向。 相似文献
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汇率预报的非线性组合建模与预测方法研究 总被引:2,自引:3,他引:2
董景荣 《重庆师范大学学报(自然科学版)》2003,20(3):1-4,18
近年来的经济统计研究表明,组合预测比单项预测具有更高的预测精度,但线性组合预测方法在汇率的组合建模与预测方面存着较大的局限性。本文提出了一种基于支持向量机回归(SVM)的汇率非线性组合建模与预测新方法,并讨论了建模中SVM核函数、损失函数的选取和容量控制等问题。对于英镑、法郎、瑞士法郎、日元对美元等汇率时间序列的组合建模与预测结果表明,该方法具有很强的学习与泛化能力,在处理外汇市场这种具有一定程度不确定性的非线性系统的组合建模与预测方面有很好的应用价值。 相似文献
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将SVR原理引入到石油期货价格的时间序列中,并以美原油价格进行了实证分析.结果表明:该方法能充分反映石油期货价格序列走势,对短期价格的预测具有较高的精度;并且还发现,超级参数的选择服从一定规律,即其乘积在一定范围内效果较佳.之后,还将此理论推广到多维影响因素和其他金融时间序列的预测中. 相似文献
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利用Routh-Huritz准则、Lyapunov函数、Lasalle不变原理和波动引理,对一类HIV-1复合药物疗法数学模型的动力学行为进行了研究.基于基本再生数,得到了非感染平衡点和单重感染平衡点的局部或全局稳定及存在双重感染平衡点的充分条件. 相似文献
12.
在分析传统预测方法不足的基础上,利用灰色支持向量机组合分析模型,以实际值与灰色模型预测值的比值序列作为支持向量机模型的输入,选取径向基函数为核函数,并通过交叉验证法选取最优参数,利用支持向量机模型分析预测比值序列,最后通过灰色模型还原为货邮吞吐量的预测值.以上海机场货邮吞吐量为例,对灰色支持向量机模型进行了实证分析,并与灰色模型、支持向量机模型进行了对比. 相似文献
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为了解桂林市HIV-1感染者中HIV-1流行毒株亚型的分子流行病学特征,采集桂林市HIV-1感染者的抗凝全血样品42份,分离PBMC并提取DNA,用巢氏PCR方法扩增病毒env基因,并进行序列测定和亚型分析。系统进化分析表明,桂林市HIV-1感染者样品分别属于4亚型:重组型CRF01-AE亚型4份、重组型CRF08-BC亚型15份、重组型CRF07-BC亚型8份和01C亚型3份。可见,桂林市HIV-1感染者中流行毒株主要为CRF-BC,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时制定新的防治策略。 相似文献
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W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究 总被引:1,自引:1,他引:1
结晶水分子W301在几乎所有的HIV-1蛋白酶(HIV-1PR)和配体的晶体结构中出现.在HIV-1PR中A链天门冬氨酸残基Asp25质子化状态或B链Asp25质子化状态下,QyaraM模拟后MM—GBSA方法计算得到W301水分子在HIV-1PR/ABT-538结合中的自由能贡献分别为-1.6.88kJ/mol、-17.63kJ/mol,W301水分子在HIV-1PR/ABT-538的结合中起到了关键的作用.进一步分析发现W301水分子与HIV-1PR和ABT-538分别形成了两个、四个氢键. 相似文献
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Some neutralizing antibodies against HIV-1 envelope proteins were highly effective to inhibit the infection of different strainsin vitro, and existed in the infected individuals with very low levels. We suggested multi-epitope-vaccine as a new strategy to increase
levels of neutralizing antibodies and the abilities against HIV mutationin vivo. Two candidate multi-epitope-vaccines induced antibodies with predefined multi-epitope-specificity in rhesus macaque. These
antibodies recognized corresponding neutralizing epitopes on epitope-peptides, gp41 peptides, V3 loop peptide, rsgp41 and
rgp120. Besides, three candidate epitope-vaccines in combination (another kind of multi-epitopevaccines) showed similar potency
to induce predefined multiple immune responses in rabbits. These results suggest that multi-epitope-vaccines may be a new
strategy to induce multi-antiviral activities against HIV-1 infection and mutations. 相似文献
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为了解广西近年确诊的HIV-1感染者流行病学及HIV-1亚型分布情况,分别在桂林、来宾、钦州采取样本100例、102例和103例,收集流行病学资料、采集抗凝全血、提取病毒RNA、用RT-PCR进行gag基因扩增并对产物进行测序和序列分析。结果显示:在305例样本中,男女性别比1.99∶1;青壮年年龄组患者占56.72%,50岁年龄组患者构成比例为44.62%;职业为农民的患者比例为50.82%;初中及以下文化水平患者占76.39%;经异性性接触途径传播构成比为95.74%。最终成功扩增得到155份样本的gag基因序列,共发现4种亚型:CRF01-AE亚型124例、CRF07-BC亚型12例、CRF08-BC亚型14例、B亚型5例。 相似文献
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机器学习在模式识别中的应用研究 总被引:1,自引:0,他引:1
近年来,机器学习已成功应用于模式识别领域,并且随着研究的深入,机器学习的相关算法和理论又得到了完善和扩展。本文将阐述机器学习的基本概念.分析应用在模式识别领域的若干机器学习算法。 相似文献