拓扑指数法在QSPR研究中的应用

目前拓扑指数方法在定量构效关系(QSPR)研究中属活跃领域。简述了Wiener指数、Ran dic-Kier指数、Hosoya指数等拓扑指数,介绍了拓扑指数在定量构效关系研究、物化性质研究、药物设计研究、环境污染预测等方面的应用。表明拓扑指数法在QSPR研究中取得显著效果,具有良好的应用前景和实用价值。     

自相关拓扑指数与取代芳烃化合物理化参数的定量关系

采用自相关拓扑指数为分子描述符，研究取代芳烃化合物的水溶解度和脂水分配系数与分子拓扑结构的定量关系，建立了良好的构效关系方程，为研究有机污染物的理化性质、环境行为提供了一有效的方法。     

自相关拓扑指数与取代芳烃化合物理化参数的定量关系

采用自相关拓扑指数为分子描述符，研究取代芳烃化合物的水溶解度和脂水分配系数与分子拓扑结构的定量关系，建立了良好的构效关系方程，为研究有机污染物的理化性质、环境行为提供了一种有效的方法．     

烷烃分子距离连接性指数及与其物理化学性质的关系

从分子隐氢图中各原子间的距离与连接关系出发，提出了一种表征烷烃化合物分子结构特征的拓扑指数距离连接性指数L1。对2－9个碳原子饱和烷烃几种物理化学性质进行了定量构效关系建模，与现有的一些拓扑指数相比，该指数具有较好的结构选择性和性质相关性，并且计算更加简便。     

几类典型生物活性物质的结构表征及定量构效关系研究

定量构效关系(QSAR)是现代化学基础理论与应用的重要研究领域,并得到了越来越多的化学、生物及药学研究者的重视.如何产生出表征分子结构特征的结构参数是QSAR成败的关键所在.拓扑指数只要知道分子的结构就能获得,且算法比较简单,在相关分析中可获得较好的结果,但能真正用于含杂原子和多重键的拓扑指数并不多.     

拓扑指数在烷烃同分异构体中的应用

运用拓扑指数基本原理来定量阐述烃类的分子结构及性质变化趋势,有很高的准确性和适用性。     

定量构效关系研究进展及其应用

定量构效关系是目前国际上一个比较活跃的研究领域.本文简要介绍了定量构效关系的发展历史及定量构效关系研究中常用方法等,其中较为详细地介绍了三维定量构效关系中广泛应用的CoMFA方法.综述了定量构效关系在环境污染物分析以及在农药、医药设计中的应用,并对定量构效关系研究的发展趋势进行了展望.     

基于遗传算法的RR抑制剂的二维定量构效关系研究

利用遗传算法,结合多元线性回归和交叉验证方法,对一系列Schiff碱类核糖核苷酸还原酶抑制剂作了二维定量构效关系的研究.计算得到了一组效果较好的定量构效关系模型(R2、Rcv2最高分别可达0.909和0.883).模型不仅具有良好的回归能力,而且还具有良好的预测能力.同时,通过分析在遗传优化过程中分子参数出现的频度,还得到了可能对活性影响较大的几个重要分子参数,它们分别是水/辛醇分配系数(ALogP98)、指示因子(Ⅰ)以及电性拓扑态指数(S_sOH).对该类抑制剂的设计和改造提供了指导.     

抗糖尿病新药熔点的定量构效关系研究

为了研究新的抗糖尿病药物的构效关系，定义并计算了多取代香豆素磺酰脲类化合物的原子特征值最，利用量子化学计算方法构建了新的拓扑指数T和基团参数N，基于多元回归技术研究了对这种降血糖药物的熔点作出精确估算的定量构效关系，得到的二元回归方程为：mp=-6．3931T＋107．4257N＋260．0809，T和N不仅对这些化合物具有较好的结构选择性，而且与其熔点具有较好的相关性。为了检验模型的稳健性和预测能力，还进行了留一法交互校验。     

用比较分子力场和比较分子相似性指数分析方法对氮蒽类化合物抗癌活性的三维定量构效关系研究

用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关系的研究,对模型中的一些参数进行了优化以期得到最好的三维定量构效关系模型,优化结果显示用CoMSIA构建的模型优于用CoMFA构建的模型.通过CoMSIA分析,用训练集所建立的模型有较好的统计性(20个化合物,q2=0.666,r2=0.916),测试集化合物的预测活性与实验值有很好的一致性.本文还给出了主要分子力场的等势线图.     

一个新的拓扑指数用于复杂化合物热容的预测

本文首先通过对分子图的顶点和边着色得到染色分子图,借助于相对键长和点价来分别代替拓扑距离和顶点度并结合分子图的邻接和距离矩阵提出了一个用于表征含多重键,杂原子化合物的拓扑指数Xu。将该拓扑指数用于烷烃、不饱和链烃、芳烃及含硫化合物的热容的预测。得到了良好的结果,计算值与实验值相当一致。该指数可望在QSPR/QSAR研究中作为一个有用的分子参数而得到推广应用。     

拓扑-量子方法对单取代烷烃折光率的定量研究

从影响分子折光率的结构因素出发,提出了一个6参数QSPR模型,该模型对203个单取代烷烃RX(X=SH、OH、NH2、Cl、Br和I)分子折光率的预测误差仅为0.008 3.此外,对所得到的模型进行了合理的解释.该模型所采用的参数是由拓扑-量子矩阵方法提取的,兼有拓扑指数计算速度快的长处和量子化学参数物理意义明确的优点,为理解分子结构-折光率之间的关系提供了一个新的视野和思路.表1,参10.     

定量结构-性质关系(QSPR)研究 --利用新的分子拓扑指数预测烯烃热力学函数

基于分子键距矩阵和键联矩阵提出一种新的分子拓扑指数γ，计算43种烯烃的γ值并与其热力学函数及沸点相关联，结果表明，该拓扑指数具有很好的性质相关性和结构选择性。     

定量构性关系(QSPR)研究:一种新分子拓扑指数Y

基于分子距离与邻接矩阵提出了一种新颖表征有机物结构特征的分子拓扑指数Y。对饱和烷烃（n≤9，共74个分子）的计算结果及其与物性相关研究表明，与现有某些拓扑指数比较具有良好的结构选择性（简并度较小）和QSPR规律性。     

定量构性关系研究——利用新分子拓扑指数预测烷烃热力学函数

基于分子的键距矩阵和键联矩阵提出一种新的分子拓扑指数Y.利用 Y计算了烷烃 ( 2～ 2 0个碳原子共 97个分子 )的 5种热力学性质 .结果表明 ,它比现有的拓扑指数具有更好的结构选择性和性质相关性     

有机物气相色谱保留指数的QSPR研究

首先通过对分子图的顶点和边同时着色得到染色分子图.借助于相对键长和点价δ_i 来分别代替拓扑距离以及顶点度v_i ,并结合邻接矩阵和距离矩阵提出了一个用于表征含多重键、杂原子化合物的拓扑指数 Xu,研究了该拓扑指数与烷烃、环烷烃、醇、酮和酯的气相色谱保留指数相关性, 结果表明 Xu 指数与上述理化性质均具有良好的相关性,肯定了本方法的合理性和有效性,该指数可望在定量结构- 性质/ 活性关系( QSPR / QSAR)研究中作为一个有用的分子参数而获得广泛应用.     

一个新的拓扑指数用于饱和烷烃的QSPR研究

在分子图的邻接矩阵和距离矩阵的基础上提出了一个新的拓扑指数Sv,该拓扑指数与饱和烷烃的正常沸点具有较好的性质相关性,且易于计算,并且对饱和烷烃有较好的结构区分能力。     

脂肪胺物理化学性质的分子拓扑研究

在分子拓扑学理论基础上，运用图论方法，基于分子距离矩阵提出一种新的分子拓扑指数Ty，计算24种脂肪胺的Ty值并与其物理化学性质相关联，结果表明，具有良好的性质相关性和结构选择性、     

量子拓扑方法对硫醇的定量构效关系研究

应用密度泛函理论(DFT),在B3LYP/6-31+G(d)水平上对20硫醇的分子结构进行几何优化和量化计算.将量子化学计算的部分结果引入分子的拓扑结构中,构建新型分子量子拓扑指数(QT),与计算所得的量化参数Gibbs自由能(G)、恒容摩尔热容(CV)一起描述硫醇的量子拓扑规律.QT指数不仅能有效地区分硫醇的分子结构,而且能较好的描述硫醇理化性质及色谱保留指数的变化规律.大部分所建模型的相关系数都大于0.99.本文对构建的模型采用留一法(LOO)进行验证,结果表明所构建的模型稳健、合理、有效,该方法有望在物质的QSPR/QSAR研究中得到广泛的应用.