分子标记辅助选育香型软米水稻“上师大18号”

以香型软米水稻"青香软粳"作为软米基因供体亲本,以香型非软米水稻"光明粳2号"作为转育亲本,结合软米基因分子标记辅助筛选,成功培育出香型软米水稻"上师大18号"."上师大18号"水稻全生育期约148 d,早于"青香软粳"水稻约5 d."上师大18号"水稻主要农艺性状和产量性状都与"光明粳2号"接近."上师大18号"稻米直链淀粉质量分数为8. 2%,符合软米特征."上师大18号"水稻的成功选育有助于上海地区推广生育期相对较短的香型软米水稻.     

抗条纹叶枯病基因qSTV11~(KAS)新分子标记建立及23种香型水稻qSTV11~(KAS)基因的调查分析

根据抗条纹叶枯病品种"秀水123"与易感品种"日本晴"抗条纹叶枯病基因qSTV11~(KAS)在距离起始密码子第一个脱氧核苷酸+640处的差异,建立了一种能够更便于区分qSTV11~(KAS)基因型的CAPS(BtgⅠ)分子标记及检测方法,并对23种香型水稻的qSTV11~(KAS)基因进行调查分析.结果表明,CAPS(BtgⅠ)分子标记可以用来区别水稻是否含有抗条纹叶枯病基因qSTV11~(KAS)及基因型;在检测的23种香稻中,仅有"中香1号"、"青香软粳"和"泰国香稻"3种水稻含有与"秀水123"相同的qSTV11~(KAS)抗性基因.本研究为今后分子标记辅助选育抗条纹叶枯病香型水稻新品种和筛选条纹叶枯病新的抗性基因资源应用奠定了基础.     

稻瘟病抗性基因 Pi63 启动子4 个构建体的表达及抗性分析

利用农杆菌介导法获得带有不同长度启动子区域的稻瘟病抗性基因Pi63全长基因的转基因水稻,并采用实时荧光定量PCR方法鉴定了T1代阳性植株的基因拷贝数,进一步测定了单拷贝转基因植株在接种稻瘟病菌前后Pi63基因的表达量变化.结果表明:接种后4个分别带有不同长度启动子的Pi63转基因植物T1代中Pi63基因的表达量均升高,其抗病相关的顺式作用元件处于P1与P2中间的区域,P0到P1的区域存在负调控元件.此结果可为进一步揭示水稻稻瘟病抗性基因Pi63的分子机理奠定基础.     

一个新的水稻幼苗黄叶突变体的遗传分析及其基因的初步定位

在60Coγ射线辐照的水稻突变体库中,发现了一个以粳稻品种日本晴为遗传背景的幼苗叶色黄化突变体syl11(seedling yellow leaf 11).与野生型相比,突变体幼苗第二和第三叶表现黄色,在其完全展开之前叶片自其顶端开始转绿,长到四叶期其叶色恢复正常;并且该突变体syl11幼苗黄色叶片光合色素含量明显下降.遗传分析表明,该突变体的遗传性状由1对隐性核基因控制.本研究以培矮64S/syl11的F2代突变型植株作为定位群体,应用微卫星(SSR)分子标记以及新发展的InDel分子标记,将基因syl11定位在水稻第11号染色体长臂上的RM26652和处于着丝粒附近的ID11974分子标记之间,其遗传距离分别为0.5 cM和0.7 cM.     

FSHβ和ITGB1基因多态性与母猪繁殖性状的关联性分析

为探讨FSHβ和ITGB1基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,本研究采用PCR-RFLP技术对939头大白猪群体中进行FSHβ和ITGB1基因的多态性检测,并对不同胎次不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、木乃伊数、死胎数、窝重等繁殖性状进行关联性分析。结果显示:在试验大白猪群体中,FSHβ和ITGB1均具有中度多态性,FSHβ基因型频率为ABBBAA,优势基因为B等位基因。ITGB1基因型频率在大白猪中为CTCCTT,优势基因为C基因。FSHβ基因在头胎的死胎性状上AB基因型显著低于BB型0.15头/胎(P0.05),而在窝重性状上AB基因型显著高于BB基因型0.69kg/胎(P0.05),在其他胎次中各繁殖性状在不同基因型间差异不显著(P0.05)。ITGB1基因在头胎的死胎性状中TT基因型显著低于CC型,在二胎的窝重性状上CC型显著高于CT和TT型,分别高出0.88和0.97 kg/胎(P0.05);在三胎健仔数和窝重性状中CC型均显著高于CT型(P0.05),由此可见CC基因型为ITGB1在繁殖性状中的优势基因型。合并基因型分析结果发现:头胎的大白猪FSHβ-ITGB1合并基因型中最优分子标记组合为AATT,经产二胎、三胎次大白猪繁殖性状FSHβ-ITGB1最优分子标记组合为BBCC。     

水稻淀粉合成酶基因来源与稻米蒸煮和食味品质的相关性分析

为研究水稻淀粉合成酶基因对稻米蒸煮和食味品质性状的影响,利用根据籼粳基因组序列差异设计的Wx、SssⅠ、SssⅡa基因的分子标记检测来自“南京11”和“Balilla”的DH群体共130个株系,结果表明,Wx基因位点决定AAC的变异,并在控制GC变异时起主要作用;SssⅡa基因位点是决定GT变异的主要因素。3个基因位点的分子标记可为稻米蒸煮和食味品质的筛选和改良提供便捷的工具。     

利用分子标记分析22种上海市重要水稻10个食味品质相关基因的基因型

稻米食味品质改良是目前水稻育种的重要研究方向之一.明确不同水稻食味品质基因型,可为优质水稻育种研究的亲本选择提供依据.本研究利用分子标记检测技术,对22个目前上海市种植的重要常规水稻和杂交稻亲本食味品质基因的基因型进行检测.结果发现,"紫香糯861"水稻含有相对较多不良食味品质基因型.3种杂交稻父本,"湘晴"、"R44"和"繁14"的食味品质基因型比这3种杂交稻母本,"寒风A"、"秋风A"和"申9A"以及其他常规稻有欠缺.从蜡质基因多态性分析显示,在本研究选用的22种水稻中,2个为糯稻、20个为粳稻,但其中有4个为软米型粳稻;在16个非软米型粳稻中,"宝农34"、"金丰"和"银香18"是具有相对最好食味品质基因型的水稻品种.     

一个新的水稻矮秆突变体sd-sl的遗传与基因定位研究

新的矮秆基因的发掘、研究和利用对水稻育种和植物生长发育机制研究有重要的作用.用60Coγ射线辐照粳稻9522,获得一个能稳定遗传的突变体.该突变体表型为株高较野生型矮,叶片短而微卷.将该突变体与籼稻广陆矮杂交,F2代呈3∶1分离,说明该突变体受隐性单基因控制.通过InDel分子标记对F2代分离群体进行遗传定位,将该基因定位于第6染色体InDel标记OS604附近.随后又发展了多对有多态性的InDel分子标记,将该基因座位精细定位在InDel标记XL6-6和XL6-1之间,AP003490和AP005619上,两个引物之间的物理距离为118 kb.本研究为该克隆基因及其作用机理的探究奠定了基础.     

Tup1基因缺失对酿酒酵母耐高糖性状的影响

研究Tup1基因对酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）细胞耐高糖性状的影响。利用Cre/loxP系统对单倍体细胞中的转录因子Tup1基因进行敲除,单倍体细胞复倍后研究基因缺失菌株的性状变化。结果表明,Tup1基因缺失虽然减弱了菌株的呼吸能力,但却增强了菌株在高浓度葡萄糖培养基中的生长和发酵能力。Tup1基因可能通过调节酿酒酵母细胞呼吸强度来调控细胞的高糖应激反应。     

新疆绵羊品种Ⅰ型IF基因的遗传多态性分析

为了筛选与绵羊羊毛性状相关联的分子标记,探讨Ⅰ型角蛋白中间丝蛋白基因多态位点在不同绵羊品种中的分布规律.采用PCR-RFLP技术对新疆6个绵羊品种Ⅰ型IF基因第1外显子的多态性进行了检测.结果显示,Ⅰ型IF基因第1外显子经MSP I 酶切后产生2种等位基因和3种基因型,呈现多态.各绵羊品种之间基因型频率和等位基因频率差异不显著(P＞0.05).和田羊和巴音布鲁克羊群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).平均He和PIC分别为0.2374和0.2079.     

Transformation of japonica rice with<Emphasis Type="Italic">RHL</Emphasis> gene and salt tolerance of the transgenic rice plant

Overexpression of the yeastHAL2 gene increases salt tolerance of yeast and plant. RiceHAL2-like (RHL) gene was introduced into ajaponica rice cultivar HJ19 withAgrobacterium tumefaciens-mediated transformation. Transgenic plants in R₀ generation were selected on the principle of GUS-positive,RHL gene PCR-positive and normal growth. Hygromycin-resistant plants of some transgenic lines in R₁ generation increased salt tolerance during the seedling and booting stage, being less damaged in the cytomembrane and stronger in leaf tissue viability under salt stress during booting period. Southern analysis of transgenic lines tolerant to salt in R₁ generation showed that theRHL gene expression cassette had been successfully integrated into rice genome. Moreover, gene engineering breeding methodology and really salt-tolerant rice cultivar were discussed.     

一个新水稻低温敏感叶色突变体tcm11的鉴定及基因定位

对粳稻"嘉花1号"经~(60)Coγ诱变处理获得的稳定遗传低温敏感叶色突变体tcm11(thermo-sensitive chloroplast mutant 11)进行了表型鉴定与遗传分析.在20℃条件下,该突变体三叶期之前幼苗均表现为黄色,光合色素含量明显下降,叶绿体发育不完整,从第4叶开始逐渐转为浅黄绿色直至最后死亡.而在32℃条件下,其表型与野生型相比没有明显差异,具有低温敏感属性.通过对培矮64S与tcm11杂交的F_2代分离群体进行遗传分析,发现该低温敏感突变体性状是受单个隐性核基因(tcm11)控制,利用图位克隆技术对tcm11进行定位,将其定位在第11号染色体的InDel分子标记ID13252与SSR分子标记MM1361之间一个约1 566 kb的区域内.这也为后续的研究奠定了基础.     

一个水稻苗期白化致死突变体asl6的鉴定及其基因定位

经60Coγ诱变处理粳稻"嘉花1号"得到一个稳定遗传苗期白化致死突变体asl6(albino seedling lethality 6).与野生型(WT)相比,该突变体从发芽出苗起一直表现白化,四叶期逐渐死亡,叶合色素含量几乎没有且没有完整的叶绿体结构.通过qRT-PCR分析发现,与叶绿体发育、叶绿素合成及光合作用相关的基因表达量明显下调.对利用asl6突变体与"培矮64S"杂交获得的F2代分离群体进行遗传分析,发现该突变表型受单个隐性核基因控制.利用图位克隆技术将该asl6基因定位于第2号染色体的InDel分子标记ID31982与SSR分子标记MM5712之间约293 kb的区域内.目前,该范围内没有叶色相关基因的报道,可能为一新的调控水稻叶绿体发育的基因.     

Identification of a novel tillering dwarf mutant and fine mapping of the TDDL（T） gene in rice （Oryza sativa L.）

Rice plant architecture is an important agronomic trait that affects the grain yield. To understand the molecular mechanism that controls plant architecture, a tillering dwarf mutant with darker-green leaves derived from an indica cultivar IR64 treated with EMS is characterized. The mutant, designated as tddl（t）, is nonallelic to the known tiilering dwarf mutants. It is controlled by one recessive nuclear gene, TDDL（T）, and grouped into the dn-type dwarfism according to Takeda＇s definition. The dwarfism of the mutant is independent of gibberellic acid based on the analyses of two GA-mediated processes. The independence of brassinosteroid （BR） and naphthal-3-acetic acid （NAA） of the tddl（t） mutant, together with the decreased size of parenchyma cells in the vascular bundle, indicates that the TDDL（7） gene might participate in another hormone pathway. TDDL（T） is fine mapped within an 85.51 kb region on the long arm of rice chromosome 4, where 20 ORFs are predicted by RiceGAAS （http：//ricegaas.dna.affrc. go.jp/rgadb/）. Further cloning of TDDL（T） will benefit both marker assisted selection （MAS） of plant architecture and dissection of the molecular mechanism underlying tillering dwarf in rice.     

Introduction of antisensewaxy gene into main parent lines ofindica hybrid rice

Amylose content in rice endosperm is one of the key determinants of rice eating and cooking quality, and the poor quality ofindica hybrid rice is closely related to the high amylose level in rice grains. In order to improve the grain quality of theindica hybrid rice by genetic engineering, an antisense fragment of ricewaxy gene, driven by the 5′-franking sequences of the ricewaxy gene, was successfully introduced into three major parent lines ofindica hybrid rice, all contain a high amylose level in the grains, viaAgrobacterium, and more than 100 hygromycinresistant plants were regenerated. The analysis of PCR amplification and Southern blots indicated that the T-DNA containing the antisensewaxy gene had been integrated into the genome of transgenic rice plants. Most of the primary transgenic rice plants grew normally, and the mature seeds from these transgenic plants were performed for analysis of the amylose content. The results showed that the amylose content in the endosperm of some grains was reduced and the lowest reached 7.02% in one homozygous transgenic line, 72.4% lower than that of the wild type. The influence of the altered amylose content on the gelatinization temperature and gel consistency was also observed in several homozygous transgenic rice plants. The two authors contributed equally to this work.     

万安玻璃红鲤鱼PKR的克隆鉴定与系统进化分析

本研究以万安玻璃红鲤鱼为材料,通过同源克隆的方法克隆了万安玻璃红鲤鱼双链RNA激活的蛋白激酶（PKRCcvwPKR）,并首次克隆到CcvwPKR的剪接异构体。CcvwPKR全长为2145 bp,编码714个氨基酸,CcvwPKR剪接异构体全长1431 bp,编码476个氨基酸。CcvwPKR的剪接异构体是CcvwPKR第477个密码子的G突变为T（gaa477taa）,从而使得CcvwPKR的翻译提前终止。氨基酸序列比对和空间结构SMART预测显示,CcvwPKR和CcvwPKR剪接异构体都含有三个双链RNA结合模体（dsRBM）,CcvwPKR剪接异构体缺失PKR的C端的激酶结构域。系统进化分析表明,万安玻璃红鲤鱼PKR在进化上与鲤鱼和鲫鱼密切相关。万安玻璃红鲤鱼和目前已有研究的鲤科鱼类PKR一样,分子结构都含有三个dsRBM,三个dsRBM使得其具有更强的结合dsRNA的作用,推测可能与其较强的抗病能力有关。     

Characterization of the flagellar biosynthesis regulatory geneflbD inAzospirillum brasilense

A flagellar gene cluster fragment includingflbD ofAzospirillum brasilense was cloned and sequenced. TheflbD mutant strain was found to be nonmotile—losing both polar and lateral flagella (Fla⁻Laf⁻). Motility and flagella were regained by complementation with plasmid-borne multicopyflbD, but altered with larger swarming circle and fewer lateral flagella on the semisolid plate. This result indicated that FlbD plays an important role in the regulation of both polar and lateral flagellar biosynthesis inA. brasilense.